MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_017249	GTG	2	6	925722	925727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23003	NC_017249	CCA	2	6	925897	925902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23004	NC_017249	CATC	2	8	925903	925910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23005	NC_017249	AGC	2	6	925937	925942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23006	NC_017249	TTCT	2	8	925963	925970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23007	NC_017249	TGG	2	6	926005	926010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23008	NC_017249	AGA	2	6	926065	926070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23009	NC_017249	AGT	3	9	926132	926140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23010	NC_017249	CAC	2	6	926141	926146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23011	NC_017249	CG	3	6	926307	926312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23012	NC_017249	GCG	2	6	926361	926366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23013	NC_017249	CG	3	6	926381	926386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23014	NC_017249	CTAATC	2	12	926387	926398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23015	NC_017249	TGGC	2	8	926417	926424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23016	NC_017249	GGT	2	6	926569	926574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23017	NC_017249	TAT	2	6	926582	926587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384214604
23018	NC_017249	TCCA	2	8	926632	926639	25 %	25 %	0 %	50 %	384214604
23019	NC_017249	TCA	2	6	926753	926758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214604
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23021	NC_017249	CCTCCA	2	12	926799	926810	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384214604
23022	NC_017249	ATC	2	6	926851	926856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23023	NC_017249	TCA	2	6	926930	926935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23024	NC_017249	CAC	2	6	927014	927019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23025	NC_017249	GCT	2	6	927232	927237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23027	NC_017249	GAA	2	6	927265	927270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23028	NC_017249	CGT	2	6	927309	927314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23029	NC_017249	GC	3	6	927331	927336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23030	NC_017249	CAA	2	6	927356	927361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23031	NC_017249	GCT	2	6	927375	927380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23032	NC_017249	GGGCT	2	10	927491	927500	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23033	NC_017249	GCA	2	6	927517	927522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23035	NC_017249	CG	4	8	927656	927663	0 %	0 %	50 %	50 %	384214605
23036	NC_017249	GCT	2	6	927827	927832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214605
23037	NC_017249	CGT	2	6	927844	927849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214605
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23039	NC_017249	CGA	2	6	927909	927914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23040	NC_017249	CTGC	2	8	927932	927939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23041	NC_017249	GCA	2	6	927953	927958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23042	NC_017249	GA	3	6	928013	928018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23046	NC_017249	ATT	2	6	928261	928266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23050	NC_017249	GGCT	2	8	928501	928508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23051	NC_017249	AGTC	2	8	928555	928562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23052	NC_017249	AG	3	6	928581	928586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23053	NC_017249	CAAT	2	8	928635	928642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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23056	NC_017249	GCC	2	6	928969	928974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23057	NC_017249	AGC	2	6	929126	929131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23059	NC_017249	TGA	2	6	929345	929350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23061	NC_017249	GCA	2	6	929364	929369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23062	NC_017249	GGAC	2	8	929406	929413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23063	NC_017249	TGG	2	6	929414	929419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23064	NC_017249	CGG	2	6	929446	929451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23065	NC_017249	GC	3	6	929482	929487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23066	NC_017249	AAG	2	6	929560	929565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23067	NC_017249	CGGTT	2	10	929646	929655	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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23069	NC_017249	AGT	2	6	929859	929864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23071	NC_017249	CATT	2	8	929954	929961	25 %	50 %	0 %	25 %	384214606
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23097	NC_017249	GTG	2	6	931556	931561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214607
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23099	NC_017249	GAA	2	6	931585	931590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214607
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23103	NC_017249	TGG	2	6	931898	931903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214607
23104	NC_017249	AGAGC	2	10	932080	932089	40 %	0 %	40 %	20 %	384214607
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23108	NC_017249	TTG	2	6	932417	932422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384214608
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23110	NC_017249	GAT	2	6	932465	932470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214608
23111	NC_017249	TACGG	2	10	932603	932612	20 %	20 %	40 %	20 %	384214608
23112	NC_017249	TGA	2	6	932673	932678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214608
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23114	NC_017249	CGG	2	6	932753	932758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214608
23115	NC_017249	GC	3	6	932778	932783	0 %	0 %	50 %	50 %	384214608
23116	NC_017249	AGC	2	6	932790	932795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214608
23117	NC_017249	CA	3	6	933039	933044	50 %	0 %	0 %	50 %	384214608
23118	NC_017249	TCA	2	6	933057	933062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214608
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23124	NC_017249	AGTC	2	8	933537	933544	25 %	25 %	25 %	25 %	384214609
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23161	NC_017249	GCG	2	6	935455	935460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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23252	NC_017249	CGT	2	6	939814	939819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214612
23253	NC_017249	GCC	2	6	939860	939865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214612
23254	NC_017249	GC	3	6	939905	939910	0 %	0 %	50 %	50 %	384214612
23255	NC_017249	CATC	2	8	939922	939929	25 %	25 %	0 %	50 %	384214612
23256	NC_017249	GAA	2	6	939938	939943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214612
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23258	NC_017249	GCG	2	6	940030	940035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214612
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23261	NC_017249	TCG	2	6	940176	940181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214612
23262	NC_017249	CG	3	6	940191	940196	0 %	0 %	50 %	50 %	384214612
23263	NC_017249	CTT	2	6	940208	940213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214612
23264	NC_017249	CAG	2	6	940247	940252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214612
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23270	NC_017249	GC	3	6	940443	940448	0 %	0 %	50 %	50 %	384214612
23271	NC_017249	CGC	3	9	940446	940454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214612
23272	NC_017249	CGA	2	6	940468	940473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214612
23273	NC_017249	TGA	2	6	940477	940482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214612
23274	NC_017249	GTC	3	9	940613	940621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214612
23275	NC_017249	GGC	3	9	940634	940642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214612
23276	NC_017249	CGA	2	6	940672	940677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214612
23277	NC_017249	CGG	2	6	940708	940713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214612
23278	NC_017249	CAG	2	6	940724	940729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214612
23279	NC_017249	GAT	2	6	940781	940786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214612
23280	NC_017249	TGG	2	6	940855	940860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214612
23281	NC_017249	TGA	2	6	940891	940896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214612
23282	NC_017249	CTG	2	6	940932	940937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214612
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23287	NC_017249	CGT	2	6	941062	941067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214612
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23289	NC_017249	CGT	2	6	941125	941130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214612
23290	NC_017249	TGT	2	6	941152	941157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384214612
23291	NC_017249	GAT	2	6	941234	941239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214612
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23298	NC_017249	GCG	2	6	941467	941472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214612
23299	NC_017249	GC	3	6	941516	941521	0 %	0 %	50 %	50 %	384214612
23300	NC_017249	GATC	2	8	941608	941615	25 %	25 %	25 %	25 %	384214612
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23302	NC_017249	GCC	2	6	941659	941664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214612
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23304	NC_017249	GAT	2	6	941690	941695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214612
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23306	NC_017249	GAG	2	6	941769	941774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214612
23307	NC_017249	TCG	2	6	941893	941898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214612
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23310	NC_017249	CG	3	6	942015	942020	0 %	0 %	50 %	50 %	384214612
23311	NC_017249	GCTCGC	2	12	942043	942054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384214612
23312	NC_017249	CGC	2	6	942130	942135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214612
23313	NC_017249	AGGAC	2	10	942150	942159	40 %	0 %	40 %	20 %	384214612
23314	NC_017249	CGC	2	6	942162	942167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214612
23315	NC_017249	GCC	2	6	942174	942179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214612
23316	NC_017249	TGA	2	6	942197	942202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214612
23317	NC_017249	CCCT	2	8	942242	942249	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23318	NC_017249	CGCTG	2	10	942387	942396	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23319	NC_017249	CAT	2	6	942397	942402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23320	NC_017249	CGCGCT	2	12	942422	942433	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384214613
23321	NC_017249	CGGC	2	8	942441	942448	0 %	0 %	50 %	50 %	384214613
23322	NC_017249	CGA	2	6	942463	942468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214613
23323	NC_017249	GAA	2	6	942479	942484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214613
23324	NC_017249	CAG	2	6	942503	942508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214613
23325	NC_017249	CAG	2	6	942518	942523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214613
23326	NC_017249	GCA	2	6	942550	942555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214613
23327	NC_017249	TCGC	2	8	942570	942577	0 %	25 %	25 %	50 %	384214613
23328	NC_017249	TGG	2	6	942634	942639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214613
23329	NC_017249	GAT	2	6	942644	942649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214613
23330	NC_017249	GCC	2	6	942671	942676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214613
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23332	NC_017249	GGC	2	6	942776	942781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214613
23333	NC_017249	GCG	2	6	942789	942794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214613
23334	NC_017249	ACG	2	6	942900	942905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214613
23335	NC_017249	ATC	2	6	942921	942926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214613
23336	NC_017249	GCA	2	6	943021	943026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214613
23337	NC_017249	CGTC	2	8	943047	943054	0 %	25 %	25 %	50 %	384214613
23338	NC_017249	CGC	2	6	943057	943062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214613
23339	NC_017249	AGA	2	6	943132	943137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214613
23340	NC_017249	CGCGAG	2	12	943169	943180	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384214613
23341	NC_017249	CGA	3	9	943201	943209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214613
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23343	NC_017249	AGG	2	6	943339	943344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214613
23344	NC_017249	CAGCG	2	10	943349	943358	20 %	0 %	40 %	40 %	384214613
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23347	NC_017249	CGG	2	6	943472	943477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214613
23348	NC_017249	CAT	2	6	943493	943498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214613
23349	NC_017249	CG	3	6	943521	943526	0 %	0 %	50 %	50 %	384214614
23350	NC_017249	CAG	2	6	943552	943557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214614
23351	NC_017249	GCC	2	6	943594	943599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214614
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23353	NC_017249	AGC	2	6	943638	943643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214614
23354	NC_017249	GCC	2	6	943660	943665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214614
23355	NC_017249	GAT	2	6	943666	943671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214614
23356	NC_017249	GAC	2	6	943672	943677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214614
23357	NC_017249	CGC	2	6	943749	943754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214614
23358	NC_017249	GGC	2	6	943800	943805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214614
23359	NC_017249	GAT	2	6	944008	944013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214614
23360	NC_017249	CGA	2	6	944049	944054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214614
23361	NC_017249	GCC	2	6	944059	944064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214614
23362	NC_017249	CGT	2	6	944065	944070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214614
23363	NC_017249	CGA	2	6	944124	944129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214614
23364	NC_017249	GC	3	6	944139	944144	0 %	0 %	50 %	50 %	384214614
23365	NC_017249	ATG	2	6	944336	944341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214614
23366	NC_017249	ATC	2	6	944345	944350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214614
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23368	NC_017249	CCA	2	6	944403	944408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214614
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23489	NC_017249	CG	3	6	948664	948669	0 %	0 %	50 %	50 %	384214618
23490	NC_017249	GCC	2	6	948684	948689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214618
23491	NC_017249	AGC	2	6	948731	948736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214618
23492	NC_017249	GAT	2	6	948753	948758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214618
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