MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-10

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017428	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826682
2	NC_017428	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387826682
3	NC_017428	TA	3	6	2966	2971	50 %	50 %	0 %	0 %	387826685
4	NC_017428	CT	3	6	3189	3194	0 %	50 %	0 %	50 %	387826685
5	NC_017428	TC	3	6	4313	4318	0 %	50 %	0 %	50 %	387826687
6	NC_017428	TG	3	6	5387	5392	0 %	50 %	50 %	0 %	387826688
7	NC_017428	AG	3	6	5528	5533	50 %	0 %	50 %	0 %	387826689
8	NC_017428	AT	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	387826690
9	NC_017428	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	387826690
10	NC_017428	AT	4	8	6413	6420	50 %	50 %	0 %	0 %	387826691
11	NC_017428	AT	3	6	6547	6552	50 %	50 %	0 %	0 %	387826691
12	NC_017428	AC	3	6	7055	7060	50 %	0 %	0 %	50 %	387826692
13	NC_017428	TA	3	6	7503	7508	50 %	50 %	0 %	0 %	387826692
14	NC_017428	AG	3	6	9176	9181	50 %	0 %	50 %	0 %	387826696
15	NC_017428	GA	3	6	9978	9983	50 %	0 %	50 %	0 %	387826696
16	NC_017428	AG	3	6	10375	10380	50 %	0 %	50 %	0 %	387826697
17	NC_017428	TA	3	6	10640	10645	50 %	50 %	0 %	0 %	387826697
18	NC_017428	TA	4	8	10761	10768	50 %	50 %	0 %	0 %	387826697
19	NC_017428	AT	3	6	11167	11172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017428	TA	3	6	11667	11672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017428	CA	3	6	11694	11699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017428	CA	3	6	12059	12064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017428	TA	3	6	12182	12187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017428	CA	3	6	12733	12738	50 %	0 %	0 %	50 %	387826698
25	NC_017428	AT	3	6	13130	13135	50 %	50 %	0 %	0 %	387826699
26	NC_017428	AT	3	6	13816	13821	50 %	50 %	0 %	0 %	387826700
27	NC_017428	TA	3	6	15038	15043	50 %	50 %	0 %	0 %	387826701
28	NC_017428	AT	3	6	15057	15062	50 %	50 %	0 %	0 %	387826701
29	NC_017428	TA	3	6	15125	15130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017428	AT	3	6	15439	15444	50 %	50 %	0 %	0 %	387826703
31	NC_017428	AT	3	6	15849	15854	50 %	50 %	0 %	0 %	387826704
32	NC_017428	AT	3	6	16017	16022	50 %	50 %	0 %	0 %	387826704
33	NC_017428	AT	3	6	16322	16327	50 %	50 %	0 %	0 %	387826705
34	NC_017428	AT	3	6	16549	16554	50 %	50 %	0 %	0 %	387826706
35	NC_017428	AT	3	6	16760	16765	50 %	50 %	0 %	0 %	387826706
36	NC_017428	AT	3	6	16847	16852	50 %	50 %	0 %	0 %	387826706
37	NC_017428	TA	3	6	17626	17631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017428	TA	3	6	18704	18709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017428	TA	3	6	20655	20660	50 %	50 %	0 %	0 %	387826710
40	NC_017428	TA	3	6	20906	20911	50 %	50 %	0 %	0 %	387826711
41	NC_017428	GA	3	6	21521	21526	50 %	0 %	50 %	0 %	387826712
42	NC_017428	TA	4	8	21767	21774	50 %	50 %	0 %	0 %	387826712
43	NC_017428	TA	3	6	21821	21826	50 %	50 %	0 %	0 %	387826712
44	NC_017428	AG	3	6	21862	21867	50 %	0 %	50 %	0 %	387826712
45	NC_017428	AT	3	6	22506	22511	50 %	50 %	0 %	0 %	387826713
46	NC_017428	TA	4	8	22923	22930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017428	TA	3	6	23079	23084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017428	TA	3	6	23465	23470	50 %	50 %	0 %	0 %	387826714
49	NC_017428	AG	3	6	23506	23511	50 %	0 %	50 %	0 %	387826714
50	NC_017428	TA	3	6	23546	23551	50 %	50 %	0 %	0 %	387826714
51	NC_017428	AG	3	6	23962	23967	50 %	0 %	50 %	0 %	387826714
52	NC_017428	AT	3	6	24654	24659	50 %	50 %	0 %	0 %	387826715
53	NC_017428	AG	3	6	24975	24980	50 %	0 %	50 %	0 %	387826716
54	NC_017428	TG	3	6	25805	25810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017428	TA	3	6	25895	25900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017428	AT	3	6	25910	25915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017428	GA	3	6	25985	25990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017428	TA	3	6	26057	26062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017428	TA	3	6	28093	28098	50 %	50 %	0 %	0 %	387826719
60	NC_017428	TG	3	6	28503	28508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017428	AT	3	6	28845	28850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017428	AT	3	6	29369	29374	50 %	50 %	0 %	0 %	387826720
63	NC_017428	AG	3	6	30273	30278	50 %	0 %	50 %	0 %	387826720

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.