MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017408	A	6	6	308	313	100 %	0 %	0 %	0 %	387826487
2	NC_017408	T	7	7	614	620	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
3	NC_017408	A	7	7	621	627	100 %	0 %	0 %	0 %	387826487
4	NC_017408	T	7	7	970	976	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
5	NC_017408	T	7	7	991	997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
6	NC_017408	T	6	6	1146	1151	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
7	NC_017408	T	7	7	1225	1231	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
8	NC_017408	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	387826488
9	NC_017408	A	8	8	1663	1670	100 %	0 %	0 %	0 %	387826488
10	NC_017408	T	6	6	1745	1750	0 %	100 %	0 %	0 %	387826488
11	NC_017408	T	8	8	2309	2316	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
12	NC_017408	T	6	6	2328	2333	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
13	NC_017408	T	6	6	2362	2367	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
14	NC_017408	T	7	7	2508	2514	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
15	NC_017408	T	6	6	2649	2654	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
16	NC_017408	T	7	7	2888	2894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017408	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	387826490
18	NC_017408	T	6	6	2992	2997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
19	NC_017408	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
20	NC_017408	T	6	6	3145	3150	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
21	NC_017408	T	6	6	3609	3614	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
22	NC_017408	T	6	6	3705	3710	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
23	NC_017408	T	7	7	3719	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
24	NC_017408	T	6	6	3746	3751	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
25	NC_017408	T	6	6	3781	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
26	NC_017408	T	6	6	3833	3838	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
27	NC_017408	T	6	6	3884	3889	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
28	NC_017408	T	6	6	3962	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
29	NC_017408	T	7	7	4010	4016	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
30	NC_017408	T	8	8	4043	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
31	NC_017408	T	8	8	4093	4100	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
32	NC_017408	T	6	6	4148	4153	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
33	NC_017408	T	6	6	4187	4192	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
34	NC_017408	T	8	8	4223	4230	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
35	NC_017408	T	8	8	4269	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
36	NC_017408	T	6	6	4340	4345	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
37	NC_017408	T	6	6	4541	4546	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
38	NC_017408	T	6	6	4561	4566	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
39	NC_017408	T	6	6	4860	4865	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
40	NC_017408	T	6	6	4927	4932	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
41	NC_017408	T	8	8	5047	5054	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
42	NC_017408	T	7	7	5091	5097	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
43	NC_017408	T	7	7	5169	5175	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
44	NC_017408	T	7	7	5398	5404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017408	T	7	7	5408	5414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017408	T	6	6	5540	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
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50	NC_017408	T	6	6	6005	6010	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
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56	NC_017408	T	6	6	6767	6772	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
57	NC_017408	T	7	7	7114	7120	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
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61	NC_017408	T	9	9	8952	8960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63	NC_017408	T	8	8	9159	9166	0 %	100 %	0 %	0 %	387826494
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66	NC_017408	T	6	6	9674	9679	0 %	100 %	0 %	0 %	387826495
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70	NC_017408	T	7	7	12275	12281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_017408	T	7	7	14110	14116	0 %	100 %	0 %	0 %	387826502
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82	NC_017408	T	6	6	14377	14382	0 %	100 %	0 %	0 %	387826502
83	NC_017408	T	7	7	14628	14634	0 %	100 %	0 %	0 %	387826503
84	NC_017408	A	6	6	14824	14829	100 %	0 %	0 %	0 %	387826503
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100	NC_017408	A	6	6	18821	18826	100 %	0 %	0 %	0 %	387826507
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103	NC_017408	A	6	6	19693	19698	100 %	0 %	0 %	0 %	387826507
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111	NC_017408	A	8	8	20837	20844	100 %	0 %	0 %	0 %	387826509
112	NC_017408	T	6	6	20978	20983	0 %	100 %	0 %	0 %	387826509
113	NC_017408	T	6	6	21616	21621	0 %	100 %	0 %	0 %	387826510
114	NC_017408	A	6	6	21649	21654	100 %	0 %	0 %	0 %	387826510
115	NC_017408	T	8	8	22113	22120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017408	A	9	9	22123	22131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017408	T	6	6	22257	22262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017408	T	8	8	22286	22293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017408	A	6	6	22295	22300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017408	A	7	7	22599	22605	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
121	NC_017408	A	6	6	22674	22679	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
122	NC_017408	A	7	7	22962	22968	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
123	NC_017408	A	7	7	23101	23107	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
124	NC_017408	A	6	6	23279	23284	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
125	NC_017408	A	8	8	23299	23306	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
126	NC_017408	A	6	6	23613	23618	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
127	NC_017408	A	6	6	23907	23912	100 %	0 %	0 %	0 %	387826512
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129	NC_017408	T	6	6	24456	24461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017408	A	6	6	24463	24468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017408	A	7	7	24538	24544	100 %	0 %	0 %	0 %	387826514
132	NC_017408	T	6	6	24635	24640	0 %	100 %	0 %	0 %	387826514
133	NC_017408	A	7	7	24649	24655	100 %	0 %	0 %	0 %	387826514
134	NC_017408	A	8	8	24706	24713	100 %	0 %	0 %	0 %	387826514
135	NC_017408	A	6	6	24938	24943	100 %	0 %	0 %	0 %	387826514
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139	NC_017408	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	387826516
140	NC_017408	T	6	6	26638	26643	0 %	100 %	0 %	0 %	387826516
141	NC_017408	A	7	7	26792	26798	100 %	0 %	0 %	0 %	387826516
142	NC_017408	A	8	8	26803	26810	100 %	0 %	0 %	0 %	387826516

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.