MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp9

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017399	ATAA	2	8	261	268	75 %	25 %	0 %	0 %	387826897
2	NC_017399	AGAT	2	8	557	564	50 %	25 %	25 %	0 %	387826897
3	NC_017399	AAGA	3	12	625	636	75 %	0 %	25 %	0 %	387826897
4	NC_017399	GAAA	2	8	839	846	75 %	0 %	25 %	0 %	387826897
5	NC_017399	GAAA	2	8	1038	1045	75 %	0 %	25 %	0 %	387826897
6	NC_017399	AAAC	2	8	1081	1088	75 %	0 %	0 %	25 %	387826897
7	NC_017399	AAAG	2	8	1353	1360	75 %	0 %	25 %	0 %	387826898
8	NC_017399	AACA	2	8	1443	1450	75 %	0 %	0 %	25 %	387826898
9	NC_017399	AATA	2	8	1571	1578	75 %	25 %	0 %	0 %	387826898
10	NC_017399	AGAT	2	8	1717	1724	50 %	25 %	25 %	0 %	387826898
11	NC_017399	GATA	2	8	1940	1947	50 %	25 %	25 %	0 %	387826899
12	NC_017399	AAAG	2	8	2268	2275	75 %	0 %	25 %	0 %	387826899
13	NC_017399	GTAA	2	8	2475	2482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017399	TTTA	2	8	3406	3413	25 %	75 %	0 %	0 %	387826900
15	NC_017399	AAAT	2	8	3722	3729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017399	CTAT	2	8	3800	3807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017399	TTTG	2	8	3883	3890	0 %	75 %	25 %	0 %	387826901
18	NC_017399	TCTT	2	8	3918	3925	0 %	75 %	0 %	25 %	387826901
19	NC_017399	ATTT	2	8	4093	4100	25 %	75 %	0 %	0 %	387826901
20	NC_017399	TTAA	2	8	4257	4264	50 %	50 %	0 %	0 %	387826901
21	NC_017399	TAAA	2	8	5468	5475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017399	TAAA	2	8	5495	5502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017399	TTTA	2	8	5582	5589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017399	ATTA	2	8	5658	5665	50 %	50 %	0 %	0 %	387826903
25	NC_017399	TTTG	2	8	6255	6262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017399	TTAA	2	8	6277	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	387826904
27	NC_017399	AATT	2	8	6492	6499	50 %	50 %	0 %	0 %	387826904
28	NC_017399	ATTT	2	8	7159	7166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017399	AAGA	2	8	7241	7248	75 %	0 %	25 %	0 %	387826905
30	NC_017399	TACT	2	8	7250	7257	25 %	50 %	0 %	25 %	387826905
31	NC_017399	ATCT	2	8	7281	7288	25 %	50 %	0 %	25 %	387826905
32	NC_017399	TTTA	2	8	7444	7451	25 %	75 %	0 %	0 %	387826905
33	NC_017399	TATT	2	8	7599	7606	25 %	75 %	0 %	0 %	387826905
34	NC_017399	GTTT	2	8	8292	8299	0 %	75 %	25 %	0 %	387826905
35	NC_017399	CTTA	2	8	8377	8384	25 %	50 %	0 %	25 %	387826905
36	NC_017399	TTAT	2	8	8462	8469	25 %	75 %	0 %	0 %	387826905

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.