MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid cp26

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017725	CTTT	2	8	175	182	0 %	75 %	0 %	25 %	386854244
2	NC_017725	AAAT	2	8	619	626	75 %	25 %	0 %	0 %	386854245
3	NC_017725	AATA	2	8	1288	1295	75 %	25 %	0 %	0 %	386854246
4	NC_017725	AATT	2	8	1444	1451	50 %	50 %	0 %	0 %	386854246
5	NC_017725	AATT	2	8	1684	1691	50 %	50 %	0 %	0 %	386854246
6	NC_017725	AAAT	2	8	2360	2367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017725	TAAG	2	8	2985	2992	50 %	25 %	25 %	0 %	386854247
8	NC_017725	CTGC	2	8	3131	3138	0 %	25 %	25 %	50 %	386854247
9	NC_017725	GCGG	2	8	3224	3231	0 %	0 %	75 %	25 %	386854247
10	NC_017725	TAAT	2	8	3829	3836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017725	AATT	2	8	3841	3848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017725	ATTA	2	8	3851	3858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017725	TTAT	2	8	3894	3901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017725	ATTA	2	8	3950	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017725	TAAA	2	8	3966	3973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017725	AATG	2	8	4601	4608	50 %	25 %	25 %	0 %	386854249
17	NC_017725	GAAA	2	8	4678	4685	75 %	0 %	25 %	0 %	386854250
18	NC_017725	ATAA	2	8	5057	5064	75 %	25 %	0 %	0 %	386854250
19	NC_017725	CTTT	2	8	5160	5167	0 %	75 %	0 %	25 %	386854250
20	NC_017725	TAAA	2	8	5767	5774	75 %	25 %	0 %	0 %	386854250
21	NC_017725	TTTA	2	8	5789	5796	25 %	75 %	0 %	0 %	386854251
22	NC_017725	ACTT	2	8	6151	6158	25 %	50 %	0 %	25 %	386854251
23	NC_017725	ATTA	2	8	6453	6460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017725	AAAT	2	8	6802	6809	75 %	25 %	0 %	0 %	386854252
25	NC_017725	ATTA	2	8	7952	7959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017725	TACT	2	8	8000	8007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017725	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017725	AGAA	2	8	8263	8270	75 %	0 %	25 %	0 %	386854254
29	NC_017725	GAAA	2	8	8285	8292	75 %	0 %	25 %	0 %	386854254
30	NC_017725	CAAG	2	8	9277	9284	50 %	0 %	25 %	25 %	386854256
31	NC_017725	TAAA	2	8	9397	9404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017725	GAAA	2	8	10128	10135	75 %	0 %	25 %	0 %	386854258
33	NC_017725	AATT	2	8	10274	10281	50 %	50 %	0 %	0 %	386854258
34	NC_017725	ATTA	2	8	11362	11369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017725	CTAT	2	8	11593	11600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017725	TTAA	2	8	11719	11726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017725	AATA	2	8	11797	11804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017725	CTTA	2	8	11844	11851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017725	TAAA	2	8	12086	12093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017725	TTAT	3	12	12116	12127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017725	AAAG	2	8	12257	12264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017725	TTTA	2	8	12562	12569	25 %	75 %	0 %	0 %	386854262
43	NC_017725	TGAA	2	8	12954	12961	50 %	25 %	25 %	0 %	386854262
44	NC_017725	GAAA	2	8	13916	13923	75 %	0 %	25 %	0 %	386854262
45	NC_017725	ATTT	2	8	14508	14515	25 %	75 %	0 %	0 %	386854263
46	NC_017725	TGCT	2	8	14531	14538	0 %	50 %	25 %	25 %	386854263
47	NC_017725	TGCA	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017725	ATTA	2	8	15746	15753	50 %	50 %	0 %	0 %	386854265
49	NC_017725	TTCA	2	8	16118	16125	25 %	50 %	0 %	25 %	386854265
50	NC_017725	ATTT	2	8	16834	16841	25 %	75 %	0 %	0 %	386854265
51	NC_017725	AATT	2	8	16946	16953	50 %	50 %	0 %	0 %	386854265
52	NC_017725	GTTT	2	8	17315	17322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017725	AAGT	2	8	17597	17604	50 %	25 %	25 %	0 %	386854266
54	NC_017725	TTAA	2	8	18102	18109	50 %	50 %	0 %	0 %	386854266
55	NC_017725	GTTT	2	8	18515	18522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017725	AATA	2	8	18855	18862	75 %	25 %	0 %	0 %	386854267
57	NC_017725	AAAT	2	8	19110	19117	75 %	25 %	0 %	0 %	386854267
58	NC_017725	TAAA	2	8	19385	19392	75 %	25 %	0 %	0 %	386854267
59	NC_017725	AATG	2	8	19404	19411	50 %	25 %	25 %	0 %	386854267
60	NC_017725	CCAA	2	8	19420	19427	50 %	0 %	0 %	50 %	386854267
61	NC_017725	AATA	2	8	19479	19486	75 %	25 %	0 %	0 %	386854267
62	NC_017725	ATTC	2	8	19626	19633	25 %	50 %	0 %	25 %	386854267
63	NC_017725	GATT	2	8	19909	19916	25 %	50 %	25 %	0 %	386854267
64	NC_017725	ATAA	2	8	20038	20045	75 %	25 %	0 %	0 %	386854268
65	NC_017725	AAAT	2	8	20575	20582	75 %	25 %	0 %	0 %	386854268
66	NC_017725	TAAA	2	8	20850	20857	75 %	25 %	0 %	0 %	386854268
67	NC_017725	AATG	2	8	20869	20876	50 %	25 %	25 %	0 %	386854268
68	NC_017725	CCAA	2	8	20885	20892	50 %	0 %	0 %	50 %	386854268
69	NC_017725	CCTT	2	8	21389	21396	0 %	50 %	0 %	50 %	386854268
70	NC_017725	AATT	2	8	21792	21799	50 %	50 %	0 %	0 %	386854269
71	NC_017725	TAAA	2	8	21876	21883	75 %	25 %	0 %	0 %	386854269
72	NC_017725	ACTA	2	8	22162	22169	50 %	25 %	0 %	25 %	386854270
73	NC_017725	AATT	2	8	22210	22217	50 %	50 %	0 %	0 %	386854270
74	NC_017725	ATGA	2	8	22498	22505	50 %	25 %	25 %	0 %	386854271
75	NC_017725	ATCT	2	8	22790	22797	25 %	50 %	0 %	25 %	386854271
76	NC_017725	ATTT	2	8	22975	22982	25 %	75 %	0 %	0 %	386854271
77	NC_017725	ATTT	2	8	23347	23354	25 %	75 %	0 %	0 %	386854272
78	NC_017725	ATTT	2	8	23662	23669	25 %	75 %	0 %	0 %	386854272
79	NC_017725	CAAA	2	8	24258	24265	75 %	0 %	0 %	25 %	386854273
80	NC_017725	ATTA	2	8	25384	25391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017725	TAAT	3	12	25395	25406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017725	ACCT	2	8	25668	25675	25 %	25 %	0 %	50 %	386854274
83	NC_017725	TACA	2	8	25790	25797	50 %	25 %	0 %	25 %	386854274
84	NC_017725	TCTT	2	8	25956	25963	0 %	75 %	0 %	25 %	386854274
85	NC_017725	TGTT	2	8	26052	26059	0 %	75 %	25 %	0 %	386854274
86	NC_017725	ATTT	2	8	26077	26084	25 %	75 %	0 %	0 %	386854274
87	NC_017725	AAAT	2	8	26250	26257	75 %	25 %	0 %	0 %	386854274

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.