MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. JF99 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 20909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017253	TAAT	2	8	15864	15871	50 %	50 %	0 %	0 %	414562382
502	NC_017253	AGAA	2	8	15930	15937	75 %	0 %	25 %	0 %	414562382
503	NC_017253	ATT	2	6	16006	16011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562382
504	NC_017253	ACTA	2	8	16018	16025	50 %	25 %	0 %	25 %	414562382
505	NC_017253	TA	3	6	16029	16034	50 %	50 %	0 %	0 %	414562382
506	NC_017253	TAT	2	6	16036	16041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562382
507	NC_017253	TAT	2	6	16060	16065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562382
508	NC_017253	TAT	2	6	16078	16083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562382
509	NC_017253	TGCG	2	8	16137	16144	0 %	25 %	50 %	25 %	414562382
510	NC_017253	AAC	2	6	16191	16196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562382
511	NC_017253	TA	3	6	16221	16226	50 %	50 %	0 %	0 %	414562382
512	NC_017253	A	6	6	16226	16231	100 %	0 %	0 %	0 %	414562382
513	NC_017253	A	6	6	16233	16238	100 %	0 %	0 %	0 %	414562382
514	NC_017253	TAT	2	6	16298	16303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562382
515	NC_017253	T	6	6	16339	16344	0 %	100 %	0 %	0 %	414562382
516	NC_017253	CCTG	2	8	16387	16394	0 %	25 %	25 %	50 %	414562382
517	NC_017253	T	6	6	16415	16420	0 %	100 %	0 %	0 %	414562382
518	NC_017253	TCT	2	6	16433	16438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562382
519	NC_017253	A	7	7	16464	16470	100 %	0 %	0 %	0 %	414562382
520	NC_017253	T	8	8	16505	16512	0 %	100 %	0 %	0 %	414562382
521	NC_017253	TA	3	6	16541	16546	50 %	50 %	0 %	0 %	414562382
522	NC_017253	TAT	2	6	16564	16569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562382
523	NC_017253	ACA	2	6	16570	16575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562382
524	NC_017253	TATCT	2	10	16582	16591	20 %	60 %	0 %	20 %	414562382
525	NC_017253	A	7	7	16599	16605	100 %	0 %	0 %	0 %	414562382
526	NC_017253	AT	4	8	16629	16636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017253	ATG	2	6	16651	16656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562383
528	NC_017253	CTAG	2	8	16774	16781	25 %	25 %	25 %	25 %	414562383
529	NC_017253	AAT	2	6	16813	16818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562383
530	NC_017253	CTC	2	6	16856	16861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562383
531	NC_017253	TAA	2	6	16913	16918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562383
532	NC_017253	TAA	2	6	16928	16933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562383
533	NC_017253	TAA	2	6	16950	16955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562383
534	NC_017253	T	6	6	16995	17000	0 %	100 %	0 %	0 %	414562383
535	NC_017253	GAT	2	6	17038	17043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562383
536	NC_017253	TTAA	2	8	17044	17051	50 %	50 %	0 %	0 %	414562383
537	NC_017253	T	7	7	17109	17115	0 %	100 %	0 %	0 %	414562383
538	NC_017253	TGA	2	6	17126	17131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562383
539	NC_017253	ATT	2	6	17137	17142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562383
540	NC_017253	AGA	3	9	17181	17189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562383
541	NC_017253	ATTAAT	2	12	17191	17202	50 %	50 %	0 %	0 %	414562383
542	NC_017253	TAAT	2	8	17213	17220	50 %	50 %	0 %	0 %	414562383
543	NC_017253	A	7	7	17299	17305	100 %	0 %	0 %	0 %	414562383
544	NC_017253	TTA	2	6	17344	17349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562383
545	NC_017253	TAC	2	6	17397	17402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562383
546	NC_017253	TCT	2	6	17409	17414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562383
547	NC_017253	AATT	2	8	17450	17457	50 %	50 %	0 %	0 %	414562383
548	NC_017253	CAG	2	6	17462	17467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562383
549	NC_017253	GAT	2	6	17482	17487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562383
550	NC_017253	CAAAA	2	10	17579	17588	80 %	0 %	0 %	20 %	414562383
551	NC_017253	A	9	9	17585	17593	100 %	0 %	0 %	0 %	414562383
552	NC_017253	TGA	2	6	17598	17603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562383
553	NC_017253	TAAA	2	8	17651	17658	75 %	25 %	0 %	0 %	414562383
554	NC_017253	TAA	2	6	17666	17671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562383
555	NC_017253	TTA	2	6	17711	17716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562383
556	NC_017253	ATA	2	6	17764	17769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562383
557	NC_017253	A	7	7	17777	17783	100 %	0 %	0 %	0 %	414562383
558	NC_017253	AAT	2	6	17788	17793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562383
559	NC_017253	TCG	3	9	17811	17819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562383
560	NC_017253	AAC	2	6	17828	17833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562383
561	NC_017253	GA	3	6	17877	17882	50 %	0 %	50 %	0 %	414562383
562	NC_017253	TAT	2	6	17919	17924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562383
563	NC_017253	AAGT	2	8	17925	17932	50 %	25 %	25 %	0 %	414562383
564	NC_017253	ATA	2	6	17944	17949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562383
565	NC_017253	TTA	2	6	17971	17976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562383
566	NC_017253	AAAT	2	8	18007	18014	75 %	25 %	0 %	0 %	414562383
567	NC_017253	ACC	2	6	18051	18056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_017253	T	7	7	18105	18111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017253	ATC	2	6	18119	18124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017253	TGT	2	6	18135	18140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017253	T	6	6	18146	18151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017253	T	6	6	18162	18167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017253	ATATTT	2	12	18168	18179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017253	T	6	6	18185	18190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017253	A	8	8	18191	18198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017253	T	6	6	18203	18208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017253	TAAA	2	8	18235	18242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017253	A	7	7	18240	18246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017253	A	7	7	18248	18254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017253	TAA	2	6	18277	18282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017253	ATTAA	2	10	18313	18322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017253	A	6	6	18324	18329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017253	T	6	6	18333	18338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017253	AAT	2	6	18341	18346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017253	ATT	2	6	18355	18360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017253	AAG	2	6	18421	18426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562384
587	NC_017253	GGT	2	6	18444	18449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562384
588	NC_017253	CTG	2	6	18466	18471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562384
589	NC_017253	TGT	2	6	18566	18571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562384
590	NC_017253	A	6	6	18604	18609	100 %	0 %	0 %	0 %	414562384
591	NC_017253	GAA	2	6	18618	18623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562384
592	NC_017253	TTA	2	6	18624	18629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562384
593	NC_017253	TTG	2	6	18658	18663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562384
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595	NC_017253	AAG	2	6	18940	18945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562385
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597	NC_017253	ATT	2	6	18995	19000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562385
598	NC_017253	AGC	2	6	19037	19042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562385
599	NC_017253	AGA	2	6	19100	19105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562385
600	NC_017253	TTA	2	6	19237	19242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562385
601	NC_017253	AGA	2	6	19247	19252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562385
602	NC_017253	TATC	2	8	19311	19318	25 %	50 %	0 %	25 %	414562385
603	NC_017253	TTG	2	6	19351	19356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562385
604	NC_017253	AT	3	6	19370	19375	50 %	50 %	0 %	0 %	414562385
605	NC_017253	A	7	7	19389	19395	100 %	0 %	0 %	0 %	414562385
606	NC_017253	ATTA	2	8	19457	19464	50 %	50 %	0 %	0 %	414562385
607	NC_017253	TAG	2	6	19501	19506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562385
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610	NC_017253	TGG	2	6	19604	19609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562385
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613	NC_017253	GTT	2	6	19683	19688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562385
614	NC_017253	TAT	2	6	19709	19714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562385
615	NC_017253	TGG	2	6	19715	19720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562385
616	NC_017253	AAG	2	6	19777	19782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562385
617	NC_017253	GAAA	2	8	19883	19890	75 %	0 %	25 %	0 %	414562385
618	NC_017253	A	8	8	19888	19895	100 %	0 %	0 %	0 %	414562385
619	NC_017253	AGA	2	6	19937	19942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562385
620	NC_017253	GGT	2	6	19959	19964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562385
621	NC_017253	GAA	2	6	20094	20099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562385
622	NC_017253	ACAA	2	8	20112	20119	75 %	0 %	0 %	25 %	414562385
623	NC_017253	TGA	2	6	20162	20167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562385
624	NC_017253	TGC	2	6	20234	20239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562385
625	NC_017253	AGA	2	6	20294	20299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562385
626	NC_017253	TCT	2	6	20304	20309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562385
627	NC_017253	TTC	2	6	20318	20323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562385
628	NC_017253	CAG	2	6	20326	20331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562385
629	NC_017253	ATG	2	6	20355	20360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562385
630	NC_017253	TAA	2	6	20361	20366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562385
631	NC_017253	TTTAT	2	10	20371	20380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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633	NC_017253	T	6	6	20440	20445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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