MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017397	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387825623
2	NC_017397	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387825623
3	NC_017397	AG	4	8	1178	1185	50 %	0 %	50 %	0 %	387825623
4	NC_017397	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	387825624
5	NC_017397	GT	3	6	2302	2307	0 %	50 %	50 %	0 %	387825625
6	NC_017397	CA	3	6	2501	2506	50 %	0 %	0 %	50 %	387825625
7	NC_017397	TA	3	6	2967	2972	50 %	50 %	0 %	0 %	387825626
8	NC_017397	AT	3	6	3181	3186	50 %	50 %	0 %	0 %	387825626
9	NC_017397	AT	3	6	4274	4279	50 %	50 %	0 %	0 %	387825628
10	NC_017397	TG	3	6	5383	5388	0 %	50 %	50 %	0 %	387825629
11	NC_017397	AG	3	6	5524	5529	50 %	0 %	50 %	0 %	387825630
12	NC_017397	AT	3	6	5917	5922	50 %	50 %	0 %	0 %	387825631
13	NC_017397	TA	3	6	5933	5938	50 %	50 %	0 %	0 %	387825631
14	NC_017397	AT	4	8	6409	6416	50 %	50 %	0 %	0 %	387825632
15	NC_017397	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	387825632
16	NC_017397	AC	3	6	7051	7056	50 %	0 %	0 %	50 %	387825633
17	NC_017397	TA	3	6	7499	7504	50 %	50 %	0 %	0 %	387825633
18	NC_017397	AG	3	6	9170	9175	50 %	0 %	50 %	0 %	387825637
19	NC_017397	AT	3	6	9801	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	387825637
20	NC_017397	AT	3	6	9930	9935	50 %	50 %	0 %	0 %	387825637
21	NC_017397	TA	3	6	10179	10184	50 %	50 %	0 %	0 %	387825637
22	NC_017397	TA	3	6	10692	10697	50 %	50 %	0 %	0 %	387825638
23	NC_017397	AT	3	6	11222	11227	50 %	50 %	0 %	0 %	387825639
24	NC_017397	AT	4	8	11537	11544	50 %	50 %	0 %	0 %	387825639
25	NC_017397	AC	3	6	11730	11735	50 %	0 %	0 %	50 %	387825639
26	NC_017397	AC	3	6	11745	11750	50 %	0 %	0 %	50 %	387825639
27	NC_017397	CA	3	6	12113	12118	50 %	0 %	0 %	50 %	387825640
28	NC_017397	TA	3	6	12236	12241	50 %	50 %	0 %	0 %	387825640
29	NC_017397	AT	3	6	12557	12562	50 %	50 %	0 %	0 %	387825641
30	NC_017397	CA	3	6	12788	12793	50 %	0 %	0 %	50 %	387825641
31	NC_017397	AT	4	8	13183	13190	50 %	50 %	0 %	0 %	387825642
32	NC_017397	AT	3	6	13870	13875	50 %	50 %	0 %	0 %	387825643
33	NC_017397	TA	3	6	15092	15097	50 %	50 %	0 %	0 %	387825644
34	NC_017397	AT	3	6	15111	15116	50 %	50 %	0 %	0 %	387825644
35	NC_017397	TA	3	6	15179	15184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017397	AT	3	6	15493	15498	50 %	50 %	0 %	0 %	387825646
37	NC_017397	AT	3	6	15903	15908	50 %	50 %	0 %	0 %	387825647
38	NC_017397	AT	3	6	16071	16076	50 %	50 %	0 %	0 %	387825647
39	NC_017397	AT	3	6	16376	16381	50 %	50 %	0 %	0 %	387825648
40	NC_017397	AT	3	6	16603	16608	50 %	50 %	0 %	0 %	387825649
41	NC_017397	TA	3	6	18664	18669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017397	AC	3	6	19119	19124	50 %	0 %	0 %	50 %	387825651
43	NC_017397	TA	3	6	20607	20612	50 %	50 %	0 %	0 %	387825652
44	NC_017397	AT	3	6	20886	20891	50 %	50 %	0 %	0 %	387825653
45	NC_017397	AG	3	6	21222	21227	50 %	0 %	50 %	0 %	387825653
46	NC_017397	AT	3	6	21725	21730	50 %	50 %	0 %	0 %	387825654
47	NC_017397	AT	3	6	22364	22369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017397	AT	3	6	22417	22422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017397	TA	3	6	22593	22598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017397	TA	3	6	23004	23009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017397	AG	3	6	23436	23441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017397	TA	3	6	23476	23481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017397	AG	3	6	23892	23897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017397	AT	3	6	24584	24589	50 %	50 %	0 %	0 %	387825655
55	NC_017397	AG	3	6	24905	24910	50 %	0 %	50 %	0 %	387825656
56	NC_017397	AT	3	6	25840	25845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017397	GA	3	6	25915	25920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017397	TA	3	6	25987	25992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017397	AT	3	6	26597	26602	50 %	50 %	0 %	0 %	387825657
60	NC_017397	TA	3	6	28052	28057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017397	CT	3	6	28058	28063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017397	TA	3	6	28076	28081	50 %	50 %	0 %	0 %	387825659
63	NC_017397	TG	3	6	28886	28891	0 %	50 %	50 %	0 %	387825660
64	NC_017397	AT	3	6	29228	29233	50 %	50 %	0 %	0 %	387825660
65	NC_017397	AT	3	6	29412	29417	50 %	50 %	0 %	0 %	387825661
66	NC_017397	AT	3	6	29752	29757	50 %	50 %	0 %	0 %	387825661
67	NC_017397	AG	3	6	30656	30661	50 %	0 %	50 %	0 %	387825661

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.