MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387827799
2	NC_017424	ATTAA	2	10	1786	1795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017424	TAAAT	2	10	2420	2429	60 %	40 %	0 %	0 %	387827800
4	NC_017424	ATTTA	2	10	5700	5709	40 %	60 %	0 %	0 %	387827805
5	NC_017424	GAAAA	2	10	6923	6932	80 %	0 %	20 %	0 %	387827808
6	NC_017424	GAAAA	2	10	10365	10374	80 %	0 %	20 %	0 %	387827813
7	NC_017424	TTAAA	2	10	11878	11887	60 %	40 %	0 %	0 %	387827814
8	NC_017424	TAAAG	2	10	11918	11927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017424	AATTT	2	10	12279	12288	40 %	60 %	0 %	0 %	387827815
10	NC_017424	GGACT	2	10	12653	12662	20 %	20 %	40 %	20 %	387827816
11	NC_017424	TACTT	2	10	13296	13305	20 %	60 %	0 %	20 %	387827817
12	NC_017424	GAAAA	2	10	13374	13383	80 %	0 %	20 %	0 %	387827817
13	NC_017424	AAAGT	2	10	13396	13405	60 %	20 %	20 %	0 %	387827817
14	NC_017424	ATTAA	2	10	15239	15248	60 %	40 %	0 %	0 %	387827820
15	NC_017424	AGTAA	2	10	15876	15885	60 %	20 %	20 %	0 %	387827822
16	NC_017424	TCACT	2	10	16033	16042	20 %	40 %	0 %	40 %	387827822
17	NC_017424	TTGCT	2	10	16130	16139	0 %	60 %	20 %	20 %	387827823
18	NC_017424	TATGT	2	10	16240	16249	20 %	60 %	20 %	0 %	387827823
19	NC_017424	ATTTT	2	10	17196	17205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017424	AAGGA	2	10	17230	17239	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017424	CACTT	2	10	18452	18461	20 %	40 %	0 %	40 %	387827826
22	NC_017424	TTGTA	2	10	19110	19119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017424	CACTA	2	10	19464	19473	40 %	20 %	0 %	40 %	387827827
24	NC_017424	CAAAA	2	10	22130	22139	80 %	0 %	0 %	20 %	387827830
25	NC_017424	TTTTA	2	10	22955	22964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017424	CAATC	2	10	23161	23170	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017424	GAGTT	2	10	24253	24262	20 %	40 %	40 %	0 %	387827832
28	NC_017424	ATAAA	2	10	24698	24707	80 %	20 %	0 %	0 %	387827833
29	NC_017424	AATTT	2	10	26128	26137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017424	AGATA	2	10	26914	26923	60 %	20 %	20 %	0 %	387827835
31	NC_017424	TAAAA	2	10	27157	27166	80 %	20 %	0 %	0 %	387827835
32	NC_017424	ATTAT	2	10	27711	27720	40 %	60 %	0 %	0 %	387827836

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.