MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017794	TCT	2	6	22	27	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017794	TGAT	2	8	30	37	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017794	T	6	6	73	78	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017794	A	6	6	98	103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017794	AC	3	6	112	117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017794	ATA	2	6	134	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017794	TAGCAA	2	12	152	163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017794	ATAAA	2	10	164	173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017794	ATAA	2	8	178	185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017794	TTTTA	2	10	227	236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017794	AT	3	6	250	255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017794	AT	3	6	266	271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017794	TAGCAT	2	12	326	337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858926
14	NC_017794	TGC	2	6	348	353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858926
15	NC_017794	CTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858926
16	NC_017794	TAT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858926
17	NC_017794	TAA	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858926
18	NC_017794	CAG	2	6	465	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858926
19	NC_017794	CAT	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858926
20	NC_017794	TCC	2	6	500	505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017794	T	6	6	579	584	0 %	100 %	0 %	0 %	386858927
22	NC_017794	CTG	3	9	641	649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858927
23	NC_017794	CTT	2	6	651	656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858927
24	NC_017794	CAG	2	6	665	670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858927
25	NC_017794	AGC	3	9	678	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858927
26	NC_017794	TCTCCA	2	12	706	717	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386858927
27	NC_017794	C	6	6	797	802	0 %	0 %	0 %	100 %	386858927
28	NC_017794	TTA	2	6	865	870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017794	TTAC	2	8	873	880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017794	AT	3	6	887	892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017794	CTGT	2	8	933	940	0 %	50 %	25 %	25 %	386858928
32	NC_017794	TAA	2	6	988	993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858928
33	NC_017794	TTTA	2	8	994	1001	25 %	75 %	0 %	0 %	386858928
34	NC_017794	TACTCC	2	12	1009	1020	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386858928
35	NC_017794	TGC	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
36	NC_017794	TCC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
37	NC_017794	TGCTAA	2	12	1102	1113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858928
38	NC_017794	CTG	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
39	NC_017794	TTG	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858928
40	NC_017794	CAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858928
41	NC_017794	CTC	3	9	1317	1325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
42	NC_017794	TGT	2	6	1330	1335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858928
43	NC_017794	CCT	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
44	NC_017794	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858928
45	NC_017794	CTG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
46	NC_017794	TAC	2	6	1513	1518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858928
47	NC_017794	TAA	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858928
48	NC_017794	AAG	2	6	1545	1550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858928
49	NC_017794	CTT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858928
50	NC_017794	TTGC	2	8	1584	1591	0 %	50 %	25 %	25 %	386858928
51	NC_017794	TACTT	2	10	1630	1639	20 %	60 %	0 %	20 %	386858928
52	NC_017794	AT	3	6	1704	1709	50 %	50 %	0 %	0 %	386858928
53	NC_017794	T	8	8	1713	1720	0 %	100 %	0 %	0 %	386858928
54	NC_017794	TTA	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
55	NC_017794	TCCT	2	8	1840	1847	0 %	50 %	0 %	50 %	386858928
56	NC_017794	CTC	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
57	NC_017794	TAT	2	6	1860	1865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
58	NC_017794	ATC	2	6	1877	1882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858928
59	NC_017794	ATT	2	6	1895	1900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
60	NC_017794	T	8	8	1904	1911	0 %	100 %	0 %	0 %	386858928
61	NC_017794	T	7	7	1936	1942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017794	CTT	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017794	T	6	6	1953	1958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017794	TCT	2	6	1974	1979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017794	TAA	2	6	2020	2025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017794	ATT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858929
67	NC_017794	CAG	2	6	2049	2054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
68	NC_017794	GTCTTA	2	12	2066	2077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386858929
69	NC_017794	T	6	6	2081	2086	0 %	100 %	0 %	0 %	386858929
70	NC_017794	ATCA	2	8	2092	2099	50 %	25 %	0 %	25 %	386858929
71	NC_017794	CAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
72	NC_017794	AGC	2	6	2140	2145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
73	NC_017794	CAA	2	6	2154	2159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
74	NC_017794	CAG	3	9	2160	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
75	NC_017794	CAA	2	6	2205	2210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
76	NC_017794	TAG	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858929
77	NC_017794	CAA	2	6	2286	2291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
78	NC_017794	CAA	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
79	NC_017794	CCG	2	6	2313	2318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858929
80	NC_017794	CAA	2	6	2325	2330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
81	NC_017794	CAG	2	6	2331	2336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
82	NC_017794	TCACT	2	10	2406	2415	20 %	40 %	0 %	40 %	386858929
83	NC_017794	TAA	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017794	CAA	2	6	2517	2522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017794	A	6	6	2564	2569	100 %	0 %	0 %	0 %	386858930
86	NC_017794	CTC	2	6	2601	2606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858930
87	NC_017794	CAT	3	9	2638	2646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858930
88	NC_017794	CTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858930
89	NC_017794	CT	4	8	2682	2689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017794	CT	4	8	2692	2699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017794	CT	3	6	2704	2709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017794	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017794	TC	3	6	2736	2741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017794	CCT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017794	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017794	CTTT	2	8	2769	2776	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017794	A	6	6	2801	2806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017794	TAAC	2	8	2839	2846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017794	AAAAT	2	10	2856	2865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017794	CA	3	6	2877	2882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017794	TTTA	2	8	2934	2941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017794	TCTTA	2	10	2942	2951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017794	CAA	2	6	3011	3016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017794	CT	3	6	3051	3056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017794	TAATGT	2	12	3096	3107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017794	TAC	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017794	AAC	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858931
108	NC_017794	CCT	2	6	3193	3198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858931
109	NC_017794	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858931
110	NC_017794	CTA	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858931
111	NC_017794	GTA	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858931
112	NC_017794	GTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858931
113	NC_017794	CTA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858932
114	NC_017794	CTC	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858932
115	NC_017794	CAA	2	6	3474	3479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858932
116	NC_017794	TTC	2	6	3493	3498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017794	CTT	3	9	3546	3554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017794	TATT	2	8	3555	3562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017794	ATT	2	6	3568	3573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017794	TCTT	2	8	3600	3607	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017794	ATT	2	6	3616	3621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017794	CTTC	2	8	3628	3635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017794	TC	3	6	3634	3639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017794	TCCTT	2	10	3644	3653	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017794	T	6	6	3652	3657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017794	CAT	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017794	AAATAA	2	12	3689	3700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017794	CT	3	6	3714	3719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017794	CTG	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017794	CT	3	6	3787	3792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017794	CTT	2	6	3804	3809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017794	TCC	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017794	TAA	2	6	3868	3873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017794	N	168	168	3877	4044	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017794	CTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017794	CT	3	6	4108	4113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017794	CTT	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017794	TCC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017794	TAA	2	6	4189	4194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017794	TTTA	2	8	4195	4202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017794	TCA	3	9	4235	4243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017794	TTA	2	6	4244	4249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017794	C	7	7	4294	4300	0 %	0 %	0 %	100 %	386858933
144	NC_017794	CTG	3	9	4306	4314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
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283	NC_017794	TA	4	8	8271	8278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017794	ATCT	2	8	8345	8352	25 %	50 %	0 %	25 %	386858936
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