MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5

Total Repeats: 1596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017394	CAAG	2	8	40278	40285	50 %	0 %	25 %	25 %	387825530
1002	NC_017394	GTG	2	6	40375	40380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825530
1003	NC_017394	AGC	2	6	40386	40391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825530
1004	NC_017394	CTA	2	6	40452	40457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825530
1005	NC_017394	A	6	6	40457	40462	100 %	0 %	0 %	0 %	387825530
1006	NC_017394	AT	3	6	40481	40486	50 %	50 %	0 %	0 %	387825530
1007	NC_017394	AGA	2	6	40487	40492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825530
1008	NC_017394	GAT	2	6	40550	40555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825530
1009	NC_017394	A	7	7	40592	40598	100 %	0 %	0 %	0 %	387825530
1010	NC_017394	CTG	2	6	40606	40611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825530
1011	NC_017394	ACT	2	6	40665	40670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825530
1012	NC_017394	TCA	2	6	40693	40698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825530
1013	NC_017394	AGA	2	6	40699	40704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825530
1014	NC_017394	TAAC	2	8	40705	40712	50 %	25 %	0 %	25 %	387825530
1015	NC_017394	ACTTT	2	10	40723	40732	20 %	60 %	0 %	20 %	387825530
1016	NC_017394	TGT	2	6	40742	40747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825530
1017	NC_017394	T	7	7	40754	40760	0 %	100 %	0 %	0 %	387825530
1018	NC_017394	TGGT	2	8	40795	40802	0 %	50 %	50 %	0 %	387825530
1019	NC_017394	T	6	6	40806	40811	0 %	100 %	0 %	0 %	387825530
1020	NC_017394	ACCTAA	2	12	40841	40852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825530
1021	NC_017394	AATCAA	2	12	40863	40874	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387825530
1022	NC_017394	A	7	7	40932	40938	100 %	0 %	0 %	0 %	387825531
1023	NC_017394	TAA	3	9	40970	40978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825531
1024	NC_017394	GAAAA	2	10	41001	41010	80 %	0 %	20 %	0 %	387825531
1025	NC_017394	A	7	7	41007	41013	100 %	0 %	0 %	0 %	387825531
1026	NC_017394	A	6	6	41020	41025	100 %	0 %	0 %	0 %	387825531
1027	NC_017394	AGAA	2	8	41041	41048	75 %	0 %	25 %	0 %	387825531
1028	NC_017394	AAT	2	6	41066	41071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825531
1029	NC_017394	TAA	2	6	41080	41085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825531
1030	NC_017394	T	6	6	41117	41122	0 %	100 %	0 %	0 %	387825531
1031	NC_017394	T	6	6	41175	41180	0 %	100 %	0 %	0 %	387825531
1032	NC_017394	A	6	6	41189	41194	100 %	0 %	0 %	0 %	387825531
1033	NC_017394	GTT	2	6	41224	41229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825531
1034	NC_017394	ATT	2	6	41248	41253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825531
1035	NC_017394	TA	3	6	41338	41343	50 %	50 %	0 %	0 %	387825531
1036	NC_017394	CTTT	2	8	41352	41359	0 %	75 %	0 %	25 %	387825531
1037	NC_017394	AAC	2	6	41419	41424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825531
1038	NC_017394	TGA	2	6	41534	41539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825531
1039	NC_017394	AGTT	2	8	41546	41553	25 %	50 %	25 %	0 %	387825531
1040	NC_017394	A	6	6	41602	41607	100 %	0 %	0 %	0 %	387825531
1041	NC_017394	TAC	2	6	41614	41619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825532
1042	NC_017394	AT	3	6	41653	41658	50 %	50 %	0 %	0 %	387825532
1043	NC_017394	A	7	7	41660	41666	100 %	0 %	0 %	0 %	387825532
1044	NC_017394	GAA	2	6	41691	41696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825532
1045	NC_017394	ATC	2	6	41709	41714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825532
1046	NC_017394	CGA	2	6	41831	41836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825532
1047	NC_017394	AT	3	6	41862	41867	50 %	50 %	0 %	0 %	387825532
1048	NC_017394	A	7	7	41887	41893	100 %	0 %	0 %	0 %	387825532
1049	NC_017394	CCT	2	6	41925	41930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825532
1050	NC_017394	TTA	2	6	41982	41987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825532
1051	NC_017394	CTT	2	6	41999	42004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825532
1052	NC_017394	GGCA	2	8	42017	42024	25 %	0 %	50 %	25 %	387825532
1053	NC_017394	AAG	2	6	42025	42030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825532
1054	NC_017394	AGG	2	6	42058	42063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825532
1055	NC_017394	ATT	2	6	42126	42131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825532
1056	NC_017394	TA	3	6	42261	42266	50 %	50 %	0 %	0 %	387825532
1057	NC_017394	A	6	6	42266	42271	100 %	0 %	0 %	0 %	387825532
1058	NC_017394	AGA	2	6	42299	42304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825532
1059	NC_017394	CAA	2	6	42327	42332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825532
1060	NC_017394	A	8	8	42357	42364	100 %	0 %	0 %	0 %	387825532
1061	NC_017394	CA	3	6	42395	42400	50 %	0 %	0 %	50 %	387825532
1062	NC_017394	AGA	2	6	42524	42529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825532
1063	NC_017394	A	6	6	42549	42554	100 %	0 %	0 %	0 %	387825532
1064	NC_017394	TAGAAT	2	12	42565	42576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017394	ACA	2	6	42706	42711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017394	AAG	2	6	42717	42722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017394	CA	3	6	42761	42766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_017394	A	6	6	42766	42771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017394	TAC	2	6	42816	42821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017394	TCAA	2	8	42823	42830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_017394	CAT	2	6	42875	42880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017394	TA	3	6	42884	42889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017394	AATCT	2	10	42917	42926	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_017394	AAC	2	6	42976	42981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017394	A	7	7	43045	43051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017394	AATT	2	8	43095	43102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017394	GTTT	2	8	43115	43122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017394	AAT	2	6	43176	43181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825533
1079	NC_017394	TAA	2	6	43196	43201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825533
1080	NC_017394	TTG	2	6	43213	43218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825533
1081	NC_017394	TGA	2	6	43226	43231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825533
1082	NC_017394	CTC	2	6	43288	43293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825533
1083	NC_017394	GGACT	2	10	43299	43308	20 %	20 %	40 %	20 %	387825533
1084	NC_017394	A	6	6	43355	43360	100 %	0 %	0 %	0 %	387825533
1085	NC_017394	TAA	2	6	43399	43404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825533
1086	NC_017394	ACT	2	6	43413	43418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825533
1087	NC_017394	ACA	2	6	43426	43431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825533
1088	NC_017394	AT	3	6	43438	43443	50 %	50 %	0 %	0 %	387825533
1089	NC_017394	T	8	8	43446	43453	0 %	100 %	0 %	0 %	387825533
1090	NC_017394	TGA	2	6	43591	43596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825534
1091	NC_017394	ATT	2	6	43619	43624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825534
1092	NC_017394	TCT	2	6	43628	43633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825534
1093	NC_017394	GAA	3	9	43646	43654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825534
1094	NC_017394	TAAT	2	8	43656	43663	50 %	50 %	0 %	0 %	387825534
1095	NC_017394	T	7	7	43676	43682	0 %	100 %	0 %	0 %	387825534
1096	NC_017394	GCT	2	6	43712	43717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825534
1097	NC_017394	GAA	2	6	43721	43726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825534
1098	NC_017394	TCT	2	6	43733	43738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825534
1099	NC_017394	AT	3	6	43832	43837	50 %	50 %	0 %	0 %	387825534
1100	NC_017394	AAC	2	6	43927	43932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825534
1101	NC_017394	TACTT	2	10	43942	43951	20 %	60 %	0 %	20 %	387825534
1102	NC_017394	AGAAA	2	10	44019	44028	80 %	0 %	20 %	0 %	387825534
1103	NC_017394	AAAGT	2	10	44042	44051	60 %	20 %	20 %	0 %	387825534
1104	NC_017394	ATT	2	6	44120	44125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825534
1105	NC_017394	T	6	6	44171	44176	0 %	100 %	0 %	0 %	387825534
1106	NC_017394	A	8	8	44279	44286	100 %	0 %	0 %	0 %	387825534
1107	NC_017394	TGA	2	6	44305	44310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825534
1108	NC_017394	TAC	2	6	44316	44321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825534
1109	NC_017394	TAC	2	6	44329	44334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825534
1110	NC_017394	A	6	6	44364	44369	100 %	0 %	0 %	0 %	387825534
1111	NC_017394	AT	3	6	44517	44522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017394	T	6	6	44552	44557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017394	TGA	2	6	44634	44639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017394	TAC	2	6	44688	44693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017394	TAA	2	6	44732	44737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017394	AAAC	2	8	44738	44745	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_017394	TAC	2	6	44748	44753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017394	A	6	6	44790	44795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017394	AGAA	2	8	44808	44815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017394	TGC	2	6	44825	44830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017394	ATTCA	2	10	44849	44858	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_017394	ATT	2	6	44904	44909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017394	TAA	3	9	44933	44941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017394	AAC	2	6	44967	44972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017394	G	6	6	44975	44980	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017394	TGA	2	6	44990	44995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825535
1127	NC_017394	TGA	2	6	45014	45019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825535
1128	NC_017394	AGA	2	6	45020	45025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825535
1129	NC_017394	AAC	2	6	45066	45071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825535
1130	NC_017394	T	6	6	45077	45082	0 %	100 %	0 %	0 %	387825535
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1132	NC_017394	T	6	6	45131	45136	0 %	100 %	0 %	0 %	387825535
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