MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TA	3	6	554	559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017787	AT	3	6	720	725	50 %	50 %	0 %	0 %	386858867
3	NC_017787	TA	4	8	794	801	50 %	50 %	0 %	0 %	386858867
4	NC_017787	AG	3	6	1705	1710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017787	AT	3	6	2068	2073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017787	TA	3	6	2231	2236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017787	TA	3	6	2375	2380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017787	AT	3	6	2642	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	386858869
9	NC_017787	AT	3	6	2852	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	386858869
10	NC_017787	AG	3	6	4056	4061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017787	GA	3	6	4347	4352	50 %	0 %	50 %	0 %	386858870
12	NC_017787	TA	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	386858870
13	NC_017787	TA	3	6	4937	4942	50 %	50 %	0 %	0 %	386858872
14	NC_017787	AG	3	6	5272	5277	50 %	0 %	50 %	0 %	386858872
15	NC_017787	TA	4	8	5700	5707	50 %	50 %	0 %	0 %	386858873
16	NC_017787	AT	3	6	5776	5781	50 %	50 %	0 %	0 %	386858873
17	NC_017787	AG	3	6	5958	5963	50 %	0 %	50 %	0 %	386858873
18	NC_017787	TA	4	8	6147	6154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017787	AT	3	6	6613	6618	50 %	50 %	0 %	0 %	386858874
20	NC_017787	AG	3	6	6656	6661	50 %	0 %	50 %	0 %	386858874
21	NC_017787	AT	3	6	8069	8074	50 %	50 %	0 %	0 %	386858876
22	NC_017787	GA	3	6	8408	8413	50 %	0 %	50 %	0 %	386858876
23	NC_017787	AT	3	6	8476	8481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017787	CT	3	6	8534	8539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017787	TA	3	6	8567	8572	50 %	50 %	0 %	0 %	386858877
26	NC_017787	GA	3	6	8670	8675	50 %	0 %	50 %	0 %	386858877
27	NC_017787	AG	3	6	8696	8701	50 %	0 %	50 %	0 %	386858877
28	NC_017787	GA	3	6	8803	8808	50 %	0 %	50 %	0 %	386858877
29	NC_017787	AT	3	6	9090	9095	50 %	50 %	0 %	0 %	386858877
30	NC_017787	GA	3	6	10065	10070	50 %	0 %	50 %	0 %	386858878
31	NC_017787	AG	3	6	10091	10096	50 %	0 %	50 %	0 %	386858878
32	NC_017787	AG	3	6	10100	10105	50 %	0 %	50 %	0 %	386858878
33	NC_017787	TC	3	6	11219	11224	0 %	50 %	0 %	50 %	386858879
34	NC_017787	AG	3	6	11690	11695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017787	AG	3	6	11725	11730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017787	AG	3	6	11734	11739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017787	AG	3	6	13154	13159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017787	GA	3	6	13960	13965	50 %	0 %	50 %	0 %	386858882
39	NC_017787	GA	3	6	15741	15746	50 %	0 %	50 %	0 %	386858885
40	NC_017787	TA	3	6	16029	16034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017787	TA	4	8	16038	16045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017787	AG	3	6	16303	16308	50 %	0 %	50 %	0 %	386858886
43	NC_017787	AG	3	6	16321	16326	50 %	0 %	50 %	0 %	386858886
44	NC_017787	TA	3	6	16829	16834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017787	TA	3	6	18306	18311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017787	TA	3	6	18546	18551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017787	AC	3	6	19221	19226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017787	AT	3	6	20463	20468	50 %	50 %	0 %	0 %	386858889
49	NC_017787	TA	3	6	21254	21259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017787	AT	3	6	21765	21770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017787	AT	3	6	22227	22232	50 %	50 %	0 %	0 %	386858892
52	NC_017787	TC	3	6	22905	22910	0 %	50 %	0 %	50 %	386858892
53	NC_017787	TA	3	6	23178	23183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017787	CT	4	8	23839	23846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017787	CT	4	8	23849	23856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017787	CT	3	6	23861	23866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017787	AT	3	6	24448	24453	50 %	50 %	0 %	0 %	386858894
58	NC_017787	CA	3	6	25313	25318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017787	TA	3	6	25420	25425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017787	CT	3	6	26168	26173	0 %	50 %	0 %	50 %	386858896
61	NC_017787	TC	3	6	26516	26521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017787	AT	3	6	27957	27962	50 %	50 %	0 %	0 %	386858898
63	NC_017787	CT	5	10	30644	30653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017787	AT	3	6	30850	30855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017787	AT	3	6	30927	30932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017787	TC	3	6	32096	32101	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
67	NC_017787	CT	3	6	32106	32111	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
68	NC_017787	TC	3	6	32112	32117	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
69	NC_017787	CT	3	6	32118	32123	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
70	NC_017787	TC	3	6	32132	32137	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
71	NC_017787	CA	3	6	32225	32230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017787	TA	3	6	32268	32273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017787	CT	3	6	32314	32319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017787	CT	3	6	32413	32418	0 %	50 %	0 %	50 %	386858900
75	NC_017787	AT	4	8	35205	35212	50 %	50 %	0 %	0 %	386858902
76	NC_017787	AT	3	6	37665	37670	50 %	50 %	0 %	0 %	386858905
77	NC_017787	AT	3	6	37938	37943	50 %	50 %	0 %	0 %	386858906
78	NC_017787	CT	3	6	38624	38629	0 %	50 %	0 %	50 %	386858907
79	NC_017787	TC	3	6	38884	38889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017787	AT	3	6	39495	39500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017787	AC	3	6	39673	39678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017787	TA	4	8	40427	40434	50 %	50 %	0 %	0 %	386858911
83	NC_017787	AT	3	6	40734	40739	50 %	50 %	0 %	0 %	386858911
84	NC_017787	AT	3	6	40743	40748	50 %	50 %	0 %	0 %	386858911
85	NC_017787	AT	3	6	40888	40893	50 %	50 %	0 %	0 %	386858911
86	NC_017787	CA	3	6	41210	41215	50 %	0 %	0 %	50 %	386858912
87	NC_017787	TA	3	6	41589	41594	50 %	50 %	0 %	0 %	386858912
88	NC_017787	AT	3	6	42055	42060	50 %	50 %	0 %	0 %	386858913
89	NC_017787	AT	3	6	42349	42354	50 %	50 %	0 %	0 %	386858913
90	NC_017787	AT	3	6	43021	43026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017787	AT	3	6	43047	43052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017787	AT	3	6	43081	43086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017787	TA	3	6	43133	43138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017787	TA	3	6	43316	43321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017787	AT	3	6	43820	43825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017787	AT	3	6	44631	44636	50 %	50 %	0 %	0 %	386858918
97	NC_017787	CT	3	6	45097	45102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017787	TA	3	6	45118	45123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017787	AT	3	6	45475	45480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017787	AT	3	6	45619	45624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017787	AG	3	6	46574	46579	50 %	0 %	50 %	0 %	386858920
102	NC_017787	AG	3	6	46647	46652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017787	CT	3	6	46661	46666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017787	TA	3	6	46708	46713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017787	AG	3	6	46833	46838	50 %	0 %	50 %	0 %	386858921
106	NC_017787	AG	3	6	47111	47116	50 %	0 %	50 %	0 %	386858921
107	NC_017787	AT	3	6	47993	47998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017787	GA	3	6	48577	48582	50 %	0 %	50 %	0 %	386858923
109	NC_017787	AG	3	6	48587	48592	50 %	0 %	50 %	0 %	386858923

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.