MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) plasmid pLeu

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017257	TTA	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017257	TAT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017257	AAG	2	6	128	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017257	ATT	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017257	AAT	2	6	321	326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017257	ATA	3	9	367	375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228017
7	NC_017257	CTT	2	6	474	479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
8	NC_017257	TTC	3	9	509	517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
9	NC_017257	TTG	2	6	655	660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228017
10	NC_017257	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228017
11	NC_017257	GAA	2	6	914	919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228017
12	NC_017257	TCT	2	6	985	990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
13	NC_017257	AAG	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228017
14	NC_017257	TAT	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228017
15	NC_017257	GGT	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228017
16	NC_017257	TAG	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017257	ATT	2	6	1352	1357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017257	TTA	2	6	1370	1375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017257	ATA	3	9	1446	1454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017257	TAT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228018
21	NC_017257	CAA	2	6	1593	1598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228018
22	NC_017257	TAG	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228018
23	NC_017257	TAG	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228018
24	NC_017257	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228018
25	NC_017257	TCT	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228018
26	NC_017257	TTC	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228018
27	NC_017257	TAA	2	6	2011	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017257	TTC	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017257	TAT	2	6	2381	2386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228019
30	NC_017257	TAA	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
31	NC_017257	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
32	NC_017257	TAA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
33	NC_017257	ATA	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
34	NC_017257	ATA	3	9	2881	2889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
35	NC_017257	TCA	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017257	TGA	2	6	2951	2956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017257	TTA	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017257	ATT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017257	TTA	2	6	3037	3042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
40	NC_017257	TCA	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
41	NC_017257	ATA	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
42	NC_017257	TAG	2	6	3452	3457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
43	NC_017257	TAA	2	6	3496	3501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
44	NC_017257	TAA	2	6	3568	3573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
45	NC_017257	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
46	NC_017257	AGA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
47	NC_017257	AGA	2	6	3776	3781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
48	NC_017257	CTA	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
49	NC_017257	ATT	2	6	3837	3842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
50	NC_017257	TAA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
51	NC_017257	TAG	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
52	NC_017257	TTC	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228020
53	NC_017257	TCA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
54	NC_017257	AGA	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
55	NC_017257	TAG	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
56	NC_017257	TGC	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228020
57	NC_017257	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
58	NC_017257	CAA	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228020
59	NC_017257	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
60	NC_017257	TCT	2	6	4287	4292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228020
61	NC_017257	TTG	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228020
62	NC_017257	GAT	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
63	NC_017257	ATA	2	6	4516	4521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
64	NC_017257	TAA	2	6	4541	4546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
65	NC_017257	AAG	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228021
66	NC_017257	GAA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228021
67	NC_017257	GGA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228021
68	NC_017257	TTC	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228021
69	NC_017257	TAG	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228021
70	NC_017257	CTA	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228021
71	NC_017257	TAT	3	9	5370	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228021
72	NC_017257	TGA	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228021
73	NC_017257	ATA	2	6	5667	5672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228021
74	NC_017257	AAT	2	6	5733	5738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228021
75	NC_017257	GAA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228022
76	NC_017257	CTA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228022
77	NC_017257	TTA	2	6	6272	6277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228022
78	NC_017257	ATC	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228022
79	NC_017257	AGG	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228022
80	NC_017257	GAA	2	6	6382	6387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228022
81	NC_017257	TGA	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228022
82	NC_017257	CAC	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384228022
83	NC_017257	CAC	2	6	6596	6601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384228022
84	NC_017257	TAA	2	6	6672	6677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228022
85	NC_017257	AGA	2	6	6798	6803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228022
86	NC_017257	AGC	2	6	6810	6815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228022
87	NC_017257	ATA	2	6	6823	6828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228022
88	NC_017257	TTG	2	6	6863	6868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228022
89	NC_017257	GTT	2	6	6959	6964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228022
90	NC_017257	ATG	2	6	6998	7003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228022
91	NC_017257	CTA	2	6	7019	7024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228022
92	NC_017257	GTC	2	6	7043	7048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228022
93	NC_017257	AGG	2	6	7056	7061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228022
94	NC_017257	CAT	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228022
95	NC_017257	GCT	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228022
96	NC_017257	GCA	2	6	7096	7101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228022
97	NC_017257	ATA	2	6	7139	7144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228022
98	NC_017257	TAA	2	6	7152	7157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228022
99	NC_017257	TTG	2	6	7189	7194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228023
100	NC_017257	ATT	3	9	7227	7235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228023
101	NC_017257	TTA	2	6	7377	7382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228023
102	NC_017257	TAG	2	6	7435	7440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228023
103	NC_017257	TAA	3	9	7502	7510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228023
104	NC_017257	ACT	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228023
105	NC_017257	GAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228023
106	NC_017257	TTA	2	6	7658	7663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228023
107	NC_017257	TTA	2	6	7671	7676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228023
108	NC_017257	AAT	2	6	7677	7682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228023

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.