MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017249	CGC	2	6	149686	149691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_017249	CGCC	2	8	149760	149767	0 %	0 %	25 %	75 %	384213889
3503	NC_017249	AGC	2	6	149795	149800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3504	NC_017249	CAG	2	6	149818	149823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3505	NC_017249	TGG	2	6	149853	149858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213889
3506	NC_017249	GA	3	6	149990	149995	50 %	0 %	50 %	0 %	384213889
3507	NC_017249	CAG	2	6	149998	150003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3508	NC_017249	AGC	2	6	150053	150058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3509	NC_017249	GATCGC	2	12	150079	150090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3510	NC_017249	CAG	2	6	150106	150111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3511	NC_017249	GAT	2	6	150136	150141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213889
3512	NC_017249	CGA	2	6	150150	150155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3513	NC_017249	CGC	2	6	150157	150162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213889
3514	NC_017249	CGG	2	6	150174	150179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213889
3515	NC_017249	CGA	2	6	150180	150185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3516	NC_017249	GAT	2	6	150190	150195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213889
3517	NC_017249	GCG	2	6	150285	150290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213889
3518	NC_017249	ATG	2	6	150305	150310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213889
3519	NC_017249	TTC	2	6	150385	150390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213889
3520	NC_017249	CGT	2	6	150391	150396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3521	NC_017249	GC	3	6	150409	150414	0 %	0 %	50 %	50 %	384213889
3522	NC_017249	ACG	2	6	150425	150430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3523	NC_017249	GAA	2	6	150448	150453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213889
3524	NC_017249	GAA	2	6	150475	150480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213889
3525	NC_017249	GTC	2	6	150481	150486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3526	NC_017249	GC	3	6	150519	150524	0 %	0 %	50 %	50 %	384213889
3527	NC_017249	GAGCG	2	10	150541	150550	20 %	0 %	60 %	20 %	384213889
3528	NC_017249	CAG	2	6	150607	150612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213889
3529	NC_017249	GCC	2	6	150634	150639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213889
3530	NC_017249	CGCCAG	2	12	150664	150675	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384213889
3531	NC_017249	CGC	2	6	150685	150690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213889
3532	NC_017249	GAA	2	6	150940	150945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213889
3533	NC_017249	GAA	2	6	150949	150954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213889
3534	NC_017249	GAT	2	6	150970	150975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213889
3535	NC_017249	CGG	2	6	151109	151114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_017249	TGC	2	6	151190	151195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_017249	CTA	2	6	151275	151280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213890
3538	NC_017249	CGT	2	6	151313	151318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213890
3539	NC_017249	TCA	2	6	151363	151368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213890
3540	NC_017249	TCG	2	6	151393	151398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213890
3541	NC_017249	GCT	2	6	151520	151525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213890
3542	NC_017249	ATC	3	9	151527	151535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213890
3543	NC_017249	GC	3	6	151543	151548	0 %	0 %	50 %	50 %	384213890
3544	NC_017249	GTC	2	6	151650	151655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213890
3545	NC_017249	GGC	2	6	151718	151723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213890
3546	NC_017249	TGA	2	6	151768	151773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213890
3547	NC_017249	GTG	2	6	151845	151850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213890
3548	NC_017249	GCG	2	6	151891	151896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213890
3549	NC_017249	CGA	2	6	151934	151939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213890
3550	NC_017249	CCG	2	6	151975	151980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213890
3551	NC_017249	GCTC	2	8	151984	151991	0 %	25 %	25 %	50 %	384213890
3552	NC_017249	CCAG	2	8	152023	152030	25 %	0 %	25 %	50 %	384213890
3553	NC_017249	CCG	2	6	152042	152047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213890
3554	NC_017249	GAT	2	6	152126	152131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213890
3555	NC_017249	GGC	2	6	152148	152153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213890
3556	NC_017249	AAC	2	6	152172	152177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213890
3557	NC_017249	CGCC	2	8	152204	152211	0 %	0 %	25 %	75 %	384213890
3558	NC_017249	GC	3	6	152218	152223	0 %	0 %	50 %	50 %	384213890
3559	NC_017249	TCG	2	6	152242	152247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213890
3560	NC_017249	ACC	2	6	152283	152288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213890
3561	NC_017249	CACC	2	8	152302	152309	25 %	0 %	0 %	75 %	384213890
3562	NC_017249	CGC	2	6	152317	152322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213890
3563	NC_017249	CGC	2	6	152356	152361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213890
3564	NC_017249	CTT	2	6	152375	152380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213890
3565	NC_017249	TCT	2	6	152434	152439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213891
3566	NC_017249	CGGC	2	8	152452	152459	0 %	0 %	50 %	50 %	384213891
3567	NC_017249	TCG	3	9	152493	152501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3568	NC_017249	GTG	2	6	152510	152515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213891
3569	NC_017249	CGG	2	6	152524	152529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213891
3570	NC_017249	GCT	2	6	152536	152541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3571	NC_017249	CAC	2	6	152593	152598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213891
3572	NC_017249	CAT	2	6	152620	152625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213891
3573	NC_017249	TGC	3	9	152649	152657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3574	NC_017249	TGA	2	6	152676	152681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213891
3575	NC_017249	CAG	2	6	152690	152695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3576	NC_017249	TCT	2	6	152778	152783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213891
3577	NC_017249	TGA	2	6	152811	152816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213891
3578	NC_017249	CGT	2	6	152821	152826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3579	NC_017249	CGTTCC	2	12	152856	152867	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384213891
3580	NC_017249	CGG	2	6	152896	152901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213891
3581	NC_017249	GGCT	3	12	152951	152962	0 %	25 %	50 %	25 %	384213891
3582	NC_017249	CCG	2	6	152966	152971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213891
3583	NC_017249	ATG	2	6	153110	153115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213891
3584	NC_017249	TCG	2	6	153162	153167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3585	NC_017249	CCT	2	6	153168	153173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213891
3586	NC_017249	CGT	2	6	153187	153192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3587	NC_017249	GCT	2	6	153199	153204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3588	NC_017249	CTT	2	6	153232	153237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213891
3589	NC_017249	ACGA	2	8	153239	153246	50 %	0 %	25 %	25 %	384213891
3590	NC_017249	CGG	2	6	153250	153255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213891
3591	NC_017249	GAT	2	6	153262	153267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213891
3592	NC_017249	GATCTG	2	12	153280	153291	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384213891
3593	NC_017249	TCT	2	6	153336	153341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213891
3594	NC_017249	TCA	2	6	153411	153416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213891
3595	NC_017249	CAC	2	6	153443	153448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213891
3596	NC_017249	TTC	2	6	153449	153454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213891
3597	NC_017249	TTC	2	6	153485	153490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213891
3598	NC_017249	CAC	2	6	153496	153501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213891
3599	NC_017249	GAT	2	6	153502	153507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213891
3600	NC_017249	TGT	2	6	153588	153593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213891
3601	NC_017249	CGG	2	6	153625	153630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213891
3602	NC_017249	TGC	2	6	153642	153647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3603	NC_017249	GCC	2	6	153655	153660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213891
3604	NC_017249	ATC	2	6	153716	153721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213891
3605	NC_017249	GGC	2	6	153722	153727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213891
3606	NC_017249	GTG	2	6	153728	153733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213891
3607	NC_017249	ACT	2	6	153756	153761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213891
3608	NC_017249	GTTCTG	2	12	153814	153825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384213891
3609	NC_017249	GTC	2	6	153827	153832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3610	NC_017249	CGC	2	6	153887	153892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213891
3611	NC_017249	CGA	2	6	153904	153909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3612	NC_017249	TC	3	6	153914	153919	0 %	50 %	0 %	50 %	384213891
3613	NC_017249	CGC	2	6	153937	153942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213891
3614	NC_017249	AGC	2	6	154017	154022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213891
3615	NC_017249	GC	3	6	154052	154057	0 %	0 %	50 %	50 %	384213891
3616	NC_017249	CCT	2	6	154074	154079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213891
3617	NC_017249	CCG	2	6	154085	154090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213891
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3988	NC_017249	CTTGA	2	10	169005	169014	20 %	40 %	20 %	20 %	384213904
3989	NC_017249	GTC	2	6	169023	169028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213904
3990	NC_017249	CAT	2	6	169058	169063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213904
3991	NC_017249	CCCG	2	8	169112	169119	0 %	0 %	25 %	75 %	384213904
3992	NC_017249	AAG	2	6	169120	169125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213904
3993	NC_017249	GCC	2	6	169175	169180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213904
3994	NC_017249	CT	4	8	169192	169199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3995	NC_017249	CG	3	6	169242	169247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3996	NC_017249	CCG	2	6	169304	169309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213905
3997	NC_017249	GCA	3	9	169335	169343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213905
3998	NC_017249	CGAT	2	8	169345	169352	25 %	25 %	25 %	25 %	384213905
3999	NC_017249	GCC	2	6	169461	169466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213905
4000	NC_017249	GAC	2	6	169482	169487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213905

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