MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017783	ATT	2	6	69	74	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017783	TAA	2	6	78	83	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017783	ACA	2	6	149	154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017783	AAT	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017783	AAG	2	6	338	343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017783	AGT	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017783	TAT	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017783	CAT	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017783	ATT	2	6	417	422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017783	ATA	2	6	488	493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017783	TAT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858679
12	NC_017783	TGT	3	9	851	859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858679
13	NC_017783	AAC	2	6	860	865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858679
14	NC_017783	CTA	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858679
15	NC_017783	TAA	2	6	937	942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858679
16	NC_017783	TTA	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858679
17	NC_017783	TGT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858679
18	NC_017783	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017783	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017783	CTA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017783	TAA	2	6	1222	1227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017783	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017783	GCA	2	6	1468	1473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017783	ATA	3	9	1477	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017783	ATA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017783	CTA	2	6	1508	1513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017783	ATC	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858680
28	NC_017783	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858680
29	NC_017783	CTT	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858680
30	NC_017783	CAA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858680
31	NC_017783	AAT	2	6	1803	1808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858680
32	NC_017783	TAA	2	6	2091	2096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017783	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017783	TTC	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858681
35	NC_017783	CAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858681
36	NC_017783	TAT	2	6	2330	2335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858681
37	NC_017783	TAA	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
38	NC_017783	CTG	2	6	2435	2440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858681
39	NC_017783	TAA	2	6	2465	2470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
40	NC_017783	ATA	2	6	2807	2812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
41	NC_017783	ACC	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858681
42	NC_017783	TTA	2	6	2873	2878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858681
43	NC_017783	TTA	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
44	NC_017783	TTA	2	6	3063	3068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
45	NC_017783	CTT	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858682
46	NC_017783	AAT	2	6	3243	3248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858682
47	NC_017783	TTA	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
48	NC_017783	CAT	2	6	3311	3316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858682
49	NC_017783	TAA	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858682
50	NC_017783	ATT	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
51	NC_017783	CAA	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858683
52	NC_017783	CTC	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858683
53	NC_017783	TAA	2	6	3543	3548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858683
54	NC_017783	ATT	2	6	3554	3559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858683
55	NC_017783	AAT	2	6	3598	3603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858683
56	NC_017783	TTC	2	6	3642	3647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
57	NC_017783	TGA	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858683
58	NC_017783	TCT	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
59	NC_017783	CCT	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858683
60	NC_017783	TCT	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
61	NC_017783	TTC	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
62	NC_017783	TGT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858683
63	NC_017783	ATC	2	6	4040	4045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017783	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017783	TAT	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017783	ATT	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017783	GAT	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017783	TAT	2	6	5399	5404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017783	TAA	2	6	5429	5434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017783	CAA	2	6	5471	5476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017783	TTA	2	6	5478	5483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017783	ATA	3	9	5520	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017783	TAA	2	6	5557	5562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017783	ATT	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017783	ACA	2	6	5637	5642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017783	ATG	3	9	5713	5721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858684
77	NC_017783	TAA	2	6	5742	5747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858684
78	NC_017783	TAG	2	6	5793	5798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858684
79	NC_017783	TAT	2	6	5894	5899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
80	NC_017783	GTT	3	9	5950	5958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858684
81	NC_017783	TAT	2	6	5980	5985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
82	NC_017783	TAA	2	6	6006	6011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858684
83	NC_017783	ATT	2	6	6021	6026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
84	NC_017783	CAT	2	6	6066	6071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017783	CTG	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017783	ACA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017783	ATA	2	6	6217	6222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017783	GAA	2	6	8181	8186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017783	AAT	2	6	8193	8198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017783	AGT	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017783	TAT	2	6	8351	8356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017783	AGA	2	6	8379	8384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017783	TAA	3	9	8412	8420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017783	GTT	2	6	8651	8656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858685
95	NC_017783	GTT	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858685
96	NC_017783	AAT	2	6	8726	8731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858685
97	NC_017783	AAT	2	6	8843	8848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017783	TGG	2	6	8993	8998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017783	GGA	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017783	TGT	2	6	9032	9037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017783	CAA	2	6	9055	9060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017783	ATC	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017783	ATT	2	6	9154	9159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017783	ATA	2	6	9178	9183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017783	ACA	2	6	9210	9215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017783	AAG	2	6	9256	9261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017783	TAC	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017783	ATG	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017783	ATT	2	6	9351	9356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017783	GGC	2	6	9411	9416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017783	ATA	2	6	9418	9423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017783	TAT	2	6	9459	9464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017783	TAA	2	6	9523	9528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858686
114	NC_017783	ATA	2	6	9622	9627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858686
115	NC_017783	CAA	2	6	9652	9657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858686
116	NC_017783	TTA	2	6	9693	9698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
117	NC_017783	TTA	2	6	9726	9731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
118	NC_017783	TAG	3	9	9737	9745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858686
119	NC_017783	TAT	2	6	9811	9816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
120	NC_017783	TTA	2	6	9868	9873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
121	NC_017783	TAA	2	6	9907	9912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017783	TAC	2	6	10054	10059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858687
123	NC_017783	AAT	2	6	10178	10183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858687
124	NC_017783	ATT	2	6	10424	10429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858687
125	NC_017783	TTA	2	6	10448	10453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858687
126	NC_017783	TCT	2	6	10505	10510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017783	ATT	2	6	10552	10557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017783	AAT	2	6	10666	10671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017783	AGA	2	6	10677	10682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017783	TGT	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.