MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017802	ATT	2	6	10	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858807
2	NC_017802	TAA	2	6	53	58	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858807
3	NC_017802	TAT	2	6	63	68	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858807
4	NC_017802	TTG	2	6	130	135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858807
5	NC_017802	CAA	3	9	216	224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017802	TTA	2	6	240	245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017802	TGT	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017802	AAT	2	6	286	291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858808
9	NC_017802	ATT	2	6	358	363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858808
10	NC_017802	AAG	2	6	405	410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858808
11	NC_017802	GAA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858808
12	NC_017802	TAT	2	6	487	492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858808
13	NC_017802	TAT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858808
14	NC_017802	TAA	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858808
15	NC_017802	GTG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858809
16	NC_017802	TAT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
17	NC_017802	TGA	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858809
18	NC_017802	ATT	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
19	NC_017802	TAA	2	6	1068	1073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858809
20	NC_017802	TTA	2	6	1132	1137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
21	NC_017802	AGT	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858809
22	NC_017802	TAT	2	6	1149	1154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
23	NC_017802	AAT	2	6	1161	1166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858809
24	NC_017802	TAT	2	6	1326	1331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
25	NC_017802	AAG	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017802	ATA	2	6	1502	1507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017802	AAT	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858810
28	NC_017802	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858810
29	NC_017802	ATT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858810
30	NC_017802	AGA	2	6	1803	1808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858810
31	NC_017802	ATT	2	6	1812	1817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858810
32	NC_017802	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858810
33	NC_017802	ATT	2	6	2004	2009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858810
34	NC_017802	AGA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858810
35	NC_017802	TAA	2	6	2074	2079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017802	AAT	2	6	2089	2094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017802	TAG	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.