MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-1

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017404	TAG	2	6	44	49	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017404	T	6	6	67	72	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017404	GCA	2	6	76	81	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017404	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017404	TAT	2	6	159	164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017404	AATT	2	8	167	174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017404	ACT	2	6	208	213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017404	ATCA	2	8	214	221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017404	AGAT	2	8	227	234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017404	AAC	2	6	238	243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017404	A	7	7	253	259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017404	TAC	2	6	263	268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017404	TAT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017404	CAA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017404	AACA	2	8	349	356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017404	TATAAA	2	12	381	392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017404	AT	4	8	401	408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017404	AAT	2	6	421	426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017404	ATT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017404	A	6	6	463	468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017404	TAA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826783
22	NC_017404	CTA	2	6	555	560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826783
23	NC_017404	TAA	2	6	618	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826783
24	NC_017404	TTA	2	6	640	645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826783
25	NC_017404	TAA	2	6	690	695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826783
26	NC_017404	A	7	7	707	713	100 %	0 %	0 %	0 %	387826783
27	NC_017404	AATT	2	8	736	743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017404	ACT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017404	AAT	2	6	822	827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017404	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017404	TCT	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017404	T	7	7	934	940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017404	ATT	4	12	943	954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017404	TAT	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017404	TAG	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017404	ATT	2	6	1050	1055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826784
37	NC_017404	T	7	7	1063	1069	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
38	NC_017404	ATA	2	6	1080	1085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826784
39	NC_017404	TAACT	2	10	1092	1101	40 %	40 %	0 %	20 %	387826784
40	NC_017404	TAA	2	6	1102	1107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826784
41	NC_017404	TTC	2	6	1118	1123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826784
42	NC_017404	AT	3	6	1188	1193	50 %	50 %	0 %	0 %	387826784
43	NC_017404	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826784
44	NC_017404	AGTAAT	2	12	1235	1246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826784
45	NC_017404	TTTA	2	8	1253	1260	25 %	75 %	0 %	0 %	387826784
46	NC_017404	TCT	2	6	1371	1376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826784
47	NC_017404	TA	3	6	1384	1389	50 %	50 %	0 %	0 %	387826784
48	NC_017404	AATTT	2	10	1405	1414	40 %	60 %	0 %	0 %	387826784
49	NC_017404	T	7	7	1421	1427	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
50	NC_017404	ATT	2	6	1445	1450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826784
51	NC_017404	TCT	2	6	1476	1481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826784
52	NC_017404	T	9	9	1516	1524	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
53	NC_017404	A	6	6	1529	1534	100 %	0 %	0 %	0 %	387826784
54	NC_017404	TAA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826784
55	NC_017404	T	7	7	1585	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
56	NC_017404	A	7	7	1610	1616	100 %	0 %	0 %	0 %	387826784
57	NC_017404	T	6	6	1638	1643	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
58	NC_017404	T	6	6	1650	1655	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
59	NC_017404	T	8	8	1682	1689	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
60	NC_017404	AAC	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826784
61	NC_017404	TTATCT	2	12	1815	1826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826784
62	NC_017404	CT	3	6	1879	1884	0 %	50 %	0 %	50 %	387826784
63	NC_017404	GAT	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826784
64	NC_017404	TAT	2	6	1954	1959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826784
65	NC_017404	TTC	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826784
66	NC_017404	T	6	6	1998	2003	0 %	100 %	0 %	0 %	387826784
67	NC_017404	ATAA	2	8	2009	2016	75 %	25 %	0 %	0 %	387826784
68	NC_017404	TTGT	2	8	2137	2144	0 %	75 %	25 %	0 %	387826784
69	NC_017404	ATCCTT	2	12	2162	2173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387826784
70	NC_017404	TAA	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017404	AAAT	2	8	2281	2288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017404	TGT	2	6	2297	2302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017404	T	6	6	2335	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017404	T	6	6	2349	2354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017404	T	6	6	2369	2374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017404	TAT	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017404	CCTTA	2	10	2391	2400	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017404	AAT	2	6	2429	2434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017404	TTA	2	6	2447	2452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017404	T	6	6	2474	2479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017404	T	6	6	2481	2486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017404	AAGCA	2	10	2504	2513	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017404	TCT	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017404	TAA	2	6	2552	2557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017404	ATT	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017404	TAAA	2	8	2595	2602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017404	T	6	6	2653	2658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017404	TCT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017404	TCT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017404	ATA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017404	T	6	6	2813	2818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017404	AAT	3	9	2871	2879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017404	TTGC	2	8	2921	2928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017404	TTC	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017404	ATC	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017404	T	6	6	2982	2987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017404	TCT	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017404	TATCC	2	10	3002	3011	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017404	CTT	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017404	A	7	7	3049	3055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017404	GATA	2	8	3070	3077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017404	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017404	TAA	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017404	T	6	6	3164	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017404	TCT	2	6	3180	3185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017404	AATTC	2	10	3238	3247	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017404	TAA	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017404	TAT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017404	ACT	2	6	3308	3313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017404	AAT	2	6	3317	3322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017404	TAC	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017404	T	7	7	3408	3414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017404	ATAA	2	8	3427	3434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017404	AT	3	6	3455	3460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017404	AGT	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017404	AAC	2	6	3569	3574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017404	TTATAA	2	12	3631	3642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017404	TTTA	2	8	3652	3659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017404	AT	3	6	3779	3784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017404	TTATAT	2	12	3836	3847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017404	T	6	6	3866	3871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017404	ATT	2	6	3879	3884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017404	T	6	6	3883	3888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017404	A	6	6	3892	3897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017404	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017404	AT	3	6	3981	3986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017404	AAC	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017404	TAC	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017404	ACT	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017404	GTA	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017404	ATT	2	6	4162	4167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017404	A	7	7	4170	4176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017404	TTAAA	2	10	4184	4193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017404	A	6	6	4203	4208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017404	AGA	3	9	4255	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017404	TAA	3	9	4284	4292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017404	ATTT	2	8	4395	4402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017404	TACT	2	8	4406	4413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017404	T	7	7	4430	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017404	ATA	2	6	4446	4451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017404	TCT	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017404	AT	3	6	4534	4539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017404	TTA	2	6	4556	4561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017404	AT	3	6	4585	4590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017404	ATTTA	2	10	4594	4603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017404	A	6	6	4629	4634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017404	TAAAA	2	10	4636	4645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017404	TAAA	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017404	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017404	CAA	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017404	AAC	2	6	4738	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017404	T	7	7	4755	4761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017404	TAA	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_017404	AAC	2	6	15234	15239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_017404	CAC	3	9	15260	15268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
500	NC_017404	AGC	2	6	15270	15275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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