MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	TAAAT	2	10	661	670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017410	TAATT	2	10	1505	1514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017410	TTCTT	2	10	2025	2034	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017410	TTAAT	2	10	2647	2656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017410	CAAGC	2	10	4103	4112	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017410	AATAA	2	10	4530	4539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017410	ATATT	2	10	4745	4754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017410	GTATG	2	10	5199	5208	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017410	ACAGA	2	10	5538	5547	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017410	AAGGG	2	10	6565	6574	40 %	0 %	60 %	0 %	387826737
11	NC_017410	AAAAT	2	10	7314	7323	80 %	20 %	0 %	0 %	387826738
12	NC_017410	AGATT	2	10	7514	7523	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017410	AGAAA	2	10	7947	7956	80 %	0 %	20 %	0 %	387826739
14	NC_017410	TCAAA	2	10	8229	8238	60 %	20 %	0 %	20 %	387826739
15	NC_017410	CAATT	2	10	8907	8916	40 %	40 %	0 %	20 %	387826740
16	NC_017410	GATAA	2	10	9154	9163	60 %	20 %	20 %	0 %	387826741
17	NC_017410	CAAAA	2	10	9568	9577	80 %	0 %	0 %	20 %	387826741
18	NC_017410	ACAAA	2	10	10076	10085	80 %	0 %	0 %	20 %	387826741
19	NC_017410	TTTGA	2	10	10589	10598	20 %	60 %	20 %	0 %	387826742
20	NC_017410	ATTTT	2	10	11566	11575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017410	GTTTT	2	10	11917	11926	0 %	80 %	20 %	0 %	387826743
22	NC_017410	TAATA	2	10	12321	12330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017410	ATATT	2	10	15942	15951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017410	TAAAT	2	10	16159	16168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017410	AAAGA	2	10	16171	16180	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017410	ATTTG	2	10	17472	17481	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.