MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TAATTT	2	12	75	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
2	NC_017787	AAATAA	2	12	1681	1692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017787	TTTATA	2	12	2196	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017787	TTATTT	2	12	3000	3011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017787	AAATAA	2	12	4032	4043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017787	TAAAAA	2	12	4212	4223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386858870
7	NC_017787	ATTGCA	2	12	4867	4878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858872
8	NC_017787	TAAAAA	2	12	5506	5517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386858873
9	NC_017787	TGAAGG	2	12	6412	6423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017787	ATGGTG	2	12	7465	7476	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386858876
11	NC_017787	AGGAGT	2	12	9643	9654	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386858877
12	NC_017787	CATTAT	2	12	14130	14141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858883
13	NC_017787	ATTAAA	2	12	15998	16009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017787	ATTAAT	2	12	18647	18658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017787	CTTTTC	2	12	18980	18991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017787	CATTAG	2	12	20523	20534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858889
17	NC_017787	CTTGAA	2	12	21002	21013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858889
18	NC_017787	CATCAC	2	12	22846	22857	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858892
19	NC_017787	TTAGCA	2	12	24357	24368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858894
20	NC_017787	CATTAG	2	12	25710	25721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858896
21	NC_017787	TCACCA	2	12	25892	25903	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858896
22	NC_017787	TCATTC	2	12	30616	30627	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017787	ATTTTC	2	12	38652	38663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858907
24	NC_017787	GCAACT	2	12	39087	39098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017787	ACACTT	2	12	39461	39472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017787	GTAATA	2	12	40417	40428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386858911
27	NC_017787	CGAAAA	2	12	40781	40792	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386858911
28	NC_017787	AAATTA	2	12	40876	40887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858911
29	NC_017787	ATTTAG	2	12	41461	41472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386858912
30	NC_017787	TTACAT	2	12	41895	41906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858913
31	NC_017787	AGATAA	2	12	46336	46347	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017787	CAGATG	2	12	47499	47510	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386858921
33	NC_017787	TATAAA	2	12	48312	48323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858922

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.