MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017775	AATA	2	8	1	8	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017775	ATA	4	12	22	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017775	AAG	2	6	39	44	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017775	GA	3	6	49	54	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017775	GCTC	2	8	58	65	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017775	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017775	TAAAT	2	10	98	107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017775	A	7	7	123	129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017775	ATAAA	2	10	158	167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017775	T	7	7	175	181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017775	ATTC	2	8	225	232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017775	TAT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017775	AAT	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017775	AGAA	2	8	275	282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017775	AAT	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858859
16	NC_017775	A	6	6	334	339	100 %	0 %	0 %	0 %	386858859
17	NC_017775	T	6	6	399	404	0 %	100 %	0 %	0 %	386858859
18	NC_017775	TTG	2	6	454	459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858859
19	NC_017775	CTT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858859
20	NC_017775	AAAT	2	8	488	495	75 %	25 %	0 %	0 %	386858859
21	NC_017775	TTG	2	6	580	585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858859
22	NC_017775	ATG	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858859
23	NC_017775	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858859
24	NC_017775	TGA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858859
25	NC_017775	TTA	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858859
26	NC_017775	GGAT	2	8	756	763	25 %	25 %	50 %	0 %	386858859
27	NC_017775	A	6	6	768	773	100 %	0 %	0 %	0 %	386858859
28	NC_017775	TAAA	2	8	823	830	75 %	25 %	0 %	0 %	386858859
29	NC_017775	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	386858859
30	NC_017775	AGAAA	2	10	862	871	80 %	0 %	20 %	0 %	386858859
31	NC_017775	A	6	6	917	922	100 %	0 %	0 %	0 %	386858859
32	NC_017775	TCAT	2	8	929	936	25 %	50 %	0 %	25 %	386858859
33	NC_017775	A	7	7	944	950	100 %	0 %	0 %	0 %	386858859
34	NC_017775	TTTA	2	8	961	968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017775	ATT	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017775	T	6	6	1040	1045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017775	TA	3	6	1091	1096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017775	T	6	6	1103	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017775	A	7	7	1127	1133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017775	ATA	2	6	1138	1143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017775	CTTT	2	8	1237	1244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017775	AT	3	6	1263	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017775	A	6	6	1367	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017775	A	9	9	1388	1396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017775	T	7	7	1409	1415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017775	TAA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017775	TTA	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017775	T	6	6	1446	1451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017775	TAT	2	6	1467	1472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017775	CATAC	2	10	1485	1494	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017775	AAT	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017775	T	6	6	1531	1536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017775	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017775	AT	3	6	1583	1588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017775	A	6	6	1657	1662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017775	A	6	6	1673	1678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017775	TATT	2	8	1700	1707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017775	TG	3	6	1759	1764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017775	TTG	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017775	T	6	6	1845	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017775	TA	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017775	AAT	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017775	T	6	6	2087	2092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017775	T	7	7	2100	2106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017775	T	6	6	2112	2117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017775	TGCT	2	8	2138	2145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017775	TAA	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017775	T	6	6	2165	2170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017775	TTTG	2	8	2174	2181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017775	T	6	6	2194	2199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017775	A	6	6	2203	2208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017775	T	7	7	2214	2220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017775	T	7	7	2245	2251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017775	ATTT	2	8	2252	2259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017775	T	8	8	2257	2264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017775	T	7	7	2267	2273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017775	T	7	7	2278	2284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017775	T	8	8	2289	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	386858860
79	NC_017775	T	7	7	2300	2306	0 %	100 %	0 %	0 %	386858860
80	NC_017775	TTG	2	6	2313	2318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
81	NC_017775	TGT	2	6	2323	2328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
82	NC_017775	ATT	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
83	NC_017775	TAT	3	9	2360	2368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
84	NC_017775	AT	3	6	2367	2372	50 %	50 %	0 %	0 %	386858860
85	NC_017775	TAT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
86	NC_017775	ACT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858860
87	NC_017775	T	6	6	2392	2397	0 %	100 %	0 %	0 %	386858860
88	NC_017775	T	6	6	2404	2409	0 %	100 %	0 %	0 %	386858860
89	NC_017775	GTTTTT	2	12	2415	2426	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386858860
90	NC_017775	T	7	7	2422	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	386858860
91	NC_017775	TCT	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
92	NC_017775	TA	3	6	2450	2455	50 %	50 %	0 %	0 %	386858860
93	NC_017775	T	6	6	2468	2473	0 %	100 %	0 %	0 %	386858860
94	NC_017775	TAA	2	6	2475	2480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858860
95	NC_017775	TTC	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
96	NC_017775	T	8	8	2524	2531	0 %	100 %	0 %	0 %	386858860
97	NC_017775	TA	3	6	2535	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	386858860
98	NC_017775	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858860
99	NC_017775	ATG	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858860
100	NC_017775	CTT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
101	NC_017775	T	7	7	2661	2667	0 %	100 %	0 %	0 %	386858860
102	NC_017775	TTAA	2	8	2677	2684	50 %	50 %	0 %	0 %	386858860
103	NC_017775	TTG	2	6	2697	2702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
104	NC_017775	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
105	NC_017775	TA	3	6	2792	2797	50 %	50 %	0 %	0 %	386858860
106	NC_017775	AAATTT	2	12	2803	2814	50 %	50 %	0 %	0 %	386858860
107	NC_017775	GTTT	2	8	2839	2846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017775	T	6	6	2867	2872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017775	A	6	6	2889	2894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017775	TA	3	6	2917	2922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017775	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017775	ATG	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017775	TA	3	6	2970	2975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017775	TATT	2	8	2998	3005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017775	TGA	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017775	ATTT	2	8	3030	3037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017775	AGG	2	6	3038	3043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017775	T	6	6	3071	3076	0 %	100 %	0 %	0 %	386858861
119	NC_017775	A	6	6	3086	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	386858861
120	NC_017775	TTC	2	6	3128	3133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858861
121	NC_017775	AT	3	6	3146	3151	50 %	50 %	0 %	0 %	386858861
122	NC_017775	A	9	9	3152	3160	100 %	0 %	0 %	0 %	386858861
123	NC_017775	TCT	2	6	3180	3185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858861
124	NC_017775	ATTT	2	8	3190	3197	25 %	75 %	0 %	0 %	386858861
125	NC_017775	T	6	6	3195	3200	0 %	100 %	0 %	0 %	386858861
126	NC_017775	A	7	7	3201	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	386858861
127	NC_017775	TTA	2	6	3241	3246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858861
128	NC_017775	A	7	7	3257	3263	100 %	0 %	0 %	0 %	386858861
129	NC_017775	AAG	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017775	TAA	2	6	3278	3283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017775	A	6	6	3294	3299	100 %	0 %	0 %	0 %	386858862
132	NC_017775	T	7	7	3319	3325	0 %	100 %	0 %	0 %	386858862
133	NC_017775	A	6	6	3341	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	386858862
134	NC_017775	TAT	2	6	3347	3352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858862
135	NC_017775	CTC	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858862
136	NC_017775	T	7	7	3360	3366	0 %	100 %	0 %	0 %	386858862
137	NC_017775	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858862
138	NC_017775	A	6	6	3400	3405	100 %	0 %	0 %	0 %	386858862
139	NC_017775	A	6	6	3413	3418	100 %	0 %	0 %	0 %	386858862
140	NC_017775	GAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858862
141	NC_017775	T	6	6	3507	3512	0 %	100 %	0 %	0 %	386858862
142	NC_017775	AAT	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858862
143	NC_017775	AAT	2	6	3615	3620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858863
144	NC_017775	TCT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858863
145	NC_017775	A	6	6	3643	3648	100 %	0 %	0 %	0 %	386858863
146	NC_017775	CTT	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858863
147	NC_017775	TCCT	2	8	3701	3708	0 %	50 %	0 %	50 %	386858863
148	NC_017775	AATAT	2	10	3737	3746	60 %	40 %	0 %	0 %	386858863
149	NC_017775	A	6	6	3766	3771	100 %	0 %	0 %	0 %	386858863
150	NC_017775	GAT	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858863
151	NC_017775	ATT	2	6	3859	3864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.