MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 chromosome

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017403	AAAACC	2	12	3254	3265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017403	ATAAAG	2	12	3527	3538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825665
3	NC_017403	AAGAAA	2	12	7150	7161	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387825667
4	NC_017403	CAATAG	2	12	8652	8663	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825669
5	NC_017403	CAATAA	2	12	9075	9086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825669
6	NC_017403	TCTATT	2	12	9107	9118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387825669
7	NC_017403	TTTAAT	2	12	9303	9314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825670
8	NC_017403	AATAAA	2	12	9515	9526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825670
9	NC_017403	TAAAGA	2	12	9941	9952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825670
10	NC_017403	TAAAAA	2	12	9985	9996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825670
11	NC_017403	TAAGCA	2	12	11826	11837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825673
12	NC_017403	AAAACA	2	12	13951	13962	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387825675
13	NC_017403	GAAAAA	2	12	15846	15857	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017403	CTAATA	2	12	15904	15915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017403	CTTGGG	2	12	16291	16302	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387825678
16	NC_017403	TTAAAA	2	12	16800	16811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825678
17	NC_017403	AAATTA	2	12	22462	22473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825684
18	NC_017403	TTCAAA	2	12	22500	22511	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825684
19	NC_017403	CAAATA	2	12	26973	26984	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825689
20	NC_017403	TCAAAC	2	12	28565	28576	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825692
21	NC_017403	ATTTAA	2	12	32010	32021	50 %	50 %	0 %	0 %	387825696
22	NC_017403	TCAATT	2	12	32087	32098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387825696
23	NC_017403	TATCAA	2	12	32670	32681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825696
24	NC_017403	AGAAGC	2	12	33580	33591	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387825696
25	NC_017403	TAAATT	2	12	37690	37701	50 %	50 %	0 %	0 %	387825699
26	NC_017403	ATTTTT	2	12	38536	38547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387825700
27	NC_017403	TAAATT	2	12	38800	38811	50 %	50 %	0 %	0 %	387825700
28	NC_017403	AATATA	2	12	39704	39715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825701
29	NC_017403	AAAATC	2	12	40927	40938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825702
30	NC_017403	TAAATT	2	12	43622	43633	50 %	50 %	0 %	0 %	387825705
31	NC_017403	AATTAA	2	12	45213	45224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017403	AAATAA	2	12	48225	48236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825710
33	NC_017403	TAAAAA	2	12	49496	49507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825712
34	NC_017403	TAAAAA	2	12	50295	50306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825713
35	NC_017403	TCAAAT	2	12	51306	51317	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825715
36	NC_017403	TTTAAA	2	12	54313	54324	50 %	50 %	0 %	0 %	387825717
37	NC_017403	TTAAAA	2	12	57191	57202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825721
38	NC_017403	AAATTT	2	12	57212	57223	50 %	50 %	0 %	0 %	387825721
39	NC_017403	AAAAAT	2	12	57532	57543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825721
40	NC_017403	AGAAAA	2	12	57694	57705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387825721
41	NC_017403	TGAAAA	2	12	65718	65729	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825730
42	NC_017403	ATTCAA	2	12	67642	67653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825731
43	NC_017403	AAAAAT	2	12	67732	67743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825731
44	NC_017403	ACTATC	2	12	68389	68400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825731
45	NC_017403	ATTCAA	2	12	68739	68750	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825731
46	NC_017403	ATAAAA	2	12	69493	69504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825732
47	NC_017403	TAATTT	2	12	69635	69646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825732
48	NC_017403	TGAAAA	2	12	70240	70251	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825733
49	NC_017403	ACCAAA	2	12	71386	71397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825734
50	NC_017403	AATTGA	2	12	72042	72053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825734
51	NC_017403	TAGAAA	2	12	72140	72151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825734
52	NC_017403	AATAGA	2	12	73176	73187	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825735
53	NC_017403	GAAAAC	2	12	73701	73712	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825736
54	NC_017403	CAATGA	2	12	74264	74275	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825736
55	NC_017403	ATTTCC	2	12	75360	75371	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387825737
56	NC_017403	TTGCTA	2	12	76088	76099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387825738
57	NC_017403	ATTCCA	2	12	76972	76983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825739
58	NC_017403	TGGAAT	2	12	77282	77293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825739
59	NC_017403	AAAAGA	2	12	77531	77542	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387825739
60	NC_017403	TCAATG	2	12	77932	77943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825740
61	NC_017403	CCATAG	2	12	78269	78280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387825740
62	NC_017403	CCATTC	2	12	78343	78354	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387825740
63	NC_017403	TAAATC	2	12	78474	78485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825740
64	NC_017403	AGGAAT	2	12	80077	80088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387825742
65	NC_017403	TTTTAT	2	12	80549	80560	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387825742
66	NC_017403	TACAAA	2	12	81164	81175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825743
67	NC_017403	ATTTTC	2	12	81417	81428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387825744
68	NC_017403	AATACT	2	12	85685	85696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017403	AGATAA	2	12	87832	87843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825749
70	NC_017403	CAATTT	2	12	88540	88551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387825749
71	NC_017403	CAGAAA	2	12	90521	90532	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825751
72	NC_017403	ACATCA	2	12	91942	91953	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825752
73	NC_017403	TCTTTT	2	12	95215	95226	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387825756
74	NC_017403	GAAATA	2	12	96145	96156	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825756
75	NC_017403	CAAAAT	2	12	97814	97825	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825758
76	NC_017403	AACATA	2	12	98394	98405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825758
77	NC_017403	TTAAAC	2	12	99884	99895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825759
78	NC_017403	TGGACT	2	12	99958	99969	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387825759
79	NC_017403	AAATTC	2	12	103623	103634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825763
80	NC_017403	GAAATA	2	12	105206	105217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017403	CAATAT	2	12	111776	111787	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825772
82	NC_017403	AAATAG	2	12	114378	114389	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825774
83	NC_017403	CATTAA	2	12	117053	117064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825777
84	NC_017403	AATTTT	2	12	117348	117359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825777
85	NC_017403	AAGATC	2	12	117696	117707	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825778
86	NC_017403	AAATCA	2	12	117763	117774	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825778
87	NC_017403	AATTTC	2	12	119702	119713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387825781
88	NC_017403	ACACAA	2	12	122290	122301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825784
89	NC_017403	AATTCT	2	12	124762	124773	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387825787
90	NC_017403	CATCAA	2	12	125136	125147	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825787
91	NC_017403	ATCCGA	2	12	128066	128077	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387825790
92	NC_017403	TGATAT	2	12	132161	132172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825792
93	NC_017403	ATTTTT	2	12	132523	132534	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387825793
94	NC_017403	ATCAAA	2	12	133318	133329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825793
95	NC_017403	TTAAAA	2	12	135230	135241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825794
96	NC_017403	ACAAAA	2	12	135533	135544	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387825794
97	NC_017403	AAAATA	2	12	135619	135630	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825794
98	NC_017403	AAACTA	2	12	136991	137002	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825795
99	NC_017403	ATTTCA	2	12	137810	137821	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387825796
100	NC_017403	ATTTTA	2	12	139765	139776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017403	AACTAA	2	12	142719	142730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825798
102	NC_017403	AAAAGA	2	12	144014	144025	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387825799
103	NC_017403	CCCTTA	2	12	144925	144936	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387825801
104	NC_017403	AAAAAT	2	12	145291	145302	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825801
105	NC_017403	AAATCA	2	12	146476	146487	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825803
106	NC_017403	TTTCAT	2	12	147167	147178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387825803
107	NC_017403	CATTGC	2	12	147555	147566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387825804
108	NC_017403	ATAGCA	2	12	148613	148624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017403	TCAACT	2	12	149605	149616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825805
110	NC_017403	CAAGAA	2	12	152524	152535	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825807
111	NC_017403	TTGGAA	2	12	152623	152634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825807
112	NC_017403	AATTCA	2	12	153424	153435	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825808
113	NC_017403	TTTGCT	2	12	154016	154027	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387825809
114	NC_017403	TTAAAT	2	12	154937	154948	50 %	50 %	0 %	0 %	387825809
115	NC_017403	AACTAC	2	12	155008	155019	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825809
116	NC_017403	TAAAAA	2	12	156610	156621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825810
117	NC_017403	AATACT	2	12	156743	156754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387825810
118	NC_017403	AATTAA	2	12	157088	157099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825810
119	NC_017403	ATTATA	2	12	157448	157459	50 %	50 %	0 %	0 %	387825810
120	NC_017403	TAAAAA	2	12	158344	158355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017403	CGAAAA	2	12	159307	159318	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825814
122	NC_017403	CTAGAA	2	12	160423	160434	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825815
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