MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017801	TTG	2	6	40	45	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017801	TTA	2	6	129	134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858846
3	NC_017801	AAT	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858846
4	NC_017801	ATT	2	6	247	252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858846
5	NC_017801	GAA	2	6	365	370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858846
6	NC_017801	CTA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858846
7	NC_017801	ATA	2	6	616	621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858846
8	NC_017801	TAC	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858847
9	NC_017801	TTA	2	6	744	749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858847
10	NC_017801	TAA	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
11	NC_017801	GAG	2	6	960	965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858847
12	NC_017801	ATA	2	6	1175	1180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
13	NC_017801	AAT	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
14	NC_017801	AAT	2	6	1327	1332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
15	NC_017801	TTA	2	6	1333	1338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858847
16	NC_017801	ATA	2	6	1361	1366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
17	NC_017801	AAG	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017801	GAC	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858848
19	NC_017801	ATA	2	6	1465	1470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858848
20	NC_017801	AAT	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858848
21	NC_017801	TGA	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858848
22	NC_017801	GAT	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858848
23	NC_017801	ATA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858848
24	NC_017801	GAT	2	6	1594	1599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858848
25	NC_017801	TAA	2	6	1605	1610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858848
26	NC_017801	ATT	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858848
27	NC_017801	ATT	2	6	2042	2047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017801	TTG	2	6	2070	2075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017801	AAC	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017801	GTA	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017801	TTA	2	6	2222	2227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017801	GTT	2	6	2268	2273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017801	TAT	3	9	2282	2290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017801	AGG	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017801	ATA	2	6	2341	2346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.