MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017780	CCT	2	6	64	69	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017780	TAG	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017780	TAA	2	6	318	323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017780	ATT	2	6	334	339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017780	ACC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859193
6	NC_017780	CTG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859193
7	NC_017780	ATC	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859193
8	NC_017780	AGC	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859193
9	NC_017780	ACC	2	6	552	557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859194
10	NC_017780	CTG	2	6	738	743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859194
11	NC_017780	CAG	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859194
12	NC_017780	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859194
13	NC_017780	ATC	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859194
14	NC_017780	CTT	2	6	876	881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017780	CAG	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017780	CCT	2	6	1008	1013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017780	TAT	2	6	1024	1029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017780	TAT	2	6	1132	1137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017780	AAT	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017780	ATA	2	6	1229	1234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017780	TAA	2	6	1332	1337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017780	ATA	3	9	1346	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017780	TTC	2	6	1517	1522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
24	NC_017780	TCT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
25	NC_017780	CTG	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
26	NC_017780	CTT	2	6	1581	1586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
27	NC_017780	CTG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
28	NC_017780	TGC	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
29	NC_017780	GCT	2	6	1709	1714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
30	NC_017780	CCT	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
31	NC_017780	CTG	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
32	NC_017780	ACC	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859195
33	NC_017780	TAG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859195
34	NC_017780	TTA	2	6	1913	1918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859195
35	NC_017780	TAC	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
36	NC_017780	TAA	2	6	2010	2015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859195
37	NC_017780	CTG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
38	NC_017780	GCA	3	9	2054	2062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859195
39	NC_017780	CTA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
40	NC_017780	CTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
41	NC_017780	TTC	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
42	NC_017780	TAC	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
43	NC_017780	TTA	2	6	2273	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859195
44	NC_017780	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
45	NC_017780	AGT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859195
46	NC_017780	CAG	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859195
47	NC_017780	TCC	3	9	2431	2439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
48	NC_017780	TCC	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
49	NC_017780	CAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
50	NC_017780	CAC	2	6	2491	2496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017780	CAT	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017780	ATT	3	9	2507	2515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017780	CTT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017780	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017780	ACC	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017780	ATC	2	6	3949	3954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017780	TTA	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017780	TAA	2	6	4137	4142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017780	AAC	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017780	TAT	2	6	4254	4259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017780	TAA	2	6	4432	4437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017780	ATA	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
63	NC_017780	TTA	2	6	4587	4592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
64	NC_017780	TAA	2	6	4624	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
65	NC_017780	TTC	2	6	4631	4636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859196
66	NC_017780	TCA	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859196
67	NC_017780	TTA	2	6	4764	4769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
68	NC_017780	TAA	2	6	4780	4785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
69	NC_017780	AAT	2	6	4898	4903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017780	ATA	3	9	4976	4984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017780	ATA	2	6	5114	5119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017780	ATA	2	6	5160	5165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017780	AAT	2	6	5200	5205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017780	ACA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017780	AAT	2	6	5230	5235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017780	TGA	2	6	6418	6423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017780	ATA	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017780	CGC	2	6	6483	6488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017780	ACT	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017780	TAA	2	6	6653	6658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017780	TAA	3	9	6671	6679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017780	ATT	2	6	6785	6790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017780	ATG	2	6	6887	6892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017780	TAT	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017780	ATT	2	6	6933	6938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017780	ATT	2	6	6942	6947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017780	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859197
88	NC_017780	AAC	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859197
89	NC_017780	TGA	2	6	7059	7064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859197
90	NC_017780	TCT	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
91	NC_017780	CTT	2	6	7236	7241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
92	NC_017780	CTT	2	6	7280	7285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
93	NC_017780	TAT	2	6	7347	7352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859197
94	NC_017780	TAA	2	6	7442	7447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859197
95	NC_017780	TTC	2	6	7456	7461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
96	NC_017780	TTG	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859197
97	NC_017780	TCA	3	9	7481	7489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859197
98	NC_017780	TCT	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
99	NC_017780	GTT	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017780	AGT	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859198
101	NC_017780	TAA	2	6	7776	7781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859198
102	NC_017780	ATT	2	6	7978	7983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859198
103	NC_017780	GTA	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859198
104	NC_017780	AAT	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859198
105	NC_017780	TTA	2	6	8336	8341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859198
106	NC_017780	ATC	2	6	8368	8373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859199
107	NC_017780	TAA	2	6	8415	8420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859199
108	NC_017780	TCT	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859199
109	NC_017780	AGT	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859199
110	NC_017780	CAA	2	6	8511	8516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017780	AAT	2	6	8541	8546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017780	ATA	3	9	8577	8585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017780	ATT	2	6	8589	8594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017780	TAT	2	6	8603	8608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017780	TGT	2	6	8620	8625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017780	ATT	2	6	8685	8690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017780	TTA	2	6	8715	8720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017780	TAT	2	6	8743	8748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017780	TTA	2	6	8749	8754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017780	TTA	2	6	8778	8783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017780	TAT	2	6	8795	8800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017780	TAA	2	6	8822	8827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017780	TAA	2	6	8832	8837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017780	ATT	2	6	8988	8993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017780	ATA	2	6	8997	9002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017780	TCT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017780	ATT	2	6	9190	9195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017780	TAT	2	6	9301	9306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017780	TTA	2	6	9307	9312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017780	CAT	3	9	9357	9365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017780	TAA	2	6	9430	9435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017780	ATG	2	6	9490	9495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017780	ATT	2	6	9561	9566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017780	AAC	2	6	9725	9730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017780	TAA	2	6	9797	9802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017780	ATG	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017780	TAT	2	6	9879	9884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017780	TTA	2	6	9941	9946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017780	ATG	2	6	9970	9975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_017780	GAT	2	6	10038	10043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017780	AGA	2	6	10067	10072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017780	TTA	2	6	10083	10088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.