MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp26

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017401	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827985
2	NC_017401	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827985
3	NC_017401	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827985
4	NC_017401	ATT	2	6	222	227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827985
5	NC_017401	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827985
6	NC_017401	TGT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827986
7	NC_017401	CTG	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827986
8	NC_017401	TTA	2	6	769	774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017401	ATT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
10	NC_017401	ATC	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827987
11	NC_017401	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827987
12	NC_017401	TAT	2	6	1139	1144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
13	NC_017401	GTT	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827987
14	NC_017401	AAT	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827987
15	NC_017401	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
16	NC_017401	TAT	2	6	1361	1366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
17	NC_017401	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827987
18	NC_017401	AAC	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827987
19	NC_017401	ATT	2	6	1500	1505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
20	NC_017401	GAC	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827987
21	NC_017401	ATT	2	6	1663	1668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
22	NC_017401	TCA	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827987
23	NC_017401	TTC	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827987
24	NC_017401	TAT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
25	NC_017401	ATT	2	6	1972	1977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
26	NC_017401	ATT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
27	NC_017401	ATA	2	6	2295	2300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017401	TTA	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017401	ATA	2	6	2358	2363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017401	TAA	2	6	2515	2520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
31	NC_017401	AAT	3	9	2550	2558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
32	NC_017401	AAT	2	6	2654	2659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
33	NC_017401	ATA	2	6	2760	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
34	NC_017401	CAT	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827988
35	NC_017401	CAC	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827988
36	NC_017401	AAG	2	6	2990	2995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827988
37	NC_017401	AAT	2	6	2999	3004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
38	NC_017401	ATA	2	6	3034	3039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
39	NC_017401	ATT	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827988
40	NC_017401	CAA	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827988
41	NC_017401	CAG	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827988
42	NC_017401	AGC	2	6	3305	3310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827988
43	NC_017401	AAT	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
44	NC_017401	AGC	2	6	3395	3400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827988
45	NC_017401	TCC	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827988
46	NC_017401	ACA	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827988
47	NC_017401	ATA	2	6	3540	3545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
48	NC_017401	AGT	2	6	3767	3772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827988
49	NC_017401	TCC	2	6	3805	3810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017401	TAT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017401	TAA	2	6	3922	3927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017401	ATA	2	6	3950	3955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017401	TAA	2	6	3978	3983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017401	ATT	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017401	ATA	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017401	ATT	2	6	4045	4050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017401	AGA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827989
58	NC_017401	TGT	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827989
59	NC_017401	ATA	2	6	4277	4282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827989
60	NC_017401	GAA	2	6	4382	4387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827989
61	NC_017401	ATA	2	6	4406	4411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827989
62	NC_017401	TAC	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017401	CAA	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827990
64	NC_017401	GTT	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827990
65	NC_017401	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827990
66	NC_017401	CAC	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827990
67	NC_017401	TAA	2	6	4614	4619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827990
68	NC_017401	GAA	2	6	4630	4635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827990
69	NC_017401	AAT	2	6	4665	4670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827990
70	NC_017401	ATT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
71	NC_017401	TAT	2	6	4952	4957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
72	NC_017401	ATT	2	6	5029	5034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
73	NC_017401	GAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827991
74	NC_017401	AAT	2	6	5168	5173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
75	NC_017401	ACA	2	6	5265	5270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827991
76	NC_017401	ATT	2	6	5284	5289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
77	NC_017401	TTA	2	6	5308	5313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
78	NC_017401	TAA	2	6	5318	5323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
79	NC_017401	AGA	2	6	5327	5332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827991
80	NC_017401	AAG	2	6	5353	5358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827991
81	NC_017401	AAG	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827991
82	NC_017401	AAT	2	6	5558	5563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
83	NC_017401	TAC	2	6	5634	5639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827991
84	NC_017401	AAT	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
85	NC_017401	TTC	2	6	5702	5707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827991
86	NC_017401	AAT	2	6	5760	5765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
87	NC_017401	ATG	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827991
88	NC_017401	ATA	2	6	5847	5852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
89	NC_017401	TAA	2	6	5871	5876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017401	ATA	3	9	5919	5927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827992
91	NC_017401	AGA	2	6	5997	6002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827992
92	NC_017401	ATT	2	6	6018	6023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827992
93	NC_017401	GTC	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827992
94	NC_017401	ATA	2	6	6073	6078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827992
95	NC_017401	TAA	2	6	6231	6236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827992
96	NC_017401	ATT	2	6	6276	6281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827992
97	NC_017401	AAT	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827992
98	NC_017401	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827992
99	NC_017401	TAA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827992
100	NC_017401	GAA	2	6	6445	6450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827992
101	NC_017401	TAA	2	6	6479	6484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827992
102	NC_017401	TAA	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017401	ATT	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017401	AAG	2	6	6790	6795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827993
105	NC_017401	AAT	2	6	6800	6805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827993
106	NC_017401	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827993
107	NC_017401	TCA	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827993
108	NC_017401	GAA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827993
109	NC_017401	ATT	2	6	6952	6957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827993
110	NC_017401	TAA	2	6	6995	7000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827993
111	NC_017401	ATT	2	6	7005	7010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827993
112	NC_017401	TAA	2	6	7127	7132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827993
113	NC_017401	ATA	2	6	7210	7215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827993
114	NC_017401	ATT	2	6	7270	7275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827993
115	NC_017401	ATT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827993
116	NC_017401	ATT	2	6	7357	7362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827993
117	NC_017401	ATG	2	6	7441	7446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827993
118	NC_017401	CCT	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827993
119	NC_017401	CTT	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827993
120	NC_017401	AAG	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827993
121	NC_017401	CAA	2	6	7748	7753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017401	CAA	2	6	7851	7856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827994
123	NC_017401	TAA	2	6	7866	7871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827994
124	NC_017401	AGT	2	6	7872	7877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827994
125	NC_017401	ACT	2	6	7925	7930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827994
126	NC_017401	TGT	2	6	7962	7967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827994
127	NC_017401	ATA	2	6	8233	8238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827994
128	NC_017401	GAA	2	6	8239	8244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827994
129	NC_017401	TAA	2	6	8292	8297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827994
130	NC_017401	AGA	2	6	8415	8420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827994
131	NC_017401	GAA	2	6	8488	8493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827994
132	NC_017401	GAA	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827994
133	NC_017401	TAA	2	6	8609	8614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827994
134	NC_017401	TAA	2	6	8723	8728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827994
135	NC_017401	ATA	2	6	8771	8776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_017401	ATG	2	6	26193	26198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828010
393	NC_017401	GGA	2	6	26253	26258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387828010
394	NC_017401	ATA	2	6	26263	26268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828010
395	NC_017401	GGA	2	6	26406	26411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387828010
396	NC_017401	ATA	2	6	26419	26424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828010

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.