MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5

Total Repeats: 1596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017394	AAAGA	2	10	57449	57458	80 %	0 %	20 %	0 %	387825550
1502	NC_017394	A	6	6	57481	57486	100 %	0 %	0 %	0 %	387825550
1503	NC_017394	ATT	2	6	57593	57598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825550
1504	NC_017394	ACA	2	6	57608	57613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825550
1505	NC_017394	A	6	6	57613	57618	100 %	0 %	0 %	0 %	387825550
1506	NC_017394	TA	4	8	57621	57628	50 %	50 %	0 %	0 %	387825550
1507	NC_017394	AGA	2	6	57645	57650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825550
1508	NC_017394	GAA	2	6	57652	57657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825550
1509	NC_017394	ATT	2	6	57675	57680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825550
1510	NC_017394	TAAA	2	8	57722	57729	75 %	25 %	0 %	0 %	387825550
1511	NC_017394	ATA	2	6	57731	57736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825550
1512	NC_017394	A	6	6	57736	57741	100 %	0 %	0 %	0 %	387825550
1513	NC_017394	TAT	2	6	57742	57747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825550
1514	NC_017394	CCT	2	6	57763	57768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825550
1515	NC_017394	AGA	2	6	57801	57806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825550
1516	NC_017394	GAA	2	6	57871	57876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825550
1517	NC_017394	CAGT	2	8	57897	57904	25 %	25 %	25 %	25 %	387825550
1518	NC_017394	TAG	2	6	57960	57965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017394	T	7	7	57985	57991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017394	TGT	2	6	58071	58076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017394	TTAT	2	8	58077	58084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017394	CT	3	6	58088	58093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_017394	TGA	2	6	58129	58134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825551
1524	NC_017394	TA	3	6	58140	58145	50 %	50 %	0 %	0 %	387825551
1525	NC_017394	A	7	7	58153	58159	100 %	0 %	0 %	0 %	387825551
1526	NC_017394	A	6	6	58215	58220	100 %	0 %	0 %	0 %	387825551
1527	NC_017394	TAA	2	6	58260	58265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825551
1528	NC_017394	GAAAA	2	10	58321	58330	80 %	0 %	20 %	0 %	387825551
1529	NC_017394	A	6	6	58327	58332	100 %	0 %	0 %	0 %	387825551
1530	NC_017394	TAA	2	6	58335	58340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825551
1531	NC_017394	A	7	7	58339	58345	100 %	0 %	0 %	0 %	387825551
1532	NC_017394	AAGG	2	8	58376	58383	50 %	0 %	50 %	0 %	387825551
1533	NC_017394	ATTAGA	2	12	58480	58491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825551
1534	NC_017394	GAA	2	6	58511	58516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825551
1535	NC_017394	ATTTT	2	10	58526	58535	20 %	80 %	0 %	0 %	387825551
1536	NC_017394	TAT	2	6	58547	58552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825551
1537	NC_017394	ATGA	2	8	58583	58590	50 %	25 %	25 %	0 %	387825551
1538	NC_017394	AATT	2	8	58617	58624	50 %	50 %	0 %	0 %	387825551
1539	NC_017394	ACT	2	6	58651	58656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017394	AGC	2	6	58683	58688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017394	CAA	2	6	58708	58713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017394	AAG	2	6	58733	58738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017394	TAA	2	6	58760	58765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017394	A	6	6	58827	58832	100 %	0 %	0 %	0 %	387825552
1545	NC_017394	TGA	2	6	58847	58852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825552
1546	NC_017394	TGT	2	6	58856	58861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825552
1547	NC_017394	TG	3	6	58928	58933	0 %	50 %	50 %	0 %	387825552
1548	NC_017394	TAAA	2	8	59194	59201	75 %	25 %	0 %	0 %	387825552
1549	NC_017394	AGT	2	6	59205	59210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825552
1550	NC_017394	A	8	8	59211	59218	100 %	0 %	0 %	0 %	387825552
1551	NC_017394	CAAG	2	8	59219	59226	50 %	0 %	25 %	25 %	387825552
1552	NC_017394	AATT	2	8	59240	59247	50 %	50 %	0 %	0 %	387825552
1553	NC_017394	TGA	2	6	59264	59269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825552
1554	NC_017394	AT	3	6	59270	59275	50 %	50 %	0 %	0 %	387825552
1555	NC_017394	A	6	6	59322	59327	100 %	0 %	0 %	0 %	387825552
1556	NC_017394	AAAGCA	2	12	59350	59361	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387825552
1557	NC_017394	CAAA	2	8	59399	59406	75 %	0 %	0 %	25 %	387825553
1558	NC_017394	ACA	2	6	59414	59419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825553
1559	NC_017394	AAAT	2	8	59437	59444	75 %	25 %	0 %	0 %	387825553
1560	NC_017394	TTC	2	6	59482	59487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825553
1561	NC_017394	AATT	2	8	59488	59495	50 %	50 %	0 %	0 %	387825553
1562	NC_017394	GAA	2	6	59507	59512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825553
1563	NC_017394	A	7	7	59532	59538	100 %	0 %	0 %	0 %	387825553
1564	NC_017394	AAT	2	6	59561	59566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825553
1565	NC_017394	A	7	7	59568	59574	100 %	0 %	0 %	0 %	387825553
1566	NC_017394	GCG	2	6	59586	59591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387825553
1567	NC_017394	TAGC	2	8	59595	59602	25 %	25 %	25 %	25 %	387825553
1568	NC_017394	AAT	2	6	59678	59683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825553
1569	NC_017394	TAT	2	6	59686	59691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825553
1570	NC_017394	AT	3	6	59794	59799	50 %	50 %	0 %	0 %	387825553
1571	NC_017394	TGAT	2	8	59802	59809	25 %	50 %	25 %	0 %	387825553
1572	NC_017394	TGG	2	6	59830	59835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825553
1573	NC_017394	AGG	2	6	59928	59933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825553
1574	NC_017394	TAT	2	6	59965	59970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825553
1575	NC_017394	ATC	2	6	59988	59993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825553
1576	NC_017394	ATA	2	6	60024	60029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825553
1577	NC_017394	TA	3	6	60111	60116	50 %	50 %	0 %	0 %	387825553
1578	NC_017394	CAT	2	6	60126	60131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825553
1579	NC_017394	AGCA	2	8	60163	60170	50 %	0 %	25 %	25 %	387825553
1580	NC_017394	AAAT	2	8	60189	60196	75 %	25 %	0 %	0 %	387825553
1581	NC_017394	TGA	2	6	60202	60207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825553
1582	NC_017394	TGA	2	6	60295	60300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825553
1583	NC_017394	TAT	2	6	60305	60310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825553
1584	NC_017394	TAT	2	6	60352	60357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825553
1585	NC_017394	ATA	2	6	60420	60425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825553
1586	NC_017394	TGG	2	6	60436	60441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825553
1587	NC_017394	ATA	2	6	60471	60476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825553
1588	NC_017394	TAA	2	6	60517	60522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825553
1589	NC_017394	AAC	2	6	60535	60540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825553
1590	NC_017394	A	6	6	60563	60568	100 %	0 %	0 %	0 %	387825553
1591	NC_017394	AGT	2	6	60587	60592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825553
1592	NC_017394	ATA	2	6	60630	60635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825553
1593	NC_017394	ATG	3	9	60642	60650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825553
1594	NC_017394	GCA	2	6	60668	60673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825553
1595	NC_017394	TGT	2	6	60681	60686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825553
1596	NC_017394	AG	3	6	60698	60703	50 %	0 %	50 %	0 %	387825553

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.