MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387827799
2	NC_017424	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387827799
3	NC_017424	AT	3	6	1412	1417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017424	GA	3	6	1745	1750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017424	GT	3	6	2304	2309	0 %	50 %	50 %	0 %	387827800
6	NC_017424	CA	3	6	2503	2508	50 %	0 %	0 %	50 %	387827800
7	NC_017424	TA	3	6	2969	2974	50 %	50 %	0 %	0 %	387827801
8	NC_017424	AT	3	6	3183	3188	50 %	50 %	0 %	0 %	387827801
9	NC_017424	AT	3	6	4276	4281	50 %	50 %	0 %	0 %	387827803
10	NC_017424	TG	3	6	5385	5390	0 %	50 %	50 %	0 %	387827804
11	NC_017424	AG	3	6	5526	5531	50 %	0 %	50 %	0 %	387827805
12	NC_017424	AT	3	6	5919	5924	50 %	50 %	0 %	0 %	387827806
13	NC_017424	TA	3	6	5935	5940	50 %	50 %	0 %	0 %	387827806
14	NC_017424	AT	4	8	6411	6418	50 %	50 %	0 %	0 %	387827807
15	NC_017424	AT	3	6	6548	6553	50 %	50 %	0 %	0 %	387827807
16	NC_017424	AC	3	6	7056	7061	50 %	0 %	0 %	50 %	387827808
17	NC_017424	TA	3	6	7504	7509	50 %	50 %	0 %	0 %	387827808
18	NC_017424	AG	3	6	9177	9182	50 %	0 %	50 %	0 %	387827812
19	NC_017424	GA	3	6	9682	9687	50 %	0 %	50 %	0 %	387827812
20	NC_017424	AT	3	6	9808	9813	50 %	50 %	0 %	0 %	387827812
21	NC_017424	AT	3	6	9937	9942	50 %	50 %	0 %	0 %	387827812
22	NC_017424	TA	3	6	10186	10191	50 %	50 %	0 %	0 %	387827812
23	NC_017424	TA	3	6	10702	10707	50 %	50 %	0 %	0 %	387827813
24	NC_017424	AT	4	8	11547	11554	50 %	50 %	0 %	0 %	387827814
25	NC_017424	AC	3	6	11755	11760	50 %	0 %	0 %	50 %	387827814
26	NC_017424	CA	3	6	12123	12128	50 %	0 %	0 %	50 %	387827815
27	NC_017424	TA	3	6	12246	12251	50 %	50 %	0 %	0 %	387827815
28	NC_017424	AG	3	6	12362	12367	50 %	0 %	50 %	0 %	387827815
29	NC_017424	AT	3	6	12792	12797	50 %	50 %	0 %	0 %	387827816
30	NC_017424	AT	3	6	13186	13191	50 %	50 %	0 %	0 %	387827817
31	NC_017424	AT	3	6	13872	13877	50 %	50 %	0 %	0 %	387827818
32	NC_017424	TA	3	6	15080	15085	50 %	50 %	0 %	0 %	387827819
33	NC_017424	TA	3	6	15181	15186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017424	AT	3	6	15495	15500	50 %	50 %	0 %	0 %	387827821
35	NC_017424	AT	3	6	15905	15910	50 %	50 %	0 %	0 %	387827822
36	NC_017424	AT	3	6	16073	16078	50 %	50 %	0 %	0 %	387827822
37	NC_017424	AT	3	6	16378	16383	50 %	50 %	0 %	0 %	387827823
38	NC_017424	TC	3	6	17138	17143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017424	AT	3	6	17968	17973	50 %	50 %	0 %	0 %	387827826
40	NC_017424	TA	3	6	18934	18939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017424	GA	3	6	19281	19286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017424	TA	3	6	20304	20309	50 %	50 %	0 %	0 %	387827827
43	NC_017424	TA	3	6	20891	20896	50 %	50 %	0 %	0 %	387827828
44	NC_017424	TA	3	6	21142	21147	50 %	50 %	0 %	0 %	387827829
45	NC_017424	GA	3	6	21757	21762	50 %	0 %	50 %	0 %	387827830
46	NC_017424	TA	4	8	22003	22010	50 %	50 %	0 %	0 %	387827830
47	NC_017424	TA	3	6	22057	22062	50 %	50 %	0 %	0 %	387827830
48	NC_017424	AG	3	6	22098	22103	50 %	0 %	50 %	0 %	387827830
49	NC_017424	AT	3	6	22481	22486	50 %	50 %	0 %	0 %	387827831
50	NC_017424	AT	3	6	22998	23003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017424	AT	5	10	23114	23123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017424	TA	3	6	23272	23277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017424	AG	3	6	24159	24164	50 %	0 %	50 %	0 %	387827832
54	NC_017424	AT	3	6	24852	24857	50 %	50 %	0 %	0 %	387827833
55	NC_017424	GA	3	6	25293	25298	50 %	0 %	50 %	0 %	387827834
56	NC_017424	TA	3	6	25547	25552	50 %	50 %	0 %	0 %	387827834
57	NC_017424	AT	3	6	26108	26113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017424	GA	3	6	26183	26188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017424	TA	3	6	26255	26260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017424	AG	5	10	26837	26846	50 %	0 %	50 %	0 %	387827835
61	NC_017424	AG	5	10	26849	26858	50 %	0 %	50 %	0 %	387827835
62	NC_017424	TA	3	6	27368	27373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017424	TA	3	6	27509	27514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017424	CT	3	6	27515	27520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017424	TA	3	6	27533	27538	50 %	50 %	0 %	0 %	387827836
66	NC_017424	TG	3	6	28343	28348	0 %	50 %	50 %	0 %	387827837
67	NC_017424	AT	3	6	28685	28690	50 %	50 %	0 %	0 %	387827837
68	NC_017424	AT	3	6	28869	28874	50 %	50 %	0 %	0 %	387827838
69	NC_017424	AT	3	6	29209	29214	50 %	50 %	0 %	0 %	387827838
70	NC_017424	AG	3	6	30113	30118	50 %	0 %	50 %	0 %	387827838

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.