MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017411	ATTAT	2	10	17516	17525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017411	TAA	2	6	17553	17558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017411	AATA	2	8	17587	17594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017411	A	6	6	17598	17603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017411	A	6	6	17639	17644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017411	TTA	2	6	17667	17672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017411	TTG	2	6	17698	17703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017411	CTA	2	6	17713	17718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017411	TATT	2	8	17735	17742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017411	ATT	2	6	17778	17783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017411	A	6	6	17812	17817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017411	ATT	2	6	17829	17834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017411	AAT	2	6	17884	17889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017411	GAT	2	6	17905	17910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826855
515	NC_017411	AGAAA	2	10	17922	17931	80 %	0 %	20 %	0 %	387826855
516	NC_017411	AAATT	2	10	17993	18002	60 %	40 %	0 %	0 %	387826855
517	NC_017411	ATA	2	6	18011	18016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826855
518	NC_017411	TTC	2	6	18033	18038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826855
519	NC_017411	AG	3	6	18040	18045	50 %	0 %	50 %	0 %	387826855
520	NC_017411	TAA	2	6	18066	18071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826855
521	NC_017411	A	7	7	18113	18119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017411	ATA	2	6	18138	18143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017411	A	6	6	18154	18159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017411	TA	3	6	18176	18181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017411	TATTAC	2	12	18197	18208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
526	NC_017411	TTC	2	6	18263	18268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017411	CTCC	2	8	18282	18289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
528	NC_017411	CTT	2	6	18309	18314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017411	T	6	6	18363	18368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017411	ATT	2	6	18398	18403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017411	TAA	2	6	18443	18448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017411	TAT	2	6	18459	18464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017411	AAT	2	6	18531	18536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017411	AT	3	6	18597	18602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017411	ATT	2	6	18609	18614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017411	AATAT	2	10	18646	18655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017411	ATA	2	6	18662	18667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017411	AT	3	6	18670	18675	50 %	50 %	0 %	0 %	387826856
539	NC_017411	TAA	2	6	18682	18687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826856
540	NC_017411	AT	3	6	18704	18709	50 %	50 %	0 %	0 %	387826856
541	NC_017411	A	8	8	18723	18730	100 %	0 %	0 %	0 %	387826856
542	NC_017411	AAGA	2	8	18788	18795	75 %	0 %	25 %	0 %	387826856
543	NC_017411	TTA	2	6	18796	18801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826856
544	NC_017411	A	6	6	18804	18809	100 %	0 %	0 %	0 %	387826856
545	NC_017411	TTA	2	6	18821	18826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826856
546	NC_017411	AGA	2	6	18846	18851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826856
547	NC_017411	T	7	7	18927	18933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017411	TAA	2	6	19011	19016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017411	A	7	7	19019	19025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017411	TTA	2	6	19115	19120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017411	GTA	3	9	19126	19134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017411	TGA	2	6	19146	19151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017411	ATATT	2	10	19155	19164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017411	A	6	6	19219	19224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017411	AGTA	2	8	19263	19270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017411	ATC	2	6	19289	19294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017411	A	6	6	19308	19313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017411	A	6	6	19327	19332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017411	A	6	6	19350	19355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017411	CAT	2	6	19414	19419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017411	GTT	2	6	19425	19430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017411	ACT	2	6	19434	19439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017411	ACT	2	6	19491	19496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017411	ACAT	2	8	19497	19504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_017411	TAGA	2	8	19541	19548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017411	TAA	2	6	19691	19696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017411	TCTTT	2	10	19715	19724	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
568	NC_017411	T	6	6	19796	19801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017411	T	6	6	19819	19824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017411	T	6	6	19838	19843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017411	AATA	2	8	19844	19851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017411	GAT	2	6	19857	19862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017411	TACT	2	8	19881	19888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_017411	T	6	6	19927	19932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017411	ATA	2	6	19990	19995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017411	ATC	2	6	19999	20004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017411	CTA	3	9	20016	20024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017411	TAA	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017411	T	7	7	20126	20132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017411	ATT	2	6	20134	20139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017411	A	7	7	20218	20224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017411	TTC	2	6	20299	20304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017411	GATA	2	8	20319	20326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017411	T	6	6	20342	20347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017411	ATA	2	6	20349	20354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017411	TCTT	2	8	20356	20363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_017411	T	8	8	20421	20428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017411	AT	3	6	20442	20447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017411	TTA	2	6	20464	20469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017411	ATT	2	6	20476	20481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017411	T	6	6	20480	20485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017411	AAG	2	6	20682	20687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017411	CA	3	6	20767	20772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_017411	TATT	2	8	20793	20800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017411	TCAT	2	8	20849	20856	25 %	50 %	0 %	25 %	387826857
596	NC_017411	TTA	2	6	20898	20903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826857
597	NC_017411	TAA	2	6	20906	20911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826857
598	NC_017411	T	8	8	21021	21028	0 %	100 %	0 %	0 %	387826857
599	NC_017411	AAT	2	6	21043	21048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826857
600	NC_017411	AATT	2	8	21121	21128	50 %	50 %	0 %	0 %	387826857
601	NC_017411	TTC	2	6	21170	21175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826857
602	NC_017411	TATT	2	8	21193	21200	25 %	75 %	0 %	0 %	387826857
603	NC_017411	T	8	8	21206	21213	0 %	100 %	0 %	0 %	387826857
604	NC_017411	TAT	2	6	21239	21244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826857
605	NC_017411	A	7	7	21311	21317	100 %	0 %	0 %	0 %	387826857
606	NC_017411	A	6	6	21337	21342	100 %	0 %	0 %	0 %	387826857
607	NC_017411	ACC	2	6	21437	21442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826857
608	NC_017411	AAAG	2	8	21498	21505	75 %	0 %	25 %	0 %	387826857
609	NC_017411	CT	3	6	21522	21527	0 %	50 %	0 %	50 %	387826857
610	NC_017411	AATAA	2	10	21643	21652	80 %	20 %	0 %	0 %	387826857
611	NC_017411	TA	4	8	21656	21663	50 %	50 %	0 %	0 %	387826857
612	NC_017411	AT	3	6	21667	21672	50 %	50 %	0 %	0 %	387826857
613	NC_017411	AT	4	8	21678	21685	50 %	50 %	0 %	0 %	387826857
614	NC_017411	TTTC	2	8	21719	21726	0 %	75 %	0 %	25 %	387826858
615	NC_017411	TC	3	6	21731	21736	0 %	50 %	0 %	50 %	387826858
616	NC_017411	TTG	2	6	21751	21756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826858
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618	NC_017411	T	6	6	21896	21901	0 %	100 %	0 %	0 %	387826858
619	NC_017411	AAC	2	6	21911	21916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826858
620	NC_017411	TTA	2	6	21962	21967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826858
621	NC_017411	CTC	2	6	21973	21978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826858
622	NC_017411	T	6	6	22040	22045	0 %	100 %	0 %	0 %	387826858
623	NC_017411	ACT	2	6	22132	22137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826858
624	NC_017411	TTC	2	6	22138	22143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826858
625	NC_017411	A	7	7	22153	22159	100 %	0 %	0 %	0 %	387826858
626	NC_017411	AAC	2	6	22194	22199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826858
627	NC_017411	TGC	2	6	22213	22218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826858
628	NC_017411	TAT	2	6	22219	22224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826858
629	NC_017411	CCAA	2	8	22232	22239	50 %	0 %	0 %	50 %	387826858
630	NC_017411	AT	3	6	22247	22252	50 %	50 %	0 %	0 %	387826858
631	NC_017411	TACC	2	8	22259	22266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_017411	TAC	2	6	22268	22273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017411	TGT	2	6	22284	22289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017411	TTA	2	6	22318	22323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017411	AGAT	2	8	22343	22350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017411	ATT	2	6	22397	22402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017411	TAT	3	9	22429	22437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017411	CA	3	6	22484	22489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_017411	A	6	6	22500	22505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017411	A	6	6	22508	22513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017411	TAA	2	6	22529	22534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017411	A	6	6	22533	22538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_017411	TTGT	2	8	22572	22579	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
644	NC_017411	TAA	2	6	22588	22593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_017411	GTTT	2	8	22740	22747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
646	NC_017411	T	6	6	22784	22789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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