MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) plasmid pTrp

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017260	AAT	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017260	TTA	2	6	236	241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017260	ATA	6	18	284	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017260	TAT	2	6	312	317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017260	TAT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017260	TAT	2	6	530	535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
7	NC_017260	TAT	2	6	571	576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
8	NC_017260	CAG	2	6	583	588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228025
9	NC_017260	TAA	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228025
10	NC_017260	AAT	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228025
11	NC_017260	TGA	2	6	800	805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228025
12	NC_017260	ATT	2	6	941	946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
13	NC_017260	TTA	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
14	NC_017260	AAG	2	6	1174	1179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228025
15	NC_017260	CAA	2	6	1227	1232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228025
16	NC_017260	AGT	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228025
17	NC_017260	AAT	2	6	1338	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228025
18	NC_017260	ATT	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
19	NC_017260	AAC	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228025
20	NC_017260	TAG	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228025
21	NC_017260	GGT	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228025
22	NC_017260	AGA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228025
23	NC_017260	ATA	2	6	2067	2072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228026
24	NC_017260	TGT	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228026
25	NC_017260	ATT	2	6	2159	2164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228026
26	NC_017260	AGA	2	6	2274	2279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228026
27	NC_017260	TGG	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228026
28	NC_017260	ACG	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228026
29	NC_017260	CTG	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228026
30	NC_017260	TAA	2	6	2692	2697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017260	AAT	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017260	AAT	2	6	2788	2793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017260	TAA	2	6	2825	2830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017260	ATG	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017260	TAT	3	9	3080	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017260	TTA	2	6	3132	3137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017260	AAT	2	6	3175	3180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017260	ATC	2	6	3192	3197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017260	AGA	2	6	3472	3477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017260	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017260	ACA	2	6	3617	3622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017260	AAC	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017260	AAT	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017260	ATT	2	6	3965	3970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017260	TCC	2	6	3981	3986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017260	GTA	2	6	4083	4088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017260	TAG	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017260	GGT	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017260	AGA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017260	ACA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017260	TGT	2	6	4724	4729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017260	ATT	2	6	4758	4763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017260	AGA	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.