MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017796	T	6	6	241	246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017796	T	6	6	270	275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017796	T	7	7	523	529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017796	T	7	7	556	562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017796	A	6	6	599	604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017796	T	6	6	686	691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017796	N	142	142	734	875	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017796	A	6	6	910	915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017796	T	6	6	953	958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017796	T	6	6	1186	1191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017796	A	7	7	1194	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017796	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	386858761
13	NC_017796	A	6	6	1252	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	386858761
14	NC_017796	T	6	6	1351	1356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017796	T	6	6	2096	2101	0 %	100 %	0 %	0 %	386858763
16	NC_017796	A	6	6	2675	2680	100 %	0 %	0 %	0 %	386858764
17	NC_017796	T	6	6	2718	2723	0 %	100 %	0 %	0 %	386858764
18	NC_017796	T	6	6	2849	2854	0 %	100 %	0 %	0 %	386858764
19	NC_017796	C	6	6	3193	3198	0 %	0 %	0 %	100 %	386858765
20	NC_017796	N	1395	1395	3618	5012	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017796	A	6	6	5014	5019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017796	T	6	6	5215	5220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017796	T	7	7	5637	5643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017796	C	6	6	5979	5984	0 %	0 %	0 %	100 %	386858767
25	NC_017796	N	299	299	6095	6393	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017796	T	6	6	6516	6521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017796	A	7	7	6567	6573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017796	A	7	7	6594	6600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017796	T	6	6	7204	7209	0 %	100 %	0 %	0 %	386858768
30	NC_017796	T	7	7	7735	7741	0 %	100 %	0 %	0 %	386858768
31	NC_017796	A	7	7	7792	7798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017796	A	7	7	7834	7840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017796	N	246	246	8698	8943	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017796	T	6	6	9272	9277	0 %	100 %	0 %	0 %	386858770
35	NC_017796	A	6	6	9321	9326	100 %	0 %	0 %	0 %	386858770
36	NC_017796	T	6	6	9443	9448	0 %	100 %	0 %	0 %	386858771
37	NC_017796	T	6	6	9536	9541	0 %	100 %	0 %	0 %	386858771
38	NC_017796	T	7	7	10596	10602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017796	A	8	8	10626	10633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017796	C	6	6	10695	10700	0 %	0 %	0 %	100 %	386858773
41	NC_017796	A	6	6	10897	10902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017796	T	6	6	11059	11064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017796	A	7	7	11378	11384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017796	A	6	6	11485	11490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017796	T	6	6	11641	11646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017796	T	6	6	11648	11653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017796	A	7	7	11680	11686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017796	A	6	6	11693	11698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017796	T	6	6	11831	11836	0 %	100 %	0 %	0 %	386858774
50	NC_017796	N	650	650	12710	13359	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017796	T	6	6	13500	13505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017796	T	7	7	13511	13517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017796	A	7	7	13545	13551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017796	T	6	6	13593	13598	0 %	100 %	0 %	0 %	386858776
55	NC_017796	T	6	6	13633	13638	0 %	100 %	0 %	0 %	386858776
56	NC_017796	T	6	6	13795	13800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017796	A	6	6	13872	13877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017796	A	6	6	13882	13887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017796	A	6	6	14056	14061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017796	T	8	8	14155	14162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017796	A	6	6	14206	14211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017796	T	6	6	14530	14535	0 %	100 %	0 %	0 %	386858777
63	NC_017796	A	8	8	15462	15469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017796	A	7	7	15535	15541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017796	A	6	6	15615	15620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017796	T	6	6	15870	15875	0 %	100 %	0 %	0 %	386858778
67	NC_017796	T	6	6	15878	15883	0 %	100 %	0 %	0 %	386858778
68	NC_017796	T	8	8	16367	16374	0 %	100 %	0 %	0 %	386858779
69	NC_017796	T	6	6	16404	16409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017796	T	6	6	16422	16427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017796	A	6	6	16455	16460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017796	A	7	7	16494	16500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017796	T	6	6	17300	17305	0 %	100 %	0 %	0 %	386858780
74	NC_017796	T	7	7	17338	17344	0 %	100 %	0 %	0 %	386858780
75	NC_017796	N	1000	1000	17509	18508	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017796	A	6	6	18856	18861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017796	T	6	6	18955	18960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017796	T	6	6	19050	19055	0 %	100 %	0 %	0 %	386858781
79	NC_017796	T	6	6	19074	19079	0 %	100 %	0 %	0 %	386858781
80	NC_017796	T	8	8	19160	19167	0 %	100 %	0 %	0 %	386858781
81	NC_017796	T	6	6	19425	19430	0 %	100 %	0 %	0 %	386858782
82	NC_017796	T	7	7	19532	19538	0 %	100 %	0 %	0 %	386858782
83	NC_017796	A	7	7	19588	19594	100 %	0 %	0 %	0 %	386858782
84	NC_017796	T	8	8	19823	19830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017796	A	6	6	19876	19881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017796	A	6	6	19986	19991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017796	A	6	6	19997	20002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_017796	T	6	6	20185	20190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017796	A	6	6	21142	21147	100 %	0 %	0 %	0 %	386858783
91	NC_017796	T	6	6	21253	21258	0 %	100 %	0 %	0 %	386858784
92	NC_017796	T	6	6	21335	21340	0 %	100 %	0 %	0 %	386858784
93	NC_017796	T	7	7	21354	21360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017796	T	8	8	21379	21386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017796	T	6	6	21426	21431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017796	A	7	7	21453	21459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017796	A	6	6	21474	21479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017796	T	7	7	21995	22001	0 %	100 %	0 %	0 %	386858785
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100	NC_017796	T	6	6	22421	22426	0 %	100 %	0 %	0 %	386858785
101	NC_017796	A	6	6	22721	22726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017796	A	6	6	22964	22969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017796	T	6	6	23092	23097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017796	T	6	6	23158	23163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_017796	T	8	8	23974	23981	0 %	100 %	0 %	0 %	386858786
109	NC_017796	A	6	6	24131	24136	100 %	0 %	0 %	0 %	386858787
110	NC_017796	A	7	7	24241	24247	100 %	0 %	0 %	0 %	386858787
111	NC_017796	A	7	7	24436	24442	100 %	0 %	0 %	0 %	386858787
112	NC_017796	A	7	7	24595	24601	100 %	0 %	0 %	0 %	386858787
113	NC_017796	T	9	9	24739	24747	0 %	100 %	0 %	0 %	386858787
114	NC_017796	A	6	6	24902	24907	100 %	0 %	0 %	0 %	386858788
115	NC_017796	T	6	6	24915	24920	0 %	100 %	0 %	0 %	386858788
116	NC_017796	T	6	6	25000	25005	0 %	100 %	0 %	0 %	386858788
117	NC_017796	A	6	6	25025	25030	100 %	0 %	0 %	0 %	386858788
118	NC_017796	T	6	6	25082	25087	0 %	100 %	0 %	0 %	386858788
119	NC_017796	A	6	6	25116	25121	100 %	0 %	0 %	0 %	386858788
120	NC_017796	A	7	7	25155	25161	100 %	0 %	0 %	0 %	386858788
121	NC_017796	T	6	6	25513	25518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017796	A	6	6	25873	25878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017796	T	6	6	25912	25917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017796	A	6	6	25929	25934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017796	T	7	7	26234	26240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017796	A	7	7	26286	26292	100 %	0 %	0 %	0 %	386858791
127	NC_017796	A	7	7	27252	27258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017796	A	6	6	27326	27331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017796	T	6	6	27427	27432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017796	A	7	7	27472	27478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017796	A	6	6	27712	27717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017796	A	7	7	27764	27770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017796	A	6	6	27850	27855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017796	A	6	6	28132	28137	100 %	0 %	0 %	0 %	386858792
135	NC_017796	A	7	7	28169	28175	100 %	0 %	0 %	0 %	386858792
136	NC_017796	A	6	6	28456	28461	100 %	0 %	0 %	0 %	386858792
137	NC_017796	A	6	6	28491	28496	100 %	0 %	0 %	0 %	386858792

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.