MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	ATT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017411	CAA	2	6	132	137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017411	ATA	2	6	179	184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017411	TAT	2	6	218	223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017411	ATT	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017411	TAC	3	9	316	324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017411	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826841
8	NC_017411	TAA	2	6	605	610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826841
9	NC_017411	TGT	2	6	721	726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826841
10	NC_017411	AGA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826841
11	NC_017411	TTG	2	6	789	794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826841
12	NC_017411	TAT	2	6	897	902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017411	AAT	2	6	1013	1018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017411	TAA	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017411	ATT	3	9	1101	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017411	AGA	2	6	1175	1180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017411	TAA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017411	TCT	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017411	AGA	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017411	TAA	3	9	1372	1380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017411	AAT	2	6	1498	1503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017411	AAT	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017411	TAA	2	6	1835	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017411	ATA	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017411	TAA	2	6	1941	1946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017411	AGG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017411	ATT	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017411	AAT	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017411	TTA	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017411	ATT	2	6	2440	2445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826842
31	NC_017411	TGC	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826842
32	NC_017411	GTC	2	6	2527	2532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826842
33	NC_017411	TAC	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
34	NC_017411	TTC	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826842
35	NC_017411	TGA	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826842
36	NC_017411	GAG	2	6	2889	2894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826842
37	NC_017411	ATC	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
38	NC_017411	TCA	2	6	3113	3118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
39	NC_017411	ATT	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826842
40	NC_017411	CCT	2	6	3199	3204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017411	CTT	2	6	3352	3357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017411	AAT	2	6	3604	3609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826843
43	NC_017411	TTA	2	6	3845	3850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017411	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826844
45	NC_017411	CTG	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017411	TGT	2	6	4213	4218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017411	TAG	2	6	4232	4237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017411	TAT	2	6	4285	4290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017411	TCT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017411	ACC	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017411	TAA	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017411	TGA	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017411	CTC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017411	TCA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017411	GAA	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017411	ATG	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017411	CAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017411	ATA	2	6	5325	5330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826845
59	NC_017411	GAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826845
60	NC_017411	CTG	2	6	5615	5620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826845
61	NC_017411	ATT	2	6	5790	5795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826845
62	NC_017411	TTA	2	6	5800	5805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826845
63	NC_017411	AGA	2	6	5853	5858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826845
64	NC_017411	TGA	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826845
65	NC_017411	CCT	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017411	AAT	2	6	6031	6036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017411	TAG	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017411	CAT	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017411	AAG	2	6	6221	6226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017411	ATT	2	6	6262	6267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017411	TAT	2	6	6341	6346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017411	TAT	2	6	6354	6359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017411	ATT	2	6	6419	6424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017411	TAA	3	9	6578	6586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017411	AGA	2	6	6698	6703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017411	AAG	2	6	6804	6809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017411	TAA	2	6	6815	6820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017411	AAT	2	6	6866	6871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017411	TTA	2	6	6907	6912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017411	AAC	2	6	6969	6974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017411	ATT	2	6	6996	7001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017411	ATT	2	6	7058	7063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017411	ATT	2	6	7138	7143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017411	CGA	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017411	TAT	2	6	7418	7423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017411	TAA	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
87	NC_017411	TGC	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826846
88	NC_017411	TAG	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
89	NC_017411	CTT	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826846
90	NC_017411	TGA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
91	NC_017411	GAT	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
92	NC_017411	TAA	2	6	7969	7974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
93	NC_017411	GTT	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826846
94	NC_017411	AGA	2	6	8068	8073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826846
95	NC_017411	TGA	2	6	8206	8211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
96	NC_017411	GTT	2	6	8347	8352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826846
97	NC_017411	CTG	2	6	8367	8372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826846
98	NC_017411	ATG	2	6	8445	8450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
99	NC_017411	TAA	2	6	8469	8474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
100	NC_017411	GAT	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
101	NC_017411	ATT	2	6	8582	8587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826846
102	NC_017411	TAA	2	6	8670	8675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
103	NC_017411	CAT	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826846
104	NC_017411	TTG	2	6	8784	8789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826846
105	NC_017411	ATG	2	6	8796	8801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
106	NC_017411	ATC	2	6	8828	8833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826846
107	NC_017411	TAA	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826846
108	NC_017411	TGA	2	6	8989	8994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826846
109	NC_017411	ATT	2	6	9093	9098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826846
110	NC_017411	ATT	2	6	9107	9112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017411	TTA	2	6	9184	9189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017411	ATT	2	6	9200	9205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017411	AGT	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017411	TAA	2	6	9317	9322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017411	TCT	2	6	9380	9385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017411	ATT	2	6	9679	9684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017411	TAA	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017411	TAT	2	6	9766	9771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826847
119	NC_017411	TAA	2	6	9973	9978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826847
120	NC_017411	AGA	2	6	10007	10012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826847
121	NC_017411	CTT	2	6	10034	10039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826847
122	NC_017411	AAT	3	9	10076	10084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826847
123	NC_017411	TTA	2	6	10124	10129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826847
124	NC_017411	ATA	2	6	10140	10145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826847
125	NC_017411	GCG	2	6	10230	10235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387826847
126	NC_017411	GAT	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826847
127	NC_017411	GAA	2	6	10334	10339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826847
128	NC_017411	GAA	2	6	10343	10348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826847
129	NC_017411	AGA	3	9	10351	10359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826847
130	NC_017411	TAC	2	6	10399	10404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017411	CTT	2	6	10441	10446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017411	TAA	2	6	10767	10772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826848
133	NC_017411	AAG	2	6	10783	10788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826848
134	NC_017411	CTT	2	6	10876	10881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826848
135	NC_017411	TAA	2	6	10909	10914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826848
136	NC_017411	ATT	2	6	10967	10972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826848
137	NC_017411	CTA	2	6	11079	11084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826848
138	NC_017411	TAT	2	6	11096	11101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826848
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271	NC_017411	AAC	2	6	21911	21916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826858
272	NC_017411	TTA	2	6	21962	21967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826858
273	NC_017411	CTC	2	6	21973	21978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826858
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275	NC_017411	TTC	2	6	22138	22143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826858
276	NC_017411	AAC	2	6	22194	22199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826858
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279	NC_017411	TAC	2	6	22268	22273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_017411	TGT	2	6	22284	22289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017411	TTA	2	6	22318	22323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017411	ATT	2	6	22397	22402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017411	TAT	3	9	22429	22437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017411	TAA	2	6	22529	22534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017411	TAA	2	6	22588	22593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.