MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 chromosome

Total Repeats: 1040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017403	TATAA	2	10	38	47	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017403	GCTTT	2	10	2272	2281	0 %	60 %	20 %	20 %	387825664
3	NC_017403	ATTGG	2	10	3601	3610	20 %	40 %	40 %	0 %	387825665
4	NC_017403	AGATT	2	10	3683	3692	40 %	40 %	20 %	0 %	387825665
5	NC_017403	AAAGA	2	10	4077	4086	80 %	0 %	20 %	0 %	387825665
6	NC_017403	TAGAG	2	10	4533	4542	40 %	20 %	40 %	0 %	387825665
7	NC_017403	GTAAT	2	10	4799	4808	40 %	40 %	20 %	0 %	387825665
8	NC_017403	ATTCC	2	10	5290	5299	20 %	40 %	0 %	40 %	387825666
9	NC_017403	ATTTT	2	10	5710	5719	20 %	80 %	0 %	0 %	387825666
10	NC_017403	GTATT	2	10	6128	6137	20 %	60 %	20 %	0 %	387825666
11	NC_017403	AAATC	2	10	6305	6314	60 %	20 %	0 %	20 %	387825666
12	NC_017403	ACAAT	2	10	7326	7335	60 %	20 %	0 %	20 %	387825667
13	NC_017403	CCCTT	2	10	8093	8102	0 %	40 %	0 %	60 %	387825668
14	NC_017403	ATTAT	2	10	8145	8154	40 %	60 %	0 %	0 %	387825668
15	NC_017403	AATTT	2	10	8327	8336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017403	AAAAT	2	10	9970	9979	80 %	20 %	0 %	0 %	387825670
17	NC_017403	TTAAA	2	10	10308	10317	60 %	40 %	0 %	0 %	387825671
18	NC_017403	ATAAA	2	10	10401	10410	80 %	20 %	0 %	0 %	387825671
19	NC_017403	CAAAA	2	10	10844	10853	80 %	0 %	0 %	20 %	387825672
20	NC_017403	AAAAG	2	10	11338	11347	80 %	0 %	20 %	0 %	387825672
21	NC_017403	TTCAT	2	10	11713	11722	20 %	60 %	0 %	20 %	387825673
22	NC_017403	ACTTA	2	10	12518	12527	40 %	40 %	0 %	20 %	387825674
23	NC_017403	CAAAT	2	10	12670	12679	60 %	20 %	0 %	20 %	387825674
24	NC_017403	TAAAA	2	10	12939	12948	80 %	20 %	0 %	0 %	387825675
25	NC_017403	AACAT	2	10	12989	12998	60 %	20 %	0 %	20 %	387825675
26	NC_017403	AATAT	2	10	14602	14611	60 %	40 %	0 %	0 %	387825675
27	NC_017403	AAAAG	2	10	14658	14667	80 %	0 %	20 %	0 %	387825675
28	NC_017403	AAAAT	2	10	16229	16238	80 %	20 %	0 %	0 %	387825678
29	NC_017403	ATGAT	2	10	16247	16256	40 %	40 %	20 %	0 %	387825678
30	NC_017403	ATCTA	2	10	17355	17364	40 %	40 %	0 %	20 %	387825679
31	NC_017403	TATCA	2	10	17781	17790	40 %	40 %	0 %	20 %	387825679
32	NC_017403	AAAGA	2	10	18096	18105	80 %	0 %	20 %	0 %	387825680
33	NC_017403	CAATC	2	10	18550	18559	40 %	20 %	0 %	40 %	387825681
34	NC_017403	TAAAC	2	10	19884	19893	60 %	20 %	0 %	20 %	387825681
35	NC_017403	TAAAT	2	10	20016	20025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017403	AAACT	2	10	22526	22535	60 %	20 %	0 %	20 %	387825684
37	NC_017403	AATTA	2	10	22583	22592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017403	ACAAT	2	10	22796	22805	60 %	20 %	0 %	20 %	387825685
39	NC_017403	AAATA	2	10	23763	23772	80 %	20 %	0 %	0 %	387825685
40	NC_017403	ATTTT	2	10	23921	23930	20 %	80 %	0 %	0 %	387825686
41	NC_017403	AAAAT	2	10	28751	28760	80 %	20 %	0 %	0 %	387825692
42	NC_017403	TTAAA	2	10	29428	29437	60 %	40 %	0 %	0 %	387825693
43	NC_017403	AAATA	2	10	31314	31323	80 %	20 %	0 %	0 %	387825694
44	NC_017403	CAAAA	2	10	31914	31923	80 %	0 %	0 %	20 %	387825695
45	NC_017403	TGTCT	2	10	32338	32347	0 %	60 %	20 %	20 %	387825696
46	NC_017403	TTTGA	2	10	32510	32519	20 %	60 %	20 %	0 %	387825696
47	NC_017403	TCACT	2	10	33057	33066	20 %	40 %	0 %	40 %	387825696
48	NC_017403	ATTTC	2	10	35497	35506	20 %	60 %	0 %	20 %	387825697
49	NC_017403	TAAAT	2	10	35704	35713	60 %	40 %	0 %	0 %	387825698
50	NC_017403	AATAA	2	10	36769	36778	80 %	20 %	0 %	0 %	387825699
51	NC_017403	GCAAA	2	10	38004	38013	60 %	0 %	20 %	20 %	387825700
52	NC_017403	TAAGC	2	10	38332	38341	40 %	20 %	20 %	20 %	387825700
53	NC_017403	TAAGT	2	10	40610	40619	40 %	40 %	20 %	0 %	387825702
54	NC_017403	TATCA	2	10	41275	41284	40 %	40 %	0 %	20 %	387825702
55	NC_017403	ATCTT	2	10	41317	41326	20 %	60 %	0 %	20 %	387825703
56	NC_017403	AATTT	2	10	42042	42051	40 %	60 %	0 %	0 %	387825703
57	NC_017403	AAACT	2	10	42707	42716	60 %	20 %	0 %	20 %	387825704
58	NC_017403	GATTT	2	10	43840	43849	20 %	60 %	20 %	0 %	387825705
59	NC_017403	TCTTT	2	10	44164	44173	0 %	80 %	0 %	20 %	387825705
60	NC_017403	AAATT	2	10	45558	45567	60 %	40 %	0 %	0 %	387825706
61	NC_017403	AATAC	2	10	48314	48323	60 %	20 %	0 %	20 %	387825710
62	NC_017403	ACTAT	2	10	48782	48791	40 %	40 %	0 %	20 %	387825711
63	NC_017403	AAATT	2	10	49113	49122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017403	TAAAT	2	10	51197	51206	60 %	40 %	0 %	0 %	387825715
65	NC_017403	GAATT	2	10	51448	51457	40 %	40 %	20 %	0 %	387825715
66	NC_017403	TCCTA	2	10	55973	55982	20 %	40 %	0 %	40 %	387825718
67	NC_017403	AATTA	2	10	56656	56665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017403	ATTTT	2	10	59225	59234	20 %	80 %	0 %	0 %	387825723
69	NC_017403	TTAAA	2	10	59250	59259	60 %	40 %	0 %	0 %	387825723
70	NC_017403	ATTTT	2	10	60193	60202	20 %	80 %	0 %	0 %	387825724
71	NC_017403	TTATT	2	10	60415	60424	20 %	80 %	0 %	0 %	387825725
72	NC_017403	ATTCA	2	10	61491	61500	40 %	40 %	0 %	20 %	387825726
73	NC_017403	GATTT	2	10	62359	62368	20 %	60 %	20 %	0 %	387825726
74	NC_017403	TACAA	2	10	62894	62903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017403	CATTA	2	10	63196	63205	40 %	40 %	0 %	20 %	387825727
76	NC_017403	GTCTT	2	10	65178	65187	0 %	60 %	20 %	20 %	387825729
77	NC_017403	ACAAA	2	10	66023	66032	80 %	0 %	0 %	20 %	387825730
78	NC_017403	CTTTT	2	10	66979	66988	0 %	80 %	0 %	20 %	387825730
79	NC_017403	AATAA	2	10	68054	68063	80 %	20 %	0 %	0 %	387825731
80	NC_017403	TTTAT	2	10	69931	69940	20 %	80 %	0 %	0 %	387825732
81	NC_017403	ATAAA	2	10	70203	70212	80 %	20 %	0 %	0 %	387825733
82	NC_017403	AAAAG	2	10	71370	71379	80 %	0 %	20 %	0 %	387825734
83	NC_017403	CTATT	2	10	71898	71907	20 %	60 %	0 %	20 %	387825734
84	NC_017403	TGATA	2	10	74117	74126	40 %	40 %	20 %	0 %	387825736
85	NC_017403	TAAAA	2	10	74906	74915	80 %	20 %	0 %	0 %	387825737
86	NC_017403	AAAAT	2	10	74986	74995	80 %	20 %	0 %	0 %	387825737
87	NC_017403	TAATA	2	10	76119	76128	60 %	40 %	0 %	0 %	387825738
88	NC_017403	TCAAA	3	15	76743	76757	60 %	20 %	0 %	20 %	387825739
89	NC_017403	TAAAC	2	10	78591	78600	60 %	20 %	0 %	20 %	387825740
90	NC_017403	ATTTT	2	10	78790	78799	20 %	80 %	0 %	0 %	387825740
91	NC_017403	AAATT	2	10	79803	79812	60 %	40 %	0 %	0 %	387825742
92	NC_017403	ATTTT	2	10	80292	80301	20 %	80 %	0 %	0 %	387825742
93	NC_017403	AAAAT	2	10	80819	80828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017403	AAGTA	2	10	80873	80882	60 %	20 %	20 %	0 %	387825743
95	NC_017403	ATTTA	2	10	80984	80993	40 %	60 %	0 %	0 %	387825743
96	NC_017403	CAAAG	2	10	81062	81071	60 %	0 %	20 %	20 %	387825743
97	NC_017403	ATTAT	2	10	81816	81825	40 %	60 %	0 %	0 %	387825744
98	NC_017403	TGATT	2	10	82621	82630	20 %	60 %	20 %	0 %	387825744
99	NC_017403	ATTAA	2	10	83783	83792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017403	AATAA	2	10	84539	84548	80 %	20 %	0 %	0 %	387825746
101	NC_017403	TAAAT	2	10	84608	84617	60 %	40 %	0 %	0 %	387825746
102	NC_017403	TCTTT	2	10	84948	84957	0 %	80 %	0 %	20 %	387825746
103	NC_017403	GCAAA	2	10	86674	86683	60 %	0 %	20 %	20 %	387825747
104	NC_017403	CTTTT	2	10	87761	87770	0 %	80 %	0 %	20 %	387825749
105	NC_017403	ACCAA	2	10	87926	87935	60 %	0 %	0 %	40 %	387825749
106	NC_017403	CTTTT	2	10	88204	88213	0 %	80 %	0 %	20 %	387825749
107	NC_017403	ATCTC	2	10	88407	88416	20 %	40 %	0 %	40 %	387825749
108	NC_017403	AAATT	2	10	88518	88527	60 %	40 %	0 %	0 %	387825749
109	NC_017403	TTAAT	2	10	89643	89652	40 %	60 %	0 %	0 %	387825750
110	NC_017403	GGCAT	2	10	93694	93703	20 %	20 %	40 %	20 %	387825754
111	NC_017403	ATAAA	2	10	93956	93965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017403	TTAAA	2	10	94459	94468	60 %	40 %	0 %	0 %	387825756
113	NC_017403	TAATA	2	10	94620	94629	60 %	40 %	0 %	0 %	387825756
114	NC_017403	TTCAA	2	10	96349	96358	40 %	40 %	0 %	20 %	387825756
115	NC_017403	AATGA	2	10	97053	97062	60 %	20 %	20 %	0 %	387825757
116	NC_017403	AATCA	2	10	98094	98103	60 %	20 %	0 %	20 %	387825758
117	NC_017403	ATTTA	2	10	98238	98247	40 %	60 %	0 %	0 %	387825758
118	NC_017403	AAAGT	2	10	98525	98534	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017403	AAAAG	2	10	98994	99003	80 %	0 %	20 %	0 %	387825759
120	NC_017403	CACGC	2	10	99378	99387	20 %	0 %	20 %	60 %	387825759
121	NC_017403	GGCTC	2	10	99935	99944	0 %	20 %	40 %	40 %	387825759
122	NC_017403	ATAAA	2	10	101285	101294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017403	CCAAG	2	10	101957	101966	40 %	0 %	20 %	40 %	387825762
124	NC_017403	ACCCA	2	10	102037	102046	40 %	0 %	0 %	60 %	387825762
125	NC_017403	ATCAA	2	10	103490	103499	60 %	20 %	0 %	20 %	387825763
126	NC_017403	TTAGT	2	10	103611	103620	20 %	60 %	20 %	0 %	387825763
127	NC_017403	GCATT	2	10	104689	104698	20 %	40 %	20 %	20 %	387825764
128	NC_017403	AAGCA	2	10	105303	105312	60 %	0 %	20 %	20 %	387825765
129	NC_017403	TTTTA	2	10	105734	105743	20 %	80 %	0 %	0 %	387825766
130	NC_017403	CATAA	2	10	106744	106753	60 %	20 %	0 %	20 %	387825766
131	NC_017403	TTATA	2	10	107005	107014	40 %	60 %	0 %	0 %	387825767
132	NC_017403	AATCT	2	10	107634	107643	40 %	40 %	0 %	20 %	387825767
133	NC_017403	ATTAC	2	10	107856	107865	40 %	40 %	0 %	20 %	387825767
134	NC_017403	TACAA	2	10	108059	108068	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017403	CTTAT	2	10	108719	108728	20 %	60 %	0 %	20 %	387825768
136	NC_017403	ATCAA	2	10	108820	108829	60 %	20 %	0 %	20 %	387825768
137	NC_017403	TATCT	2	10	110799	110808	20 %	60 %	0 %	20 %	387825769
138	NC_017403	TAATA	2	10	112938	112947	60 %	40 %	0 %	0 %	387825774
139	NC_017403	AATAA	2	10	114124	114133	80 %	20 %	0 %	0 %	387825774
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