MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017795	ATA	2	6	66	71	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858841
2	NC_017795	ATA	2	6	153	158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858841
3	NC_017795	ATT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858841
4	NC_017795	TTA	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858841
5	NC_017795	ATT	2	6	372	377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017795	AAT	2	6	486	491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017795	AGA	2	6	497	502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017795	TAA	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017795	TGA	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017795	ATC	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017795	AGG	2	6	793	798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017795	GAA	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017795	AGA	2	6	815	820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
14	NC_017795	AAG	2	6	823	828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
15	NC_017795	AAT	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858842
16	NC_017795	TGA	4	12	901	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
17	NC_017795	GAA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
18	NC_017795	GTG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858842
19	NC_017795	AGA	2	6	1139	1144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
20	NC_017795	GAA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
21	NC_017795	GCT	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858842
22	NC_017795	ATG	3	9	1243	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
23	NC_017795	CTG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858842
24	NC_017795	TTG	2	6	1345	1350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858842
25	NC_017795	GAT	2	6	1449	1454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
26	NC_017795	AGA	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
27	NC_017795	AGC	2	6	1478	1483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858842
28	NC_017795	AGG	2	6	1576	1581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858842
29	NC_017795	GCT	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858842
30	NC_017795	TAC	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858842
31	NC_017795	ATG	2	6	1630	1635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
32	NC_017795	AGC	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858842
33	NC_017795	AAG	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
34	NC_017795	ATG	2	6	1729	1734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
35	NC_017795	AGC	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858842
36	NC_017795	ATT	2	6	1919	1924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017795	ATT	2	6	1945	1950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017795	AAG	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.