MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	AAAAAT	2	12	336	347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017421	CAAAAA	2	12	813	824	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017421	TAGGAA	2	12	1757	1768	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017421	TTTTCA	2	12	2258	2269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017421	TAAAAA	2	12	2567	2578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017421	AAAATA	2	12	4217	4228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017421	TATAAA	2	12	4391	4402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017421	TTTATT	2	12	6056	6067	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387827770
9	NC_017421	CAAATT	2	12	6157	6168	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827770
10	NC_017421	ATCAGA	3	18	6524	6541	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387827770
11	NC_017421	ATTCTG	2	12	6550	6561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387827770
12	NC_017421	ATTTTC	2	12	9577	9588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017421	TAAAAC	2	12	11780	11791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827775
14	NC_017421	TAAATT	2	12	12358	12369	50 %	50 %	0 %	0 %	387827776
15	NC_017421	ATAAAA	2	12	15568	15579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017421	TTTTTA	2	12	18513	18524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387827783
17	NC_017421	GTCTTC	2	12	19175	19186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387827783
18	NC_017421	CAAAGG	2	12	20050	20061	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387827784
19	NC_017421	GATAAT	2	12	24037	24048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387827788
20	NC_017421	CTATTA	2	12	24791	24802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017421	AAATGT	2	12	25048	25059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017421	AGCTTC	2	12	26063	26074	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387827789
23	NC_017421	TATCTC	2	12	28067	28078	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387827790
24	NC_017421	CTTTTC	2	12	28330	28341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827790
25	NC_017421	GATAAT	2	12	32072	32083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387827793
26	NC_017421	TTGTAT	2	12	32447	32458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017421	CTATTA	2	12	32826	32837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017421	CTTTAT	2	12	35861	35872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387827797
29	NC_017421	TAAATA	2	12	36086	36097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827797
30	NC_017421	ATCACC	2	12	36734	36745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017421	CAGTAT	2	12	37441	37452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.