MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-1

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017404	TATAAA	2	12	381	392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017404	AGTAAT	2	12	1235	1246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826784
3	NC_017404	TTATCT	2	12	1815	1826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826784
4	NC_017404	ATCCTT	2	12	2162	2173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387826784
5	NC_017404	TTATAA	2	12	3631	3642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017404	TTATAT	2	12	3836	3847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017404	AAAATG	2	12	4960	4971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017404	AAATTA	2	12	5069	5080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017404	CTTTTT	2	12	10553	10564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826789
10	NC_017404	GTAATA	2	12	11065	11076	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826790
11	NC_017404	TATTTC	2	12	11350	11361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826790
12	NC_017404	AATTTT	2	12	14033	14044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826793
13	NC_017404	AGTTGA	2	12	14941	14952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017404	TCACCA	2	12	18136	18147	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017404	CTTAAC	2	12	19442	19453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017404	CCTTAA	2	12	21281	21292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017404	AACAAA	2	12	22965	22976	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017404	TTTGTT	2	12	23347	23358	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387826794
19	NC_017404	AATGCT	2	12	23959	23970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826794

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.