MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7

Total Repeats: 732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017412	CTT	2	6	19890	19895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826770
502	NC_017412	T	7	7	19944	19950	0 %	100 %	0 %	0 %	387826770
503	NC_017412	ATC	3	9	19963	19971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826770
504	NC_017412	ATC	2	6	19976	19981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826770
505	NC_017412	CCT	2	6	19989	19994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826771
506	NC_017412	GT	3	6	20079	20084	0 %	50 %	50 %	0 %	387826771
507	NC_017412	T	6	6	20084	20089	0 %	100 %	0 %	0 %	387826771
508	NC_017412	TG	3	6	20225	20230	0 %	50 %	50 %	0 %	387826771
509	NC_017412	GTT	2	6	20278	20283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826771
510	NC_017412	AAG	2	6	20288	20293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826771
511	NC_017412	ATT	2	6	20303	20308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826771
512	NC_017412	CATTAA	2	12	20352	20363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826771
513	NC_017412	T	8	8	20439	20446	0 %	100 %	0 %	0 %	387826771
514	NC_017412	T	7	7	20448	20454	0 %	100 %	0 %	0 %	387826771
515	NC_017412	AATGC	2	10	20457	20466	40 %	20 %	20 %	20 %	387826771
516	NC_017412	TGA	2	6	20533	20538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826771
517	NC_017412	CTT	2	6	20547	20552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826771
518	NC_017412	ATG	2	6	20562	20567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826771
519	NC_017412	ACA	2	6	20579	20584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826771
520	NC_017412	TCT	2	6	20606	20611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826771
521	NC_017412	TTG	2	6	20629	20634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826771
522	NC_017412	TCC	2	6	20644	20649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826771
523	NC_017412	GTT	2	6	20673	20678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826771
524	NC_017412	CTT	2	6	20747	20752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826771
525	NC_017412	TTTCTA	2	12	20772	20783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826771
526	NC_017412	AGT	2	6	20828	20833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826771
527	NC_017412	CAT	2	6	20934	20939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826771
528	NC_017412	AAC	2	6	20956	20961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826771
529	NC_017412	CTCGTA	2	12	21052	21063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387826771
530	NC_017412	T	8	8	21093	21100	0 %	100 %	0 %	0 %	387826771
531	NC_017412	A	6	6	21113	21118	100 %	0 %	0 %	0 %	387826771
532	NC_017412	GT	3	6	21200	21205	0 %	50 %	50 %	0 %	387826771
533	NC_017412	A	6	6	21261	21266	100 %	0 %	0 %	0 %	387826771
534	NC_017412	ATC	2	6	21304	21309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826771
535	NC_017412	AT	3	6	21380	21385	50 %	50 %	0 %	0 %	387826771
536	NC_017412	ACT	2	6	21397	21402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826771
537	NC_017412	TTG	2	6	21432	21437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826771
538	NC_017412	GGA	2	6	21466	21471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826771
539	NC_017412	ATT	2	6	21509	21514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826771
540	NC_017412	GAA	2	6	21666	21671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826771
541	NC_017412	ATTG	2	8	21706	21713	25 %	50 %	25 %	0 %	387826771
542	NC_017412	T	6	6	21733	21738	0 %	100 %	0 %	0 %	387826771
543	NC_017412	CTT	3	9	21747	21755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826771
544	NC_017412	TC	3	6	21773	21778	0 %	50 %	0 %	50 %	387826771
545	NC_017412	ACATA	2	10	21822	21831	60 %	20 %	0 %	20 %	387826771
546	NC_017412	TAA	2	6	21870	21875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826771
547	NC_017412	ACA	2	6	21948	21953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826771
548	NC_017412	TCT	2	6	21977	21982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826771
549	NC_017412	CAT	3	9	22032	22040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826771
550	NC_017412	TAGTT	2	10	22054	22063	20 %	60 %	20 %	0 %	387826771
551	NC_017412	T	6	6	22062	22067	0 %	100 %	0 %	0 %	387826771
552	NC_017412	TAT	2	6	22069	22074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826771
553	NC_017412	A	6	6	22133	22138	100 %	0 %	0 %	0 %	387826771
554	NC_017412	TAG	2	6	22177	22182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826771
555	NC_017412	AGT	2	6	22188	22193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826771
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557	NC_017412	GAA	2	6	22318	22323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826771
558	NC_017412	TTC	2	6	22339	22344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826771
559	NC_017412	TGCT	2	8	22374	22381	0 %	50 %	25 %	25 %	387826771
560	NC_017412	T	6	6	22407	22412	0 %	100 %	0 %	0 %	387826771
561	NC_017412	CAA	2	6	22437	22442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826771
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563	NC_017412	TCT	2	6	22523	22528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826771
564	NC_017412	TTC	2	6	22543	22548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826771
565	NC_017412	CTTGA	2	10	22593	22602	20 %	40 %	20 %	20 %	387826771
566	NC_017412	TCT	2	6	22637	22642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826772
567	NC_017412	T	6	6	22649	22654	0 %	100 %	0 %	0 %	387826772
568	NC_017412	TCGGT	2	10	22672	22681	0 %	40 %	40 %	20 %	387826772
569	NC_017412	T	6	6	22681	22686	0 %	100 %	0 %	0 %	387826772
570	NC_017412	GTA	2	6	22700	22705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826772
571	NC_017412	T	6	6	22716	22721	0 %	100 %	0 %	0 %	387826772
572	NC_017412	TTTCAT	2	12	22741	22752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826772
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574	NC_017412	TTGT	2	8	22908	22915	0 %	75 %	25 %	0 %	387826772
575	NC_017412	GGTT	2	8	22919	22926	0 %	50 %	50 %	0 %	387826772
576	NC_017412	AAGA	2	8	22954	22961	75 %	0 %	25 %	0 %	387826772
577	NC_017412	A	6	6	22989	22994	100 %	0 %	0 %	0 %	387826772
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581	NC_017412	ATT	2	6	23409	23414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826774
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583	NC_017412	GAA	2	6	23673	23678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826774
584	NC_017412	TCA	2	6	23686	23691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826774
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587	NC_017412	AATA	2	8	23847	23854	75 %	25 %	0 %	0 %	387826774
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599	NC_017412	TTC	2	6	24272	24277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826775
600	NC_017412	GTA	2	6	24302	24307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826775
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605	NC_017412	T	7	7	24452	24458	0 %	100 %	0 %	0 %	387826775
606	NC_017412	T	7	7	24482	24488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017412	A	7	7	24497	24503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017412	TACT	2	8	24512	24519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_017412	A	6	6	24524	24529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017412	TAAA	2	8	24530	24537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017412	CTAG	2	8	24545	24552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_017412	CAA	2	6	24579	24584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017412	ATT	2	6	24600	24605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017412	A	6	6	24644	24649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017412	T	6	6	24657	24662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017412	T	7	7	24666	24672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017412	A	6	6	24678	24683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017412	AT	3	6	24693	24698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017412	T	7	7	24723	24729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017412	A	6	6	24743	24748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017412	AGC	2	6	24785	24790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017412	AT	3	6	24845	24850	50 %	50 %	0 %	0 %	387826776
623	NC_017412	ATT	2	6	24860	24865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826776
624	NC_017412	AAT	2	6	24867	24872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826776
625	NC_017412	TTA	2	6	24891	24896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826776
626	NC_017412	A	6	6	24933	24938	100 %	0 %	0 %	0 %	387826776
627	NC_017412	A	7	7	24987	24993	100 %	0 %	0 %	0 %	387826776
628	NC_017412	TGAT	2	8	25036	25043	25 %	50 %	25 %	0 %	387826776
629	NC_017412	A	6	6	25128	25133	100 %	0 %	0 %	0 %	387826776
630	NC_017412	GTT	2	6	25146	25151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826776
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