MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	TCC	2	6	58	63	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017410	CTG	2	6	114	119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017410	ATT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017410	ATT	2	6	306	311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017410	AGA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017410	TGA	2	6	450	455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017410	AAT	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017410	ATA	2	6	537	542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017410	TAG	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017410	GAT	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017410	CAA	2	6	676	681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017410	TTA	2	6	727	732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017410	TTA	2	6	769	774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017410	TAA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017410	TAA	3	9	894	902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017410	AGA	2	6	955	960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017410	AAG	2	6	1043	1048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017410	TAA	2	6	1054	1059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017410	AAT	2	6	1105	1110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017410	TTG	2	6	1115	1120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017410	TTA	2	6	1145	1150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017410	AAC	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017410	ATT	2	6	1234	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017410	TAA	2	6	1255	1260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017410	ATT	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017410	ATT	2	6	1376	1381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017410	ATT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017410	ATT	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017410	CTG	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017410	TAT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017410	AGA	2	6	1840	1845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017410	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017410	CTT	2	6	2188	2193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017410	TGA	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017410	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017410	GTT	2	6	2376	2381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017410	GTC	2	6	2402	2407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017410	AGA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017410	ATA	2	6	2508	2513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017410	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017410	CTG	2	6	2770	2775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017410	ATG	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017410	TAA	2	6	2872	2877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017410	ATT	2	6	2985	2990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017410	TAA	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017410	AAG	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017410	TTG	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017410	ATG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017410	ATC	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017410	ATA	3	9	3281	3289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017410	GAA	2	6	3329	3334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017410	TGA	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017410	GGT	2	6	3433	3438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017410	ATT	2	6	3498	3503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017410	ATT	2	6	3512	3517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017410	TTA	2	6	3588	3593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017410	TAT	2	6	3607	3612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017410	AGT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017410	AAT	2	6	3723	3728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017410	ATA	2	6	3810	3815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017410	CAT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017410	GAT	2	6	4025	4030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017410	TGA	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017410	TTA	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017410	TAT	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017410	ATT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017410	TCT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017410	TTA	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017410	AAG	2	6	4920	4925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017410	TAA	2	6	4963	4968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017410	TAA	2	6	4978	4983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017410	TAA	2	6	5043	5048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017410	TAT	2	6	5078	5083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017410	TCA	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017410	TAA	2	6	5152	5157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017410	ATA	2	6	5221	5226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017410	ATT	2	6	5267	5272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017410	AAT	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017410	AGA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017410	ATT	2	6	5347	5352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017410	AAT	2	6	5362	5367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017410	TGA	2	6	5443	5448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017410	TAA	3	9	5480	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017410	TTA	2	6	5517	5522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017410	TAT	2	6	5556	5561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017410	ATT	2	6	5789	5794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017410	CAA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017410	ACT	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017410	ATT	2	6	5915	5920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017410	ATA	2	6	5936	5941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017410	TCA	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826737
92	NC_017410	ATA	2	6	6459	6464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826737
93	NC_017410	TTA	2	6	6487	6492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826737
94	NC_017410	GAT	2	6	6503	6508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826737
95	NC_017410	GAA	2	6	6545	6550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826737
96	NC_017410	TTA	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826737
97	NC_017410	TAA	2	6	6664	6669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017410	ATT	2	6	6754	6759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017410	CCA	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826738
100	NC_017410	ATC	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826738
101	NC_017410	TTA	2	6	6834	6839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826738
102	NC_017410	CAT	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826738
103	NC_017410	TGC	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826738
104	NC_017410	TAT	2	6	6889	6894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826738
105	NC_017410	CAA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826738
106	NC_017410	ATA	2	6	6936	6941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826738
107	NC_017410	TGT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826738
108	NC_017410	TAA	2	6	7026	7031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826738
109	NC_017410	ACA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826738
110	NC_017410	TTA	2	6	7090	7095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826738
111	NC_017410	AAT	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826738
112	NC_017410	ATA	2	6	7413	7418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017410	TAT	3	9	7475	7483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017410	GTT	2	6	7489	7494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017410	ATT	2	6	7596	7601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
116	NC_017410	ATT	2	6	7734	7739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
117	NC_017410	GAA	2	6	7827	7832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826739
118	NC_017410	ATG	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826739
119	NC_017410	TAT	2	6	7979	7984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
120	NC_017410	AAC	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826739
121	NC_017410	AAC	2	6	8165	8170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826739
122	NC_017410	GAA	2	6	8208	8213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826739
123	NC_017410	CAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826739
124	NC_017410	TCT	2	6	8329	8334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826739
125	NC_017410	TTA	2	6	8445	8450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
126	NC_017410	ATT	2	6	8519	8524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
127	NC_017410	TAA	2	6	8578	8583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017410	AGA	2	6	8737	8742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826740
129	NC_017410	AGA	2	6	8836	8841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826740
130	NC_017410	AGA	2	6	8870	8875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826740
131	NC_017410	ATT	2	6	9060	9065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017410	AAT	2	6	9103	9108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017410	CAA	2	6	9129	9134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017410	ATA	2	6	9166	9171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
135	NC_017410	TAA	2	6	9201	9206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
136	NC_017410	AGA	2	6	9219	9224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826741
137	NC_017410	TAA	2	6	9426	9431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
138	NC_017410	ATA	2	6	9446	9451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
139	NC_017410	ATT	2	6	9486	9491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826741
140	NC_017410	TAA	2	6	9509	9514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
141	NC_017410	ATT	2	6	9601	9606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826741
142	NC_017410	TAA	2	6	9618	9623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.