MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017393	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387825445
2	NC_017393	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387825445
3	NC_017393	AG	4	8	1175	1182	50 %	0 %	50 %	0 %	387825445
4	NC_017393	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387825446
5	NC_017393	TA	3	6	2966	2971	50 %	50 %	0 %	0 %	387825448
6	NC_017393	CT	3	6	3189	3194	0 %	50 %	0 %	50 %	387825448
7	NC_017393	TC	3	6	4313	4318	0 %	50 %	0 %	50 %	387825450
8	NC_017393	TG	3	6	5387	5392	0 %	50 %	50 %	0 %	387825451
9	NC_017393	AG	3	6	5528	5533	50 %	0 %	50 %	0 %	387825452
10	NC_017393	AT	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	387825453
11	NC_017393	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	387825453
12	NC_017393	AT	4	8	6413	6420	50 %	50 %	0 %	0 %	387825454
13	NC_017393	AT	3	6	6547	6552	50 %	50 %	0 %	0 %	387825454
14	NC_017393	AC	3	6	7055	7060	50 %	0 %	0 %	50 %	387825455
15	NC_017393	TA	3	6	7503	7508	50 %	50 %	0 %	0 %	387825455
16	NC_017393	AG	3	6	9176	9181	50 %	0 %	50 %	0 %	387825459
17	NC_017393	AT	3	6	9936	9941	50 %	50 %	0 %	0 %	387825459
18	NC_017393	TA	3	6	10725	10730	50 %	50 %	0 %	0 %	387825460
19	NC_017393	AT	3	6	11255	11260	50 %	50 %	0 %	0 %	387825461
20	NC_017393	AT	4	8	11570	11577	50 %	50 %	0 %	0 %	387825461
21	NC_017393	AC	3	6	11778	11783	50 %	0 %	0 %	50 %	387825461
22	NC_017393	CA	3	6	12146	12151	50 %	0 %	0 %	50 %	387825462
23	NC_017393	TA	3	6	12269	12274	50 %	50 %	0 %	0 %	387825462
24	NC_017393	AT	3	6	12824	12829	50 %	50 %	0 %	0 %	387825463
25	NC_017393	AT	3	6	13218	13223	50 %	50 %	0 %	0 %	387825464
26	NC_017393	AT	3	6	13903	13908	50 %	50 %	0 %	0 %	387825465
27	NC_017393	TA	3	6	15125	15130	50 %	50 %	0 %	0 %	387825466
28	NC_017393	AT	3	6	15144	15149	50 %	50 %	0 %	0 %	387825466
29	NC_017393	TA	3	6	15212	15217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017393	AT	3	6	15526	15531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017393	AT	3	6	15937	15942	50 %	50 %	0 %	0 %	387825468
32	NC_017393	AT	3	6	16105	16110	50 %	50 %	0 %	0 %	387825468
33	NC_017393	AT	3	6	16410	16415	50 %	50 %	0 %	0 %	387825469
34	NC_017393	TA	3	6	16563	16568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017393	AT	3	6	16637	16642	50 %	50 %	0 %	0 %	387825470
36	NC_017393	AT	3	6	16881	16886	50 %	50 %	0 %	0 %	387825470
37	NC_017393	AT	3	6	16935	16940	50 %	50 %	0 %	0 %	387825470
38	NC_017393	AT	3	6	16989	16994	50 %	50 %	0 %	0 %	387825470
39	NC_017393	AT	3	6	17823	17828	50 %	50 %	0 %	0 %	387825471
40	NC_017393	TA	3	6	19056	19061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017393	TA	3	6	21011	21016	50 %	50 %	0 %	0 %	387825474
42	NC_017393	AT	3	6	21261	21266	50 %	50 %	0 %	0 %	387825475
43	NC_017393	AT	3	6	21434	21439	50 %	50 %	0 %	0 %	387825475
44	NC_017393	AC	3	6	21630	21635	50 %	0 %	0 %	50 %	387825475
45	NC_017393	AT	3	6	22656	22661	50 %	50 %	0 %	0 %	387825477
46	NC_017393	AT	3	6	22776	22781	50 %	50 %	0 %	0 %	387825477
47	NC_017393	AT	3	6	23119	23124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017393	AT	5	10	23235	23244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017393	TA	3	6	23392	23397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017393	TA	3	6	23786	23791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017393	AG	3	6	23827	23832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017393	TA	3	6	23867	23872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017393	AG	3	6	24283	24288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017393	GA	3	6	25417	25422	50 %	0 %	50 %	0 %	387825479
55	NC_017393	TG	3	6	25575	25580	0 %	50 %	50 %	0 %	387825479
56	NC_017393	TG	3	6	26125	26130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017393	AT	3	6	26232	26237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017393	GA	3	6	26307	26312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017393	TA	3	6	26379	26384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017393	AG	3	6	26837	26842	50 %	0 %	50 %	0 %	387825480
61	NC_017393	TA	3	6	27257	27262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017393	CT	3	6	27263	27268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017393	TG	3	6	28091	28096	0 %	50 %	50 %	0 %	387825482
64	NC_017393	AT	3	6	28433	28438	50 %	50 %	0 %	0 %	387825482
65	NC_017393	AT	3	6	28617	28622	50 %	50 %	0 %	0 %	387825483
66	NC_017393	AT	3	6	28957	28962	50 %	50 %	0 %	0 %	387825483
67	NC_017393	AG	3	6	29861	29866	50 %	0 %	50 %	0 %	387825483

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.