MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017794	TAGCAA	2	12	152	163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017794	TAGCAT	2	12	326	337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858926
3	NC_017794	TCTCCA	2	12	706	717	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386858927
4	NC_017794	TACTCC	2	12	1009	1020	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386858928
5	NC_017794	TGCTAA	2	12	1102	1113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858928
6	NC_017794	GTCTTA	2	12	2066	2077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386858929
7	NC_017794	TAATGT	2	12	3096	3107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017794	AAATAA	2	12	3689	3700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017794	CAAAAA	2	12	5249	5260	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017794	CATCAC	2	12	6624	6635	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858934
11	NC_017794	AGCAAT	2	12	7284	7295	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386858935
12	NC_017794	TAAAAA	2	12	11178	11189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017794	TATTTT	2	12	13490	13501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386858941
14	NC_017794	TTTATA	2	12	14671	14682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017794	TATAAT	2	12	14832	14843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017794	AAAGTA	2	12	15092	15103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386858943
17	NC_017794	ATTGTA	2	12	15817	15828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017794	TAGATA	2	12	15902	15913	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017794	TTTTGT	2	12	15974	15985	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017794	ATGGTG	2	12	16308	16319	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017794	ATGCAA	2	12	17143	17154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386858945

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.