MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus sp. JS chromosome

Total Repeats: 1408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017743	TTTCCC	2	12	3138	3149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017743	TATGAT	2	12	5418	5429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386756586
3	NC_017743	TGAAGA	2	12	8480	8491	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386756587
4	NC_017743	CAAAAG	2	12	17550	17561	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386756590
5	NC_017743	GCAAAA	2	12	17936	17947	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386756590
6	NC_017743	AAAAGT	2	12	27666	27677	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386756599
7	NC_017743	TGATCT	2	12	28044	28055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386756599
8	NC_017743	AAAAAC	2	12	36924	36935	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386756606
9	NC_017743	GAAGTT	2	12	39994	40005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386756609
10	NC_017743	TCAGAT	2	12	43057	43068	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386756614
11	NC_017743	TCTGCC	2	12	46364	46375	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386756618
12	NC_017743	AGCAAA	2	12	48602	48613	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386756620
13	NC_017743	GAGCGG	2	12	54303	54314	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386756625
14	NC_017743	GCTGAA	2	12	54725	54736	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756626
15	NC_017743	AAAATG	2	12	65536	65547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386756636
16	NC_017743	CGGCAG	2	12	65998	66009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386756636
17	NC_017743	AGGAAA	2	12	66782	66793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386756637
18	NC_017743	TCGTGA	2	12	67016	67027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756637
19	NC_017743	TGACTA	2	12	67787	67798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386756637
20	NC_017743	TATGAT	2	12	74487	74498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386756644
21	NC_017743	ATGCCA	2	12	80168	80179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386756648
22	NC_017743	CAGTCA	2	12	83595	83606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386756651
23	NC_017743	CAAATC	2	12	89050	89061	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386756659
24	NC_017743	ATTAAA	2	12	101718	101729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386756662
25	NC_017743	TAAAAT	2	12	101956	101967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386756662
26	NC_017743	AAACTG	2	12	105105	105116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386756665
27	NC_017743	CATTTA	2	12	118841	118852	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386756682
28	NC_017743	TCTGGT	2	12	118906	118917	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386756682
29	NC_017743	GAAGCT	2	12	119423	119434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756683
30	NC_017743	CTGTAG	2	12	120776	120787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756685
31	NC_017743	TCGGCT	2	12	122571	122582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386756687
32	NC_017743	AGTTGA	2	12	131006	131017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386756692
33	NC_017743	TGCTGT	2	12	131042	131053	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386756692
34	NC_017743	TTTGAA	2	12	132300	132311	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386756692
35	NC_017743	GAAACT	2	12	133151	133162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386756693
36	NC_017743	TAAAGG	2	12	136110	136121	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386756696
37	NC_017743	GTCGGT	2	12	142728	142739	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386756711
38	NC_017743	ATCGAA	2	12	142821	142832	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386756711
39	NC_017743	GAAAAG	2	12	147948	147959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386756721
40	NC_017743	AAACAA	2	12	147989	148000	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386756721
41	NC_017743	GAATCA	2	12	150501	150512	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386756726
42	NC_017743	CTGTTG	2	12	155269	155280	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386756732
43	NC_017743	AAAGCA	2	12	159637	159648	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386756737
44	NC_017743	AATTTG	2	12	178044	178055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386756740
45	NC_017743	GTAAAA	2	12	180180	180191	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386756742
46	NC_017743	GTAAAT	2	12	187009	187020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386756748
47	NC_017743	TCTGAT	2	12	187030	187041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386756748
48	NC_017743	AAAAAG	2	12	187902	187913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386756749
49	NC_017743	ATTCTG	2	12	188999	189010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386756749
50	NC_017743	GCTTCA	2	12	193294	193305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386756752
51	NC_017743	GTAAAA	2	12	193505	193516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386756752
52	NC_017743	TGACGT	2	12	196569	196580	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017743	TATGCA	2	12	199751	199762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386756758
54	NC_017743	GGCCGC	2	12	200784	200795	0 %	0 %	50 %	50 %	386756759
55	NC_017743	AGGATG	2	12	202718	202729	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386756760
56	NC_017743	AGCGGA	2	12	205423	205434	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386756763
57	NC_017743	GAAATG	2	12	205904	205915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386756763
58	NC_017743	AAAAGA	2	12	206416	206427	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017743	TTCATT	2	12	206941	206952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386756764
60	NC_017743	TGGTGC	2	12	215402	215413	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017743	CAAAAT	2	12	215512	215523	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017743	AAAGAA	2	12	218920	218931	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386756778
63	NC_017743	CTTTTT	2	12	221778	221789	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386756782
64	NC_017743	TGAATT	2	12	224988	224999	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386756785
65	NC_017743	TTGTGA	2	12	225305	225316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386756785
66	NC_017743	GAATTT	2	12	226428	226439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386756787
67	NC_017743	AGCACA	2	12	227310	227321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386756788
68	NC_017743	AGGCGA	2	12	230667	230678	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386756792
69	NC_017743	GTTTGG	2	12	231575	231586	0 %	50 %	50 %	0 %	386756793
70	NC_017743	GGCAAA	2	12	234984	234995	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386756795
71	NC_017743	TTTGGC	2	12	242030	242041	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386756805
72	NC_017743	CAAGCA	2	12	248370	248381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386756814
73	NC_017743	ATATGA	2	12	251872	251883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386756816
74	NC_017743	GTCAGA	2	12	252761	252772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756817
75	NC_017743	ACGACA	2	12	255002	255013	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386756821
76	NC_017743	ACTCTT	2	12	263099	263110	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017743	ACAAGA	2	12	266324	266335	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386756829
78	NC_017743	CGGCTT	2	12	272788	272799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386756836
79	NC_017743	ATTGGG	2	12	273231	273242	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386756837
80	NC_017743	AGCGGA	2	12	277132	277143	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386756842
81	NC_017743	GTTTTT	2	12	278323	278334	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017743	AAAAAC	2	12	279032	279043	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386756846
83	NC_017743	GAGGCT	2	12	281411	281422	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386756849
84	NC_017743	AAAAGG	2	12	286037	286048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386756853
85	NC_017743	GCGGCA	2	12	288077	288088	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386756856
86	NC_017743	CACATC	2	12	290596	290607	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386756858
87	NC_017743	GAAGGA	2	12	292995	293006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017743	AGCTGA	2	12	297216	297227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756865
89	NC_017743	ATTTTC	2	12	297273	297284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386756865
90	NC_017743	GCTTCC	2	12	297343	297354	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386756865
91	NC_017743	AACAAA	2	12	307364	307375	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386756875
92	NC_017743	AACAAA	2	12	307980	307991	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386756876
93	NC_017743	AAAATC	2	12	311068	311079	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386756879
94	NC_017743	CATTGA	2	12	316236	316247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386756884
95	NC_017743	ATCGTT	2	12	317367	317378	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386756885
96	NC_017743	TGAGCC	2	12	319324	319335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386756887
97	NC_017743	AGCCAT	2	12	321177	321188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017743	AAAAGA	2	12	321266	321277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386756889
99	NC_017743	ACGCTG	2	12	323760	323771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386756890
100	NC_017743	CGGATA	2	12	323776	323787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756890
101	NC_017743	ACAATG	2	12	327755	327766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386756894
102	NC_017743	GGAACT	2	12	328794	328805	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756895
103	NC_017743	ATGGAG	2	12	331830	331841	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017743	GCTGAA	2	12	331919	331930	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756899
105	NC_017743	TTCATT	2	12	332539	332550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017743	CAAGAA	2	12	333013	333024	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386756900
107	NC_017743	GTCTTT	2	12	336637	336648	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386756905
108	NC_017743	TCAAAA	2	12	338310	338321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386756907
109	NC_017743	ATGGGG	2	12	343610	343621	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386756911
110	NC_017743	TATCGG	2	12	343824	343835	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756911
111	NC_017743	GAAAAA	2	12	344859	344870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386756912
112	NC_017743	TCATGG	2	12	344948	344959	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756912
113	NC_017743	ATGACA	2	12	349041	349052	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386756917
114	NC_017743	GCTGAG	2	12	356101	356112	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386756921
115	NC_017743	AATCGT	2	12	360328	360339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386756926
116	NC_017743	CTGATT	2	12	363862	363873	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386756930
117	NC_017743	CCCCAT	2	12	364365	364376	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386756931
118	NC_017743	GTTTTC	2	12	364785	364796	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386756932
119	NC_017743	CAGCTG	2	12	368379	368390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386756937
120	NC_017743	ATGGTA	2	12	370030	370041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386756938
121	NC_017743	GCCTGA	2	12	370736	370747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386756939
122	NC_017743	CCCGCA	2	12	370869	370880	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386756939
123	NC_017743	ATTTTT	2	12	372364	372375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386756942
124	NC_017743	CAGCGG	2	12	373917	373928	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386756944
125	NC_017743	GTTCAG	2	12	380056	380067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756944
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130	NC_017743	GATCAG	2	12	397234	397245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756946
131	NC_017743	CCAGAT	2	12	402223	402234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386756951
132	NC_017743	CCTGAA	2	12	405468	405479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386756954
133	NC_017743	ATGAAA	2	12	409123	409134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386756958
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135	NC_017743	GAAACA	2	12	410404	410415	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386756959
136	NC_017743	GAGGGC	2	12	411035	411046	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386756961
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139	NC_017743	TCCCTG	2	12	420390	420401	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386756968
140	NC_017743	TGAAAT	2	12	425610	425621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386756972
141	NC_017743	AGCCGC	2	12	425644	425655	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386756973
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143	NC_017743	ATCGTC	2	12	430279	430290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386756977
144	NC_017743	TCAAGC	2	12	433295	433306	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386756980
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151	NC_017743	TTTTTA	2	12	445024	445035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017743	TGAAAG	2	12	445217	445228	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386756993
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176	NC_017743	ATTTTT	2	12	525895	525906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017743	TCTGAT	2	12	527188	527199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386757083
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181	NC_017743	ATGTGA	2	12	536810	536821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386757100
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206	NC_017743	TACATT	2	12	608475	608486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
207	NC_017743	ATTTTT	2	12	610336	610347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386757179
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215	NC_017743	TGCCAG	2	12	627109	627120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386757203
216	NC_017743	AATTCT	2	12	627923	627934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386757203
217	NC_017743	GCAGCT	2	12	631278	631289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386757206
218	NC_017743	TTTTGC	2	12	634444	634455	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386757209
219	NC_017743	AAGTGC	2	12	635000	635011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386757209
220	NC_017743	GAAAAA	2	12	636769	636780	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386757211
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222	NC_017743	TTATGG	2	12	639686	639697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386757214
223	NC_017743	TTGTTT	2	12	644825	644836	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386757221
224	NC_017743	AAAAGA	2	12	648777	648788	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386757225
225	NC_017743	CCATGT	2	12	650626	650637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386757227
226	NC_017743	ATCGGC	2	12	651303	651314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386757228
227	NC_017743	GGCTGA	2	12	653227	653238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386757230
228	NC_017743	AATTGA	2	12	661042	661053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386757232
229	NC_017743	AAGGAA	2	12	662387	662398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386757234
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231	NC_017743	TCAGCT	2	12	671748	671759	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_017743	TTTTTC	2	12	672388	672399	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
233	NC_017743	TTCTTG	2	12	678326	678337	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386757252
234	NC_017743	TAAATG	2	12	679189	679200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386757253
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236	NC_017743	TAAATT	2	12	682832	682843	50 %	50 %	0 %	0 %	386757257
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241	NC_017743	TCATTT	2	12	695462	695473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386757265
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247	NC_017743	CGTGAT	2	12	709708	709719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386757281
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257	NC_017743	GACGCG	2	12	736415	736426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386757306
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317	NC_017743	GGACAT	2	12	935102	935113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386757476
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321	NC_017743	ATCAGC	2	12	950264	950275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386757490
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339	NC_017743	CTTTTT	2	12	1006937	1006948	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
340	NC_017743	CCTGTG	2	12	1009399	1009410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386757549
341	NC_017743	CGCCTT	2	12	1013128	1013139	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386757552
342	NC_017743	GCGGAA	2	12	1014932	1014943	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
343	NC_017743	GGCTCG	2	12	1016570	1016581	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386757555
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457	NC_017743	GATTAG	2	12	1337392	1337403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386757907
458	NC_017743	GCTGAA	2	12	1344844	1344855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386757916
459	NC_017743	CTGCGA	2	12	1346579	1346590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386757918
460	NC_017743	GTTAAC	2	12	1348112	1348123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386757920
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481	NC_017743	GGGAAA	2	12	1413535	1413546	50 %	0 %	50 %	0 %	386757997
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483	NC_017743	AAAAAG	2	12	1418334	1418345	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386758002
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487	NC_017743	AAGGAG	2	12	1430121	1430132	50 %	0 %	50 %	0 %	386758016
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