MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brucella suis 1330 chromosome I

Total Repeats: 1589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017251	CGGGG	2	10	4059	4068	0 %	0 %	80 %	20 %	384223701
2	NC_017251	GGTCG	2	10	7635	7644	0 %	20 %	60 %	20 %	384223704
3	NC_017251	TCGGC	2	10	7664	7673	0 %	20 %	40 %	40 %	384223704
4	NC_017251	CTGAC	2	10	8101	8110	20 %	20 %	20 %	40 %	384223704
5	NC_017251	AAGAG	2	10	8857	8866	60 %	0 %	40 %	0 %	384223705
6	NC_017251	GCACC	2	10	9007	9016	20 %	0 %	20 %	60 %	384223705
7	NC_017251	TTTCA	2	10	11488	11497	20 %	60 %	0 %	20 %	384223707
8	NC_017251	ATCCG	2	10	11527	11536	20 %	20 %	20 %	40 %	384223707
9	NC_017251	AGCTT	2	10	12699	12708	20 %	40 %	20 %	20 %	384223708
10	NC_017251	CCAGT	2	10	15679	15688	20 %	20 %	20 %	40 %	384223711
11	NC_017251	CTCCG	2	10	17515	17524	0 %	20 %	20 %	60 %	384223713
12	NC_017251	CGTCA	2	10	19521	19530	20 %	20 %	20 %	40 %	384223715
13	NC_017251	AAAGC	2	10	19624	19633	60 %	0 %	20 %	20 %	384223715
14	NC_017251	GCAGG	2	10	22448	22457	20 %	0 %	60 %	20 %	384223716
15	NC_017251	TGCGC	2	10	22826	22835	0 %	20 %	40 %	40 %	384223716
16	NC_017251	GCGTC	2	10	24575	24584	0 %	20 %	40 %	40 %	384223718
17	NC_017251	GATGC	2	10	26759	26768	20 %	20 %	40 %	20 %	384223719
18	NC_017251	CATGC	2	10	26938	26947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017251	CATGC	2	10	28353	28362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017251	CGAAA	2	10	28551	28560	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017251	GATCG	2	10	28920	28929	20 %	20 %	40 %	20 %	384223721
22	NC_017251	TATGA	2	10	29721	29730	40 %	40 %	20 %	0 %	384223722
23	NC_017251	ACCCG	2	10	30196	30205	20 %	0 %	20 %	60 %	384223722
24	NC_017251	AGCGC	2	10	31045	31054	20 %	0 %	40 %	40 %	384223723
25	NC_017251	CGGAG	2	10	31529	31538	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017251	CTGTC	2	10	31871	31880	0 %	40 %	20 %	40 %	384223724
27	NC_017251	CATGG	2	10	32292	32301	20 %	20 %	40 %	20 %	384223724
28	NC_017251	AAAGG	2	10	34186	34195	60 %	0 %	40 %	0 %	384223725
29	NC_017251	AAAGC	2	10	36232	36241	60 %	0 %	20 %	20 %	384223727
30	NC_017251	GCGAT	2	10	36583	36592	20 %	20 %	40 %	20 %	384223728
31	NC_017251	CCGTG	2	10	40683	40692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017251	GCCGC	2	10	40945	40954	0 %	0 %	40 %	60 %	384223732
33	NC_017251	GACCA	2	10	40991	41000	40 %	0 %	20 %	40 %	384223732
34	NC_017251	GCATG	2	10	41682	41691	20 %	20 %	40 %	20 %	384223733
35	NC_017251	GTGCG	2	10	41768	41777	0 %	20 %	60 %	20 %	384223733
36	NC_017251	TCTTG	2	10	41877	41886	0 %	60 %	20 %	20 %	384223733
37	NC_017251	GCCGC	2	10	42512	42521	0 %	0 %	40 %	60 %	384223734
38	NC_017251	GCGTC	2	10	44986	44995	0 %	20 %	40 %	40 %	384223737
39	NC_017251	TCGTT	2	10	46477	46486	0 %	60 %	20 %	20 %	384223739
40	NC_017251	GGCAT	2	10	49011	49020	20 %	20 %	40 %	20 %	384223740
41	NC_017251	TAAAG	2	10	50828	50837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017251	TGAAA	2	10	51945	51954	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017251	GCCGC	2	10	53079	53088	0 %	0 %	40 %	60 %	384223745
44	NC_017251	CGGGC	2	10	54695	54704	0 %	0 %	60 %	40 %	384223746
45	NC_017251	TGCGC	2	10	54713	54722	0 %	20 %	40 %	40 %	384223746
46	NC_017251	TGGTC	2	10	56843	56852	0 %	40 %	40 %	20 %	384223746
47	NC_017251	GGTGC	2	10	57159	57168	0 %	20 %	60 %	20 %	384223746
48	NC_017251	GAAAG	2	10	60266	60275	60 %	0 %	40 %	0 %	384223749
49	NC_017251	GCCTT	2	10	61918	61927	0 %	40 %	20 %	40 %	384223751
50	NC_017251	TGTCG	2	10	63519	63528	0 %	40 %	40 %	20 %	384223754
51	NC_017251	AGAAA	2	10	63690	63699	80 %	0 %	20 %	0 %	384223754
52	NC_017251	CAAGA	2	10	66509	66518	60 %	0 %	20 %	20 %	384223756
53	NC_017251	CCCAT	2	10	67784	67793	20 %	20 %	0 %	60 %	384223758
54	NC_017251	GCATC	2	10	69111	69120	20 %	20 %	20 %	40 %	384223759
55	NC_017251	ATCTT	2	10	70058	70067	20 %	60 %	0 %	20 %	384223760
56	NC_017251	GGCGC	2	10	72676	72685	0 %	0 %	60 %	40 %	384223765
57	NC_017251	CGGAG	2	10	72788	72797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017251	GGCGC	2	10	74025	74034	0 %	0 %	60 %	40 %	384223766
59	NC_017251	GATGC	2	10	76037	76046	20 %	20 %	40 %	20 %	384223766
60	NC_017251	CGCGC	2	10	76969	76978	0 %	0 %	40 %	60 %	384223767
61	NC_017251	CATCA	2	10	77045	77054	40 %	20 %	0 %	40 %	384223767
62	NC_017251	GCGCA	2	10	77522	77531	20 %	0 %	40 %	40 %	384223767
63	NC_017251	CGGCG	2	10	77587	77596	0 %	0 %	60 %	40 %	384223768
64	NC_017251	TTCCA	2	10	77689	77698	20 %	40 %	0 %	40 %	384223768
65	NC_017251	AAATA	2	10	78919	78928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017251	ACGTT	2	10	79827	79836	20 %	40 %	20 %	20 %	384223769
67	NC_017251	TGGCG	2	10	81047	81056	0 %	20 %	60 %	20 %	384223769
68	NC_017251	AAGGC	2	10	83554	83563	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017251	TCTGG	2	10	83699	83708	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017251	GAGGT	2	10	85366	85375	20 %	20 %	60 %	0 %	384223773
71	NC_017251	TCGAT	2	10	89253	89262	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017251	AACGC	2	10	92707	92716	40 %	0 %	20 %	40 %	384223783
73	NC_017251	GGGCG	2	10	93150	93159	0 %	0 %	80 %	20 %	384223783
74	NC_017251	CGCTG	2	10	93919	93928	0 %	20 %	40 %	40 %	384223784
75	NC_017251	CGGCA	2	10	93995	94004	20 %	0 %	40 %	40 %	384223784
76	NC_017251	GGGCA	2	10	94842	94851	20 %	0 %	60 %	20 %	384223785
77	NC_017251	TTCCA	2	10	95528	95537	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017251	CGGTT	2	10	95900	95909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017251	GAACC	2	10	95952	95961	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017251	ATAGA	2	10	96334	96343	60 %	20 %	20 %	0 %	384223787
81	NC_017251	AAAAG	2	10	97029	97038	80 %	0 %	20 %	0 %	384223788
82	NC_017251	CCCAG	2	10	99087	99096	20 %	0 %	20 %	60 %	384223789
83	NC_017251	GACCG	2	10	100213	100222	20 %	0 %	40 %	40 %	384223790
84	NC_017251	CGGCC	2	10	100902	100911	0 %	0 %	40 %	60 %	384223791
85	NC_017251	CGGCG	2	10	103422	103431	0 %	0 %	60 %	40 %	384223795
86	NC_017251	CGGGC	2	10	103775	103784	0 %	0 %	60 %	40 %	384223795
87	NC_017251	CATCG	2	10	104785	104794	20 %	20 %	20 %	40 %	384223795
88	NC_017251	GGGAG	2	10	104844	104853	20 %	0 %	80 %	0 %	384223795
89	NC_017251	GCACC	2	10	106836	106845	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017251	TTTGT	2	10	107329	107338	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017251	GCCAT	2	10	108074	108083	20 %	20 %	20 %	40 %	384223801
92	NC_017251	CGCTG	2	10	111152	111161	0 %	20 %	40 %	40 %	384223804
93	NC_017251	GCCTG	2	10	111515	111524	0 %	20 %	40 %	40 %	384223804
94	NC_017251	TGCCG	2	10	111999	112008	0 %	20 %	40 %	40 %	384223805
95	NC_017251	TGCCG	2	10	112206	112215	0 %	20 %	40 %	40 %	384223805
96	NC_017251	CCTTT	2	10	112244	112253	0 %	60 %	0 %	40 %	384223805
97	NC_017251	GCCGC	2	10	114545	114554	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017251	CTGGC	2	10	114624	114633	0 %	20 %	40 %	40 %	384223807
99	NC_017251	GCGCA	2	10	117327	117336	20 %	0 %	40 %	40 %	384223807
100	NC_017251	GCTCG	2	10	118292	118301	0 %	20 %	40 %	40 %	384223807
101	NC_017251	GACCA	2	10	118308	118317	40 %	0 %	20 %	40 %	384223807
102	NC_017251	CGCGG	2	10	120345	120354	0 %	0 %	60 %	40 %	384223807
103	NC_017251	GGCGA	2	10	120633	120642	20 %	0 %	60 %	20 %	384223807
104	NC_017251	TGGCT	2	10	121908	121917	0 %	40 %	40 %	20 %	384223807
105	NC_017251	GCTCG	2	10	122087	122096	0 %	20 %	40 %	40 %	384223807
106	NC_017251	ATGGA	2	10	122877	122886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017251	GCGCG	2	10	122912	122921	0 %	0 %	60 %	40 %	384223808
108	NC_017251	CGCGG	2	10	124702	124711	0 %	0 %	60 %	40 %	384223809
109	NC_017251	GATAG	2	10	127159	127168	40 %	20 %	40 %	0 %	384223812
110	NC_017251	TGGAA	2	10	133496	133505	40 %	20 %	40 %	0 %	384223817
111	NC_017251	ACCGC	2	10	135197	135206	20 %	0 %	20 %	60 %	384223819
112	NC_017251	GCCAT	2	10	135849	135858	20 %	20 %	20 %	40 %	384223819
113	NC_017251	GCCGA	2	10	140359	140368	20 %	0 %	40 %	40 %	384223821
114	NC_017251	CCGGC	2	10	140666	140675	0 %	0 %	40 %	60 %	384223821
115	NC_017251	AGCAC	2	10	141599	141608	40 %	0 %	20 %	40 %	384223821
116	NC_017251	CCGCC	2	10	145066	145075	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
117	NC_017251	GCACG	2	10	146976	146985	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017251	CGAAC	2	10	147272	147281	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017251	GCTTC	2	10	147320	147329	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017251	CGAAG	2	10	147457	147466	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017251	CAATG	2	10	148697	148706	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017251	CGCGC	2	10	148711	148720	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_017251	CCTTG	2	10	149270	149279	0 %	40 %	20 %	40 %	384223827
124	NC_017251	TGCGA	2	10	150880	150889	20 %	20 %	40 %	20 %	384223829
125	NC_017251	CGGCA	2	10	154018	154027	20 %	0 %	40 %	40 %	384223834
126	NC_017251	CAGTG	2	10	154534	154543	20 %	20 %	40 %	20 %	384223835
127	NC_017251	TCAAC	2	10	155715	155724	40 %	20 %	0 %	40 %	384223836
128	NC_017251	AGGGC	2	10	158314	158323	20 %	0 %	60 %	20 %	384223838
129	NC_017251	GCACC	2	10	159518	159527	20 %	0 %	20 %	60 %	384223838
130	NC_017251	GTTCG	2	10	159686	159695	0 %	40 %	40 %	20 %	384223838
131	NC_017251	ACAGC	2	10	162478	162487	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017251	GCCGG	2	10	163010	163019	0 %	0 %	60 %	40 %	384223840
133	NC_017251	CGGAG	2	10	165813	165822	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017251	ACAAA	2	10	165880	165889	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017251	GCCGC	2	10	168866	168875	0 %	0 %	40 %	60 %	384223844
136	NC_017251	CTGCC	2	10	170444	170453	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_017251	TGAAA	2	10	171816	171825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017251	CGTGT	2	10	172713	172722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017251	GACGT	2	10	173889	173898	20 %	20 %	40 %	20 %	384223850
140	NC_017251	TTTTA	2	10	174520	174529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017251	TGGCG	2	10	175827	175836	0 %	20 %	60 %	20 %	384223851
142	NC_017251	CGCTT	2	10	175968	175977	0 %	40 %	20 %	40 %	384223851
143	NC_017251	TGACC	2	10	177419	177428	20 %	20 %	20 %	40 %	384223853
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149	NC_017251	GCATC	2	10	187768	187777	20 %	20 %	20 %	40 %	384223869
150	NC_017251	GACGC	2	10	189212	189221	20 %	0 %	40 %	40 %	384223870
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152	NC_017251	CATGA	2	10	191293	191302	40 %	20 %	20 %	20 %	384223872
153	NC_017251	ATCCG	2	10	191860	191869	20 %	20 %	20 %	40 %	384223873
154	NC_017251	GCGCA	2	10	193259	193268	20 %	0 %	40 %	40 %	384223874
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156	NC_017251	ACCGC	2	10	197617	197626	20 %	0 %	20 %	60 %	384223881
157	NC_017251	ATGTC	2	10	201375	201384	20 %	40 %	20 %	20 %	384223883
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173	NC_017251	AGCCA	2	10	222340	222349	40 %	0 %	20 %	40 %	384223900
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177	NC_017251	CTTGG	2	10	228087	228096	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
178	NC_017251	CGAAC	2	10	228650	228659	40 %	0 %	20 %	40 %	384223908
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180	NC_017251	CCGAT	2	10	232397	232406	20 %	20 %	20 %	40 %	384223909
181	NC_017251	GGCAG	2	10	233465	233474	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
182	NC_017251	GGAAA	2	10	234226	234235	60 %	0 %	40 %	0 %	384223911
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184	NC_017251	GGGGC	2	10	242157	242166	0 %	0 %	80 %	20 %	384223920
185	NC_017251	CGCTG	2	10	242988	242997	0 %	20 %	40 %	40 %	384223920
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197	NC_017251	GACGG	2	10	262019	262028	20 %	0 %	60 %	20 %	384223942
198	NC_017251	GGGCT	2	10	265708	265717	0 %	20 %	60 %	20 %	384223946
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202	NC_017251	GCAAC	2	10	269122	269131	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
203	NC_017251	GGGGC	2	10	269659	269668	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
204	NC_017251	TTGCG	2	10	270560	270569	0 %	40 %	40 %	20 %	384223951
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239	NC_017251	AAAAG	2	10	311554	311563	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_017251	CGCGG	2	10	315535	315544	0 %	0 %	60 %	40 %	384223993
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242	NC_017251	CGACC	2	10	321383	321392	20 %	0 %	20 %	60 %	384223999
243	NC_017251	GTTTC	2	10	321475	321484	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
244	NC_017251	GTAAC	2	10	321685	321694	40 %	20 %	20 %	20 %	384224000
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248	NC_017251	GGTGC	2	10	326786	326795	0 %	20 %	60 %	20 %	384224005
249	NC_017251	AATCG	2	10	326854	326863	40 %	20 %	20 %	20 %	384224005
250	NC_017251	CAGCT	2	10	327085	327094	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
251	NC_017251	AGCGC	2	10	327184	327193	20 %	0 %	40 %	40 %	384224006
252	NC_017251	CGCGC	2	10	329303	329312	0 %	0 %	40 %	60 %	384224006
253	NC_017251	TCTTT	2	10	330906	330915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
254	NC_017251	CGATG	2	10	332211	332220	20 %	20 %	40 %	20 %	384224009
255	NC_017251	GTTCA	2	10	332506	332515	20 %	40 %	20 %	20 %	384224009
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258	NC_017251	GGAAT	2	10	333709	333718	40 %	20 %	40 %	0 %	384224010
259	NC_017251	GATTT	2	10	334655	334664	20 %	60 %	20 %	0 %	384224012
260	NC_017251	GAACA	2	10	336245	336254	60 %	0 %	20 %	20 %	384224014
261	NC_017251	GCGCG	2	10	336899	336908	0 %	0 %	60 %	40 %	384224015
262	NC_017251	GGCGC	2	10	337588	337597	0 %	0 %	60 %	40 %	384224016
263	NC_017251	GCGCC	2	10	340256	340265	0 %	0 %	40 %	60 %	384224019
264	NC_017251	CCCGG	2	10	341341	341350	0 %	0 %	40 %	60 %	384224020
265	NC_017251	TGATC	2	10	342085	342094	20 %	40 %	20 %	20 %	384224021
266	NC_017251	TCGGC	2	10	344687	344696	0 %	20 %	40 %	40 %	384224025
267	NC_017251	CGTGG	2	10	347335	347344	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
268	NC_017251	GCCTT	2	10	348073	348082	0 %	40 %	20 %	40 %	384224029
269	NC_017251	CCAAG	2	10	349416	349425	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_017251	GCGCA	2	10	350351	350360	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
271	NC_017251	CGCTG	2	10	354246	354255	0 %	20 %	40 %	40 %	384224033
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287	NC_017251	CGGCA	2	10	368324	368333	20 %	0 %	40 %	40 %	384224045
288	NC_017251	CGATG	2	10	369437	369446	20 %	20 %	40 %	20 %	384224045
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341	NC_017251	AATGT	2	10	427939	427948	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_017251	TGCCG	2	10	475988	475997	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
384	NC_017251	GCGCC	2	10	478362	478371	0 %	0 %	40 %	60 %	384224165
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390	NC_017251	TTTTA	2	10	485197	485206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_017251	CCGTT	2	10	485817	485826	0 %	40 %	20 %	40 %	384224171
392	NC_017251	GGGCT	2	10	486250	486259	0 %	20 %	60 %	20 %	384224171
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395	NC_017251	CGGCG	2	10	489571	489580	0 %	0 %	60 %	40 %	384224174
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398	NC_017251	CGGCC	2	10	493720	493729	0 %	0 %	40 %	60 %	384224178
399	NC_017251	ACAGG	2	10	494338	494347	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
400	NC_017251	CGCAG	2	10	497755	497764	20 %	0 %	40 %	40 %	384224181
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402	NC_017251	GTGCC	2	10	499361	499370	0 %	20 %	40 %	40 %	384224182
403	NC_017251	TGCGC	2	10	504302	504311	0 %	20 %	40 %	40 %	384224186
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413	NC_017251	TGAAT	2	10	517172	517181	40 %	40 %	20 %	0 %	384224198
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433	NC_017251	AGTTT	2	10	546730	546739	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_017251	CGCGC	2	10	549799	549808	0 %	0 %	40 %	60 %	384224229
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442	NC_017251	TTTGC	2	10	560978	560987	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
443	NC_017251	AAAGA	2	10	561001	561010	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017251	GTTCG	2	10	561387	561396	0 %	40 %	40 %	20 %	384224242
445	NC_017251	AAGGC	2	10	562960	562969	40 %	0 %	40 %	20 %	384224244
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452	NC_017251	ACTGA	2	10	565403	565412	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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495	NC_017251	GCCCA	2	10	625834	625843	20 %	0 %	20 %	60 %	384224304
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497	NC_017251	GCTTT	2	10	626151	626160	0 %	60 %	20 %	20 %	384224304
498	NC_017251	ACCGG	2	10	626771	626780	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
499	NC_017251	CGCAC	2	10	627888	627897	20 %	0 %	20 %	60 %	384224308
500	NC_017251	TGGCG	2	10	628879	628888	0 %	20 %	60 %	20 %	384224309

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