MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp36

Total Repeats: 969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017414	TTA	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017414	TAACTT	2	12	51	62	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017414	ATA	2	6	87	92	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017414	T	6	6	132	137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017414	A	6	6	190	195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017414	TTA	2	6	197	202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017414	TTA	2	6	216	221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017414	A	7	7	250	256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017414	TA	3	6	261	266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017414	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826907
11	NC_017414	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	387826907
12	NC_017414	TAA	2	6	312	317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826907
13	NC_017414	ATT	2	6	381	386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826907
14	NC_017414	A	7	7	389	395	100 %	0 %	0 %	0 %	387826907
15	NC_017414	AT	3	6	450	455	50 %	50 %	0 %	0 %	387826907
16	NC_017414	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826907
17	NC_017414	A	6	6	464	469	100 %	0 %	0 %	0 %	387826907
18	NC_017414	TAT	2	6	542	547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826907
19	NC_017414	AGTT	2	8	571	578	25 %	50 %	25 %	0 %	387826907
20	NC_017414	ATT	2	6	601	606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826907
21	NC_017414	TAC	3	9	640	648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826907
22	NC_017414	AT	3	6	695	700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017414	A	7	7	712	718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017414	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017414	TATAA	2	10	742	751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017414	TAATA	2	10	755	764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017414	ATGG	2	8	780	787	25 %	25 %	50 %	0 %	387826908
28	NC_017414	A	6	6	818	823	100 %	0 %	0 %	0 %	387826908
29	NC_017414	AAATT	2	10	826	835	60 %	40 %	0 %	0 %	387826908
30	NC_017414	ATT	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826908
31	NC_017414	TAA	2	6	928	933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826908
32	NC_017414	TTA	2	6	993	998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826908
33	NC_017414	A	7	7	1018	1024	100 %	0 %	0 %	0 %	387826908
34	NC_017414	TGT	2	6	1044	1049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826908
35	NC_017414	AGA	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017414	TTG	2	6	1110	1115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017414	TA	3	6	1185	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017414	TAT	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017414	AAT	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017414	AAAT	2	8	1371	1378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017414	AT	3	6	1383	1388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017414	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017414	ATT	3	9	1423	1431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017414	CAAA	2	8	1441	1448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017414	AGA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017414	T	7	7	1503	1509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017414	TAA	2	6	1524	1529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017414	TCT	2	6	1568	1573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017414	AGA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017414	A	6	6	1586	1591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017414	TA	3	6	1598	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017414	ATTGA	2	10	1644	1653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017414	TAAAC	2	10	1656	1665	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017414	TAA	3	9	1694	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017414	TATT	2	8	1718	1725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017414	A	6	6	1736	1741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017414	A	8	8	1755	1762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017414	T	6	6	1803	1808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017414	AAT	2	6	1820	1825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017414	AAT	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017414	T	6	6	1894	1899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017414	GATT	2	8	2039	2046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017414	T	7	7	2045	2051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017414	A	7	7	2126	2132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017414	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017414	ATA	2	6	2255	2260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017414	TAA	2	6	2263	2268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017414	ATTC	2	8	2289	2296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017414	T	6	6	2297	2302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017414	TATT	2	8	2331	2338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017414	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017414	ATTTTG	2	12	2377	2388	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017414	AT	3	6	2421	2426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017414	A	8	8	2475	2482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017414	T	9	9	2491	2499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017414	CAAA	2	8	2501	2508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017414	AGG	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017414	ATT	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017414	AAT	2	6	2591	2596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017414	A	7	7	2642	2648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017414	T	8	8	2669	2676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017414	TTA	2	6	2728	2733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017414	TGC	2	6	2788	2793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017414	CTCA	2	8	2815	2822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017414	GTC	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017414	T	6	6	2854	2859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017414	TAC	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017414	TTC	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017414	ATTA	2	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017414	T	6	6	3174	3179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017414	TGA	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017414	GAG	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017414	T	7	7	3251	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017414	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017414	ATC	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017414	T	6	6	3345	3350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017414	ATT	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017414	CCT	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017414	ATT	2	6	3544	3549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017414	T	7	7	3622	3628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017414	T	6	6	3652	3657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017414	CTT	2	6	3674	3679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017414	T	7	7	3683	3689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017414	T	6	6	3694	3699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017414	T	7	7	3734	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017414	T	7	7	3742	3748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017414	AAT	2	6	3925	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826909
108	NC_017414	AT	3	6	3958	3963	50 %	50 %	0 %	0 %	387826909
109	NC_017414	A	6	6	3982	3987	100 %	0 %	0 %	0 %	387826909
110	NC_017414	T	8	8	3990	3997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826909
111	NC_017414	T	6	6	4099	4104	0 %	100 %	0 %	0 %	387826909
112	NC_017414	TAAT	2	8	4114	4121	50 %	50 %	0 %	0 %	387826909
113	NC_017414	T	7	7	4136	4142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017414	AAAG	2	8	4195	4202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017414	T	6	6	4218	4223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017414	T	6	6	4225	4230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017414	TAAG	2	8	4247	4254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017414	A	6	6	4276	4281	100 %	0 %	0 %	0 %	387826910
119	NC_017414	TTTTCT	2	12	4305	4316	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826910
120	NC_017414	TATT	2	8	4354	4361	25 %	75 %	0 %	0 %	387826910
121	NC_017414	CTG	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826910
122	NC_017414	TGT	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017414	TAG	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017414	TAT	2	6	4604	4609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017414	TCT	2	6	4713	4718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017414	ACTATA	2	12	4771	4782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017414	TAA	2	6	4837	4842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826911
128	NC_017414	TGA	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826911
129	NC_017414	A	6	6	4963	4968	100 %	0 %	0 %	0 %	387826911
130	NC_017414	GAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826911
131	NC_017414	A	6	6	5037	5042	100 %	0 %	0 %	0 %	387826911
132	NC_017414	A	7	7	5056	5062	100 %	0 %	0 %	0 %	387826911
133	NC_017414	CTC	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826911
134	NC_017414	TCA	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826911
135	NC_017414	A	6	6	5134	5139	100 %	0 %	0 %	0 %	387826911
136	NC_017414	TAAT	2	8	5161	5168	50 %	50 %	0 %	0 %	387826911
137	NC_017414	GAA	2	6	5207	5212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826911
138	NC_017414	CTT	2	6	5347	5352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826911
139	NC_017414	A	6	6	5385	5390	100 %	0 %	0 %	0 %	387826911
140	NC_017414	ATG	2	6	5461	5466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826911
141	NC_017414	A	6	6	5476	5481	100 %	0 %	0 %	0 %	387826911
142	NC_017414	AGC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826911
143	NC_017414	CAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826911
144	NC_017414	TA	5	10	5534	5543	50 %	50 %	0 %	0 %	387826911
145	NC_017414	GT	3	6	5560	5565	0 %	50 %	50 %	0 %	387826911
146	NC_017414	A	6	6	5614	5619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017414	ATA	2	6	5643	5648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826912
148	NC_017414	T	8	8	5675	5682	0 %	100 %	0 %	0 %	387826912
149	NC_017414	GAA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826912
150	NC_017414	C	6	6	5877	5882	0 %	0 %	0 %	100 %	387826912
151	NC_017414	TAAT	2	8	5891	5898	50 %	50 %	0 %	0 %	387826912
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