MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp17

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017417	AT	3	6	91	96	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017417	TA	3	6	273	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017417	TA	3	6	539	544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017417	AT	4	8	1562	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	387827840
5	NC_017417	TA	3	6	1807	1812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017417	AT	3	6	2824	2829	50 %	50 %	0 %	0 %	387827841
7	NC_017417	AT	3	6	2882	2887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017417	TA	3	6	2912	2917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017417	AT	3	6	3040	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017417	CT	3	6	3162	3167	0 %	50 %	0 %	50 %	387827842
11	NC_017417	AC	3	6	5013	5018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017417	TA	3	6	5293	5298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017417	TA	3	6	5405	5410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017417	TA	3	6	5495	5500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017417	AT	3	6	5730	5735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017417	AT	3	6	6271	6276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017417	AT	3	6	6496	6501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017417	AT	3	6	7324	7329	50 %	50 %	0 %	0 %	387827844
19	NC_017417	AT	3	6	7333	7338	50 %	50 %	0 %	0 %	387827844
20	NC_017417	AT	3	6	7542	7547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017417	AT	3	6	8636	8641	50 %	50 %	0 %	0 %	387827845
22	NC_017417	AT	3	6	8920	8925	50 %	50 %	0 %	0 %	387827845
23	NC_017417	TA	3	6	10184	10189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017417	AC	3	6	11236	11241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017417	AC	3	6	11284	11289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017417	AT	3	6	11291	11296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017417	AT	3	6	11371	11376	50 %	50 %	0 %	0 %	387827848
28	NC_017417	AT	3	6	12123	12128	50 %	50 %	0 %	0 %	387827849
29	NC_017417	TA	3	6	12203	12208	50 %	50 %	0 %	0 %	387827849
30	NC_017417	AT	3	6	12487	12492	50 %	50 %	0 %	0 %	387827849
31	NC_017417	TA	3	6	12575	12580	50 %	50 %	0 %	0 %	387827849
32	NC_017417	AT	3	6	12928	12933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017417	TA	4	8	12946	12953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017417	AT	3	6	12993	12998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017417	AT	10	20	13012	13031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017417	AT	3	6	13157	13162	50 %	50 %	0 %	0 %	387827850
37	NC_017417	AT	3	6	13303	13308	50 %	50 %	0 %	0 %	387827850
38	NC_017417	TA	3	6	13535	13540	50 %	50 %	0 %	0 %	387827850
39	NC_017417	AG	3	6	13872	13877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017417	AT	3	6	14450	14455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017417	AT	3	6	15208	15213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017417	TA	3	6	15247	15252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017417	AG	3	6	15363	15368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017417	AT	3	6	15727	15732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017417	TA	3	6	15788	15793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017417	TA	4	8	15940	15947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017417	TA	3	6	16349	16354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017417	AT	3	6	16710	16715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017417	AT	3	6	16731	16736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017417	AT	3	6	16752	16757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017417	AT	3	6	16773	16778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017417	AT	3	6	16794	16799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017417	AT	3	6	16815	16820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017417	AT	3	6	16836	16841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017417	AT	3	6	16857	16862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017417	AT	3	6	16878	16883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017417	AT	3	6	16899	16904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017417	AT	3	6	16920	16925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017417	AT	3	6	16941	16946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017417	AT	3	6	16962	16967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017417	AT	3	6	16983	16988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017417	AT	3	6	17004	17009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017417	AT	3	6	17025	17030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017417	AT	3	6	17046	17051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017417	AT	3	6	17067	17072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017417	AT	3	6	17088	17093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017417	TG	3	6	17371	17376	0 %	50 %	50 %	0 %	387827852
68	NC_017417	TG	3	6	17537	17542	0 %	50 %	50 %	0 %	387827852
69	NC_017417	TA	3	6	17777	17782	50 %	50 %	0 %	0 %	387827852
70	NC_017417	AT	3	6	18098	18103	50 %	50 %	0 %	0 %	387827853
71	NC_017417	TC	3	6	18267	18272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017417	AT	3	6	18554	18559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017417	TA	3	6	18589	18594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017417	TA	3	6	18624	18629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017417	AT	3	6	18657	18662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017417	AT	3	6	19715	19720	50 %	50 %	0 %	0 %	387827855
77	NC_017417	AT	3	6	19851	19856	50 %	50 %	0 %	0 %	387827855
78	NC_017417	AC	3	6	19858	19863	50 %	0 %	0 %	50 %	387827855
79	NC_017417	TA	3	6	19982	19987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017417	CA	3	6	20064	20069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017417	TA	3	6	20172	20177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017417	TA	3	6	20293	20298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017417	TA	3	6	20537	20542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017417	TA	3	6	20552	20557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017417	TA	3	6	20581	20586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.