MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017249	CGG	2	6	130892	130897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213867
3002	NC_017249	GCGCC	2	10	130912	130921	0 %	0 %	40 %	60 %	384213867
3003	NC_017249	GC	3	6	130924	130929	0 %	0 %	50 %	50 %	384213867
3004	NC_017249	CGG	2	6	130930	130935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213867
3005	NC_017249	ACG	2	6	130956	130961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213867
3006	NC_017249	CATCG	2	10	131006	131015	20 %	20 %	20 %	40 %	384213867
3007	NC_017249	GCC	2	6	131021	131026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213867
3008	NC_017249	CGG	2	6	131027	131032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213867
3009	NC_017249	GGCG	2	8	131093	131100	0 %	0 %	75 %	25 %	384213867
3010	NC_017249	CAG	2	6	131105	131110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213867
3011	NC_017249	CGT	2	6	131115	131120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213867
3012	NC_017249	TCCCC	2	10	131134	131143	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3013	NC_017249	T	6	6	131206	131211	0 %	100 %	0 %	0 %	384213868
3014	NC_017249	GTG	2	6	131223	131228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213868
3015	NC_017249	GC	3	6	131267	131272	0 %	0 %	50 %	50 %	384213868
3016	NC_017249	CTT	2	6	131314	131319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213868
3017	NC_017249	TCA	2	6	131333	131338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213868
3018	NC_017249	AGC	2	6	131366	131371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213868
3019	NC_017249	CTC	2	6	131383	131388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213868
3020	NC_017249	GAT	3	9	131391	131399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213868
3021	NC_017249	CAC	2	6	131431	131436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213868
3022	NC_017249	GTG	2	6	131471	131476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213868
3023	NC_017249	CGC	2	6	131482	131487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213868
3024	NC_017249	TGT	2	6	131523	131528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213868
3025	NC_017249	TCTGA	2	10	131568	131577	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_017249	TCC	2	6	131633	131638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213869
3027	NC_017249	CG	3	6	131642	131647	0 %	0 %	50 %	50 %	384213869
3028	NC_017249	CAG	2	6	131668	131673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213869
3029	NC_017249	CGC	2	6	131674	131679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213869
3030	NC_017249	CGG	3	9	131685	131693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213869
3031	NC_017249	CGA	3	9	131721	131729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213869
3032	NC_017249	GCC	2	6	131752	131757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213869
3033	NC_017249	CG	3	6	131818	131823	0 %	0 %	50 %	50 %	384213869
3034	NC_017249	GTC	2	6	131839	131844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213869
3035	NC_017249	TTC	2	6	131918	131923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213869
3036	NC_017249	TCG	2	6	131951	131956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213869
3037	NC_017249	CCG	2	6	131960	131965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213869
3038	NC_017249	GC	3	6	132003	132008	0 %	0 %	50 %	50 %	384213869
3039	NC_017249	CCA	2	6	132060	132065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213869
3040	NC_017249	GCC	2	6	132070	132075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213869
3041	NC_017249	GAT	2	6	132078	132083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213869
3042	NC_017249	GC	3	6	132144	132149	0 %	0 %	50 %	50 %	384213869
3043	NC_017249	GAT	2	6	132163	132168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213869
3044	NC_017249	CGGC	2	8	132171	132178	0 %	0 %	50 %	50 %	384213869
3045	NC_017249	TTC	2	6	132234	132239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017249	GCCG	2	8	132265	132272	0 %	0 %	50 %	50 %	384213870
3047	NC_017249	GC	3	6	132283	132288	0 %	0 %	50 %	50 %	384213870
3048	NC_017249	CCTT	2	8	132289	132296	0 %	50 %	0 %	50 %	384213870
3049	NC_017249	CGC	2	6	132303	132308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213870
3050	NC_017249	GC	3	6	132307	132312	0 %	0 %	50 %	50 %	384213870
3051	NC_017249	TCG	2	6	132313	132318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213870
3052	NC_017249	GCG	2	6	132330	132335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213870
3053	NC_017249	ATC	2	6	132348	132353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213870
3054	NC_017249	GCG	2	6	132356	132361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213870
3055	NC_017249	AAG	2	6	132418	132423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213870
3056	NC_017249	TGGCC	2	10	132443	132452	0 %	20 %	40 %	40 %	384213870
3057	NC_017249	TCCGGC	2	12	132460	132471	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384213870
3058	NC_017249	GAT	2	6	132474	132479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213870
3059	NC_017249	CAC	3	9	132519	132527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213870
3060	NC_017249	GCC	2	6	132591	132596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213870
3061	NC_017249	GCA	2	6	132599	132604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213870
3062	NC_017249	GAGATA	2	12	132627	132638	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384213870
3063	NC_017249	CCGA	2	8	132654	132661	25 %	0 %	25 %	50 %	384213870
3064	NC_017249	CG	3	6	132687	132692	0 %	0 %	50 %	50 %	384213870
3065	NC_017249	CGGCG	2	10	132699	132708	0 %	0 %	60 %	40 %	384213870
3066	NC_017249	TTG	2	6	132742	132747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213870
3067	NC_017249	CGT	2	6	132782	132787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213870
3068	NC_017249	CGA	2	6	132800	132805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213870
3069	NC_017249	GC	3	6	132813	132818	0 %	0 %	50 %	50 %	384213870
3070	NC_017249	CCGA	2	8	132835	132842	25 %	0 %	25 %	50 %	384213870
3071	NC_017249	ATG	2	6	132874	132879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213870
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3073	NC_017249	GGC	2	6	132964	132969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213870
3074	NC_017249	CAT	2	6	133056	133061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213870
3075	NC_017249	CG	4	8	133094	133101	0 %	0 %	50 %	50 %	384213870
3076	NC_017249	GCC	2	6	133152	133157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213870
3077	NC_017249	AGC	2	6	133219	133224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213870
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3079	NC_017249	CTG	2	6	133274	133279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213870
3080	NC_017249	TGA	2	6	133282	133287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213870
3081	NC_017249	GGCC	2	8	133303	133310	0 %	0 %	50 %	50 %	384213870
3082	NC_017249	GCC	2	6	133317	133322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213870
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3084	NC_017249	CCG	2	6	133397	133402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213870
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3086	NC_017249	ACC	2	6	133441	133446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213870
3087	NC_017249	CGC	2	6	133484	133489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213870
3088	NC_017249	GCC	2	6	133496	133501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213870
3089	NC_017249	GAA	2	6	133554	133559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213870
3090	NC_017249	CG	4	8	133627	133634	0 %	0 %	50 %	50 %	384213870
3091	NC_017249	AGC	2	6	133750	133755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213870
3092	NC_017249	TCT	2	6	133775	133780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017249	AGAT	2	8	134118	134125	50 %	25 %	25 %	0 %	384213871
3094	NC_017249	GCT	2	6	134146	134151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213871
3095	NC_017249	GCGTT	2	10	134164	134173	0 %	40 %	40 %	20 %	384213871
3096	NC_017249	GTT	2	6	134213	134218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213871
3097	NC_017249	GCG	2	6	134235	134240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213871
3098	NC_017249	AGG	3	9	134278	134286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213871
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3101	NC_017249	CGA	3	9	134395	134403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213871
3102	NC_017249	GCG	2	6	134496	134501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213871
3103	NC_017249	CGC	2	6	134503	134508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213871
3104	NC_017249	CAGCG	2	10	134529	134538	20 %	0 %	40 %	40 %	384213871
3105	NC_017249	ATC	2	6	134595	134600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213871
3106	NC_017249	CGT	2	6	134614	134619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213871
3107	NC_017249	CGCC	2	8	134620	134627	0 %	0 %	25 %	75 %	384213871
3108	NC_017249	TCG	2	6	134661	134666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213871
3109	NC_017249	GCA	2	6	134686	134691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213871
3110	NC_017249	GAT	2	6	134693	134698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213871
3111	NC_017249	GC	3	6	134700	134705	0 %	0 %	50 %	50 %	384213871
3112	NC_017249	CGGCAG	2	12	134714	134725	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384213871
3113	NC_017249	GA	3	6	134739	134744	50 %	0 %	50 %	0 %	384213871
3114	NC_017249	GCA	2	6	134752	134757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213871
3115	NC_017249	GCC	2	6	134765	134770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213871
3116	NC_017249	CG	3	6	134781	134786	0 %	0 %	50 %	50 %	384213871
3117	NC_017249	CTT	2	6	134821	134826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213871
3118	NC_017249	GCG	2	6	134871	134876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213871
3119	NC_017249	ATG	2	6	134895	134900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213871
3120	NC_017249	CG	3	6	134951	134956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_017249	CGT	2	6	135126	135131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213872
3122	NC_017249	GCG	2	6	135132	135137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213872
3123	NC_017249	GCA	2	6	135150	135155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213872
3124	NC_017249	TCT	2	6	135161	135166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213872
3125	NC_017249	TGG	2	6	135195	135200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213872
3126	NC_017249	GC	4	8	135203	135210	0 %	0 %	50 %	50 %	384213872
3127	NC_017249	CGC	2	6	135236	135241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213872
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3135	NC_017249	AGC	2	6	135490	135495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213872
3136	NC_017249	GCA	3	9	135521	135529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213872
3137	NC_017249	GCCC	2	8	135560	135567	0 %	0 %	25 %	75 %	384213872
3138	NC_017249	CG	4	8	135572	135579	0 %	0 %	50 %	50 %	384213872
3139	NC_017249	GCA	2	6	135608	135613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213872
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3141	NC_017249	CAAG	2	8	135727	135734	50 %	0 %	25 %	25 %	384213872
3142	NC_017249	GAA	2	6	135740	135745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213872
3143	NC_017249	TGGA	2	8	135850	135857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_017249	CTT	3	9	135887	135895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213873
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3147	NC_017249	CTC	2	6	136096	136101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3148	NC_017249	CCG	2	6	136102	136107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3149	NC_017249	CGG	2	6	136156	136161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213874
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3155	NC_017249	CAG	2	6	136384	136389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213874
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3161	NC_017249	GCCG	2	8	136752	136759	0 %	0 %	50 %	50 %	384213874
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3172	NC_017249	CGA	2	6	137270	137275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3180	NC_017249	GCA	2	6	137513	137518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213875
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3211	NC_017249	CT	3	6	138302	138307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3212	NC_017249	GCTTC	2	10	138313	138322	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3213	NC_017249	ATGC	2	8	138350	138357	25 %	25 %	25 %	25 %	384213877
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3231	NC_017249	CTTC	2	8	138997	139004	0 %	50 %	0 %	50 %	384213877
3232	NC_017249	TGA	2	6	139021	139026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213877
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3234	NC_017249	TTGA	2	8	139140	139147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_017249	AGC	2	6	139160	139165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3237	NC_017249	ATC	2	6	139308	139313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3239	NC_017249	CG	3	6	139330	139335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3240	NC_017249	TCG	3	9	139403	139411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213878
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3242	NC_017249	AAG	2	6	139468	139473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213878
3243	NC_017249	CGA	2	6	139539	139544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213878
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3245	NC_017249	GCT	2	6	139584	139589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213878
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3372	NC_017249	CGA	2	6	144311	144316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3373	NC_017249	TTC	2	6	144383	144388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213883
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3490	NC_017249	CG	3	6	149065	149070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3491	NC_017249	GC	3	6	149075	149080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3492	NC_017249	GC	3	6	149092	149097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3493	NC_017249	GCC	2	6	149121	149126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3494	NC_017249	TGG	2	6	149205	149210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_017249	GAT	2	6	149281	149286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213888
3496	NC_017249	GCCA	2	8	149357	149364	25 %	0 %	25 %	50 %	384213888
3497	NC_017249	TTC	2	6	149402	149407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213888
3498	NC_017249	CGAC	2	8	149450	149457	25 %	0 %	25 %	50 %	384213888
3499	NC_017249	CG	4	8	149535	149542	0 %	0 %	50 %	50 %	384213888
3500	NC_017249	CGA	2	6	149586	149591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213888

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