MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. JF98 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017254	AAAGA	2	10	85	94	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017254	TTTAA	2	10	204	213	40 %	60 %	0 %	0 %	384226397
3	NC_017254	TTAAT	2	10	1702	1711	40 %	60 %	0 %	0 %	384226397
4	NC_017254	ATTTT	2	10	2765	2774	20 %	80 %	0 %	0 %	384226398
5	NC_017254	TTTTA	2	10	2947	2956	20 %	80 %	0 %	0 %	384226398
6	NC_017254	AAAAT	2	10	5474	5483	80 %	20 %	0 %	0 %	384226402
7	NC_017254	ATTAA	2	10	6034	6043	60 %	40 %	0 %	0 %	384226402
8	NC_017254	ATGAA	2	10	7590	7599	60 %	20 %	20 %	0 %	384226404
9	NC_017254	TTTTC	2	10	9696	9705	0 %	80 %	0 %	20 %	384226406
10	NC_017254	TATAT	2	10	9872	9881	40 %	60 %	0 %	0 %	384226406
11	NC_017254	AAAAT	2	10	10598	10607	80 %	20 %	0 %	0 %	384226406
12	NC_017254	TAAGG	2	10	12216	12225	40 %	20 %	40 %	0 %	384226407
13	NC_017254	TTTTC	2	10	12610	12619	0 %	80 %	0 %	20 %	384226408
14	NC_017254	ATTTC	2	10	13396	13405	20 %	60 %	0 %	20 %	384226408
15	NC_017254	GATAA	2	10	13577	13586	60 %	20 %	20 %	0 %	384226408
16	NC_017254	ATATA	2	10	14090	14099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017254	TACAA	2	10	14757	14766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017254	TTTCT	2	10	15057	15066	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017254	TTAGT	2	10	15191	15200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017254	TATCT	2	10	16581	16590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017254	CAAAA	2	10	17578	17587	80 %	0 %	0 %	20 %	384226411
22	NC_017254	ATTAA	2	10	18311	18320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017254	TTTAT	2	10	20369	20378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017254	TATTT	2	10	20682	20691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017254	TACTT	2	10	20918	20927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017254	TATAT	2	10	20934	20943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017254	AACAA	2	10	21168	21177	80 %	0 %	0 %	20 %	384226414
28	NC_017254	ATTTG	2	10	22978	22987	20 %	60 %	20 %	0 %	384226416
29	NC_017254	ATTTT	2	10	23584	23593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017254	TAAAA	2	10	23697	23706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017254	TAATT	2	10	24053	24062	40 %	60 %	0 %	0 %	384226417
32	NC_017254	ATACA	2	10	24580	24589	60 %	20 %	0 %	20 %	384226417
33	NC_017254	TTTCT	2	10	27114	27123	0 %	80 %	0 %	20 %	384226418
34	NC_017254	TAAAC	2	10	27911	27920	60 %	20 %	0 %	20 %	384226419
35	NC_017254	AAAAT	2	10	28439	28448	80 %	20 %	0 %	0 %	384226419
36	NC_017254	AAAAT	2	10	29452	29461	80 %	20 %	0 %	0 %	384226420
37	NC_017254	TTTTA	2	10	30720	30729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017254	TTGTA	2	10	30883	30892	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017254	TGATA	2	10	30956	30965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017254	TATAA	2	10	33504	33513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017254	ATCCA	2	10	34061	34070	40 %	20 %	0 %	40 %	384226422
42	NC_017254	TAAAT	2	10	34664	34673	60 %	40 %	0 %	0 %	384226422
43	NC_017254	CTTGT	2	10	37411	37420	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017254	AAATA	2	10	38236	38245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017254	TACAT	2	10	39959	39968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017254	CTTTG	2	10	40270	40279	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017254	TGATC	2	10	40463	40472	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017254	TGTTT	2	10	41702	41711	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017254	TCCAT	2	10	42238	42247	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017254	ATTTT	2	10	43815	43824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017254	ATTTT	2	10	44804	44813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017254	TTTAT	2	10	45703	45712	20 %	80 %	0 %	0 %	384226426
53	NC_017254	GTCAT	2	10	46858	46867	20 %	40 %	20 %	20 %	384226428
54	NC_017254	ATAAA	2	10	47866	47875	80 %	20 %	0 %	0 %	384226429
55	NC_017254	TAAAA	2	10	48399	48408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017254	ATTAT	2	10	48907	48916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017254	GTATT	2	10	48971	48980	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017254	TTTAA	2	10	49017	49026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017254	ATATT	2	10	49415	49424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017254	ATTGT	2	10	49609	49618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017254	GAGCA	2	10	50712	50721	40 %	0 %	40 %	20 %	384226430
62	NC_017254	ATAAA	2	10	50783	50792	80 %	20 %	0 %	0 %	384226430
63	NC_017254	TTTAA	2	10	51066	51075	40 %	60 %	0 %	0 %	384226431
64	NC_017254	AATAA	2	10	51123	51132	80 %	20 %	0 %	0 %	384226431
65	NC_017254	TGTAA	2	10	52247	52256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017254	ATTGT	2	10	52664	52673	20 %	60 %	20 %	0 %	384226432
67	NC_017254	TAATT	2	10	53922	53931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017254	GGAAA	2	10	54577	54586	60 %	0 %	40 %	0 %	384226433
69	NC_017254	GGAAT	2	10	54656	54665	40 %	20 %	40 %	0 %	384226433
70	NC_017254	AATTA	2	10	57085	57094	60 %	40 %	0 %	0 %	384226435
71	NC_017254	ATTAA	2	10	57610	57619	60 %	40 %	0 %	0 %	384226436
72	NC_017254	ATCTA	2	10	57834	57843	40 %	40 %	0 %	20 %	384226436
73	NC_017254	GAAAA	2	10	58200	58209	80 %	0 %	20 %	0 %	384226437
74	NC_017254	CTTTA	2	10	58324	58333	20 %	60 %	0 %	20 %	384226437
75	NC_017254	ATTTA	2	10	58842	58851	40 %	60 %	0 %	0 %	384226437
76	NC_017254	TTTAT	2	10	58927	58936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017254	ATATT	2	10	61873	61882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017254	CAATT	2	10	63594	63603	40 %	40 %	0 %	20 %	384226439
79	NC_017254	TACCG	2	10	64673	64682	20 %	20 %	20 %	40 %	384226440
80	NC_017254	TAATA	2	10	64764	64773	60 %	40 %	0 %	0 %	384226440
81	NC_017254	CATTC	2	10	65368	65377	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017254	AGAAT	2	10	66257	66266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017254	AATGC	2	10	66888	66897	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017254	ATATT	2	10	66986	66995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017254	AATGG	2	10	67773	67782	40 %	20 %	40 %	0 %	384226441
86	NC_017254	ATTTT	2	10	68381	68390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017254	AGAAA	2	10	68916	68925	80 %	0 %	20 %	0 %	384226442
88	NC_017254	ATCCC	2	10	69138	69147	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017254	AAATC	2	10	69285	69294	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017254	CATAT	2	10	72047	72056	40 %	40 %	0 %	20 %	384226444
91	NC_017254	ATTAA	2	10	72248	72257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017254	TAAAT	2	10	73018	73027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017254	ATGTT	2	10	75055	75064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017254	GAAAA	2	10	75777	75786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017254	GAAAA	2	10	76141	76150	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017254	GCATG	2	10	76402	76411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017254	AAATT	2	10	76786	76795	60 %	40 %	0 %	0 %	384226446
98	NC_017254	AATAC	2	10	78548	78557	60 %	20 %	0 %	20 %	384226447
99	NC_017254	TAAAT	2	10	79984	79993	60 %	40 %	0 %	0 %	384226449
100	NC_017254	GCTAT	2	10	81206	81215	20 %	40 %	20 %	20 %	384226450
101	NC_017254	GATAT	2	10	81760	81769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017254	ATAAA	2	10	82512	82521	80 %	20 %	0 %	0 %	384226452
103	NC_017254	AATTA	2	10	83181	83190	60 %	40 %	0 %	0 %	384226453
104	NC_017254	TTAAT	2	10	83645	83654	40 %	60 %	0 %	0 %	384226454
105	NC_017254	CAAAT	2	10	85423	85432	60 %	20 %	0 %	20 %	384226456
106	NC_017254	TTAAA	2	10	87613	87622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017254	AATAT	2	10	87724	87733	60 %	40 %	0 %	0 %	384226460
108	NC_017254	TAATA	2	10	87756	87765	60 %	40 %	0 %	0 %	384226460
109	NC_017254	TCAAA	2	10	88570	88579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017254	TTAAA	2	10	89024	89033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017254	TTTAC	2	10	89095	89104	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017254	TAAAA	2	10	90436	90445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017254	AAATT	2	10	90737	90746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017254	AATAT	2	10	91551	91560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017254	TCAAA	2	10	92645	92654	60 %	20 %	0 %	20 %	384226462
116	NC_017254	CCATG	2	10	93165	93174	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017254	GCAAT	2	10	94997	95006	40 %	20 %	20 %	20 %	384226465
118	NC_017254	GAATT	2	10	95129	95138	40 %	40 %	20 %	0 %	384226465
119	NC_017254	AGATC	2	10	96061	96070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017254	ATATT	2	10	96558	96567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017254	GATAT	2	10	97291	97300	40 %	40 %	20 %	0 %	384226466
122	NC_017254	TTTTA	2	10	100852	100861	20 %	80 %	0 %	0 %	384226469
123	NC_017254	AATAT	2	10	101450	101459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017254	AATTA	2	10	101826	101835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017254	CAGAA	2	10	102472	102481	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017254	TAAAT	2	10	103251	103260	60 %	40 %	0 %	0 %	384226470
127	NC_017254	TATTT	2	10	103346	103355	20 %	80 %	0 %	0 %	384226471
128	NC_017254	TATTT	2	10	103942	103951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017254	GAATT	2	10	106668	106677	40 %	40 %	20 %	0 %	384226473
130	NC_017254	TAAAA	2	10	107822	107831	80 %	20 %	0 %	0 %	384226474
131	NC_017254	TAAAA	2	10	107921	107930	80 %	20 %	0 %	0 %	384226474
132	NC_017254	ATTTT	2	10	108979	108988	20 %	80 %	0 %	0 %	384226475
133	NC_017254	TAATT	2	10	110209	110218	40 %	60 %	0 %	0 %	384226477
134	NC_017254	ATTAT	2	10	110536	110545	40 %	60 %	0 %	0 %	384226477
135	NC_017254	ATTTA	2	10	111173	111182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017254	TTTTA	2	10	111524	111533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017254	AGTTT	2	10	115300	115309	20 %	60 %	20 %	0 %	384226479
138	NC_017254	TGTTT	2	10	116757	116766	0 %	80 %	20 %	0 %	384226480
139	NC_017254	AGTAA	2	10	116848	116857	60 %	20 %	20 %	0 %	384226480
140	NC_017254	TAATT	2	10	117021	117030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017254	ATATA	2	10	117167	117176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017254	GAAAA	2	10	117279	117288	80 %	0 %	20 %	0 %	384226481
143	NC_017254	TATTT	2	10	117908	117917	20 %	80 %	0 %	0 %	384226482
144	NC_017254	ATTTA	2	10	118099	118108	40 %	60 %	0 %	0 %	384226482
145	NC_017254	TAAAA	2	10	119638	119647	80 %	20 %	0 %	0 %	384226485
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154	NC_017254	AATTT	2	10	125975	125984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017254	TATTG	2	10	128388	128397	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_017254	TTATT	2	10	133272	133281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017254	ATTTT	2	10	133540	133549	20 %	80 %	0 %	0 %	384226494
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181	NC_017254	TATTT	2	10	149597	149606	20 %	80 %	0 %	0 %	384226505
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260	NC_017254	TAAAT	2	10	220948	220957	60 %	40 %	0 %	0 %	384226549
261	NC_017254	TAATC	2	10	223828	223837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_017254	TGGAA	2	10	225453	225462	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017254	TAAAA	2	10	230543	230552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017254	CTTTT	2	10	230619	230628	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_017254	TGATA	2	10	231396	231405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017254	TTGGA	2	10	232152	232161	20 %	40 %	40 %	0 %	384226556
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274	NC_017254	GTATT	2	10	235450	235459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017254	TGATT	2	10	236210	236219	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017254	TAATA	2	10	236872	236881	60 %	40 %	0 %	0 %	384226559
277	NC_017254	TTGTT	2	10	236930	236939	0 %	80 %	20 %	0 %	384226559
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281	NC_017254	AGTAT	2	10	242160	242169	40 %	40 %	20 %	0 %	384226563
282	NC_017254	CGTTC	2	10	243732	243741	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_017254	AATGA	2	10	245116	245125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017254	TAAAA	2	10	247050	247059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017254	TATAT	2	10	248775	248784	40 %	60 %	0 %	0 %	384226565
286	NC_017254	ATTGT	2	10	249497	249506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017254	TTTTC	2	10	249565	249574	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_017254	ATGTT	2	10	250724	250733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017254	GGAAA	2	10	251477	251486	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017254	ATTTT	2	10	254458	254467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_017254	TAAAA	2	10	258057	258066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017254	TAATA	2	10	258270	258279	60 %	40 %	0 %	0 %	384226571
295	NC_017254	AAATT	2	10	262229	262238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_017254	TTAAT	2	10	263248	263257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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316	NC_017254	TAAAT	2	10	281556	281565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_017254	ACATG	2	10	345892	345901	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
390	NC_017254	TAATT	2	10	346342	346351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_017254	TAAAT	2	10	347258	347267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_017254	ATTTA	2	10	348517	348526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_017254	GTACA	2	10	350615	350624	40 %	20 %	20 %	20 %	384226634
394	NC_017254	AAATA	2	10	350820	350829	80 %	20 %	0 %	0 %	384226634
395	NC_017254	AATAG	2	10	351343	351352	60 %	20 %	20 %	0 %	384226634
396	NC_017254	ATTAT	2	10	353930	353939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_017254	TTTAT	2	10	354652	354661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_017254	CTATT	2	10	355476	355485	20 %	60 %	0 %	20 %	384226638
399	NC_017254	GCAAT	2	10	356112	356121	40 %	20 %	20 %	20 %	384226638
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401	NC_017254	ATATT	2	10	357714	357723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_017254	TTCTT	2	10	358250	358259	0 %	80 %	0 %	20 %	384226639
403	NC_017254	TTGCG	2	10	358406	358415	0 %	40 %	40 %	20 %	384226639
404	NC_017254	ATGTC	2	10	358763	358772	20 %	40 %	20 %	20 %	384226639
405	NC_017254	TATAA	2	10	359238	359247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_017254	TAGTT	2	10	360569	360578	20 %	60 %	20 %	0 %	384226642
407	NC_017254	AACAA	2	10	360751	360760	80 %	0 %	0 %	20 %	384226642
408	NC_017254	AATTA	2	10	364286	364295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_017254	TAAAA	3	15	365695	365709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_017254	GATAA	2	10	366687	366696	60 %	20 %	20 %	0 %	384226647
411	NC_017254	CATAT	2	10	366895	366904	40 %	40 %	0 %	20 %	384226647
412	NC_017254	AAATT	2	10	368839	368848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_017254	AAAAT	2	10	369771	369780	80 %	20 %	0 %	0 %	384226650
414	NC_017254	TAAAT	2	10	370064	370073	60 %	40 %	0 %	0 %	384226651
415	NC_017254	TCAAA	2	10	372616	372625	60 %	20 %	0 %	20 %	384226656
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