MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	TTTCT	2	10	1475	1484	0 %	80 %	0 %	20 %	387828013
2	NC_017415	TAATA	2	10	1921	1930	60 %	40 %	0 %	0 %	387828013
3	NC_017415	TTCTT	2	10	2195	2204	0 %	80 %	0 %	20 %	387828013
4	NC_017415	TTAAA	2	10	2359	2368	60 %	40 %	0 %	0 %	387828013
5	NC_017415	ATTTA	2	10	2883	2892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017415	AAATA	2	10	3490	3499	80 %	20 %	0 %	0 %	387828014
7	NC_017415	ATTCA	2	10	3641	3650	40 %	40 %	0 %	20 %	387828014
8	NC_017415	ATTAA	2	10	4061	4070	60 %	40 %	0 %	0 %	387828014
9	NC_017415	TTGAA	2	10	5486	5495	40 %	40 %	20 %	0 %	387828016
10	NC_017415	TTTAT	2	10	6196	6205	20 %	80 %	0 %	0 %	387828016
11	NC_017415	AACCA	2	10	6438	6447	60 %	0 %	0 %	40 %	387828016
12	NC_017415	TTATA	2	10	6914	6923	40 %	60 %	0 %	0 %	387828016
13	NC_017415	CTTTC	2	10	7963	7972	0 %	60 %	0 %	40 %	387828016
14	NC_017415	AATTT	2	10	9543	9552	40 %	60 %	0 %	0 %	387828017
15	NC_017415	ATATT	2	10	10353	10362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017415	TATAA	2	10	10450	10459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017415	AAGAT	2	10	10597	10606	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017415	CATTC	2	10	12253	12262	20 %	40 %	0 %	40 %	387828019
19	NC_017415	TTATT	2	10	14701	14710	20 %	80 %	0 %	0 %	387828023
20	NC_017415	ATTTA	2	10	15101	15110	40 %	60 %	0 %	0 %	387828023
21	NC_017415	TTTTA	2	10	15128	15137	20 %	80 %	0 %	0 %	387828023
22	NC_017415	TTTTA	2	10	15470	15479	20 %	80 %	0 %	0 %	387828023
23	NC_017415	TCTTT	2	10	16192	16201	0 %	80 %	0 %	20 %	387828024
24	NC_017415	ATAAA	2	10	17058	17067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017415	TTGGT	2	10	19314	19323	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017415	CTAAA	2	10	19680	19689	60 %	20 %	0 %	20 %	387828025
27	NC_017415	AATAG	2	10	20015	20024	60 %	20 %	20 %	0 %	387828025
28	NC_017415	AATAG	2	10	20675	20684	60 %	20 %	20 %	0 %	387828025
29	NC_017415	ATATG	2	10	21118	21127	40 %	40 %	20 %	0 %	387828025
30	NC_017415	ATGTT	2	10	21324	21333	20 %	60 %	20 %	0 %	387828025
31	NC_017415	TCTTT	2	10	23713	23722	0 %	80 %	0 %	20 %	387828027
32	NC_017415	TTTAA	2	10	24654	24663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017415	AAAAC	2	10	25987	25996	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017415	AAATT	2	10	26182	26191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.