MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017249	GAG	2	6	46072	46077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213779
1002	NC_017249	GC	3	6	46078	46083	0 %	0 %	50 %	50 %	384213779
1003	NC_017249	ACGT	2	8	46236	46243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_017249	C	6	6	46250	46255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1005	NC_017249	TCG	2	6	46257	46262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017249	TAC	2	6	46283	46288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017249	AACT	2	8	46297	46304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_017249	GCG	2	6	46416	46421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213780
1009	NC_017249	GCG	2	6	46449	46454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213780
1010	NC_017249	GCC	2	6	46500	46505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213780
1011	NC_017249	ACG	2	6	46562	46567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213780
1012	NC_017249	GCC	2	6	46579	46584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213780
1013	NC_017249	CGG	2	6	46679	46684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213780
1014	NC_017249	GC	3	6	46689	46694	0 %	0 %	50 %	50 %	384213780
1015	NC_017249	TCG	2	6	46702	46707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213780
1016	NC_017249	CGA	2	6	46778	46783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213780
1017	NC_017249	CGG	2	6	46833	46838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213780
1018	NC_017249	CGC	2	6	46983	46988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213781
1019	NC_017249	GC	3	6	46987	46992	0 %	0 %	50 %	50 %	384213781
1020	NC_017249	CGG	2	6	47021	47026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213781
1021	NC_017249	CGA	2	6	47039	47044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213781
1022	NC_017249	GTCT	2	8	47129	47136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_017249	CAC	2	6	47162	47167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017249	AGACC	2	10	47189	47198	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_017249	CCA	2	6	47288	47293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213782
1026	NC_017249	CG	4	8	47299	47306	0 %	0 %	50 %	50 %	384213782
1027	NC_017249	CG	3	6	47348	47353	0 %	0 %	50 %	50 %	384213782
1028	NC_017249	ACC	2	6	47380	47385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213782
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1030	NC_017249	CAA	2	6	47418	47423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213782
1031	NC_017249	GGC	2	6	47479	47484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213782
1032	NC_017249	GC	3	6	47498	47503	0 %	0 %	50 %	50 %	384213782
1033	NC_017249	ATCGC	2	10	47614	47623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1034	NC_017249	TTG	2	6	47734	47739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017249	AGG	2	6	47752	47757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017249	GAA	2	6	47792	47797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213783
1037	NC_017249	ACG	2	6	47946	47951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213783
1038	NC_017249	CGT	2	6	48010	48015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017249	ATCTG	2	10	48067	48076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_017249	GA	3	6	48254	48259	50 %	0 %	50 %	0 %	384213784
1041	NC_017249	GGCGC	2	10	48267	48276	0 %	0 %	60 %	40 %	384213784
1042	NC_017249	TGA	2	6	48377	48382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213784
1043	NC_017249	GC	3	6	48405	48410	0 %	0 %	50 %	50 %	384213784
1044	NC_017249	TCGTC	2	10	48453	48462	0 %	40 %	20 %	40 %	384213784
1045	NC_017249	TCG	2	6	48488	48493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213784
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1047	NC_017249	CCCG	2	8	48628	48635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1048	NC_017249	CGGG	2	8	48643	48650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_017249	GCCCTC	2	12	48711	48722	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384213785
1050	NC_017249	TCG	2	6	48769	48774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213785
1051	NC_017249	GGC	2	6	48822	48827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213785
1052	NC_017249	GA	3	6	48925	48930	50 %	0 %	50 %	0 %	384213785
1053	NC_017249	GTT	2	6	48954	48959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213785
1054	NC_017249	TCT	2	6	48965	48970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213785
1055	NC_017249	AGG	2	6	49099	49104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213786
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1057	NC_017249	GGC	2	6	49130	49135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213786
1058	NC_017249	GAA	2	6	49149	49154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213786
1059	NC_017249	CGC	2	6	49163	49168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213786
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1061	NC_017249	GA	3	6	49296	49301	50 %	0 %	50 %	0 %	384213786
1062	NC_017249	TGC	2	6	49321	49326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213786
1063	NC_017249	GACG	2	8	49345	49352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_017249	CG	3	6	49371	49376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_017249	GCA	2	6	49380	49385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017249	GAT	2	6	49477	49482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017249	TG	3	6	49510	49515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017249	CGC	2	6	49629	49634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_017249	AGG	2	6	49645	49650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017249	ATG	2	6	49662	49667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017249	GAGAA	2	10	49686	49695	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1075	NC_017249	GCC	2	6	49979	49984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213787
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1084	NC_017249	ATGAA	2	10	50426	50435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017249	CGGC	2	8	50451	50458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_017249	ACG	2	6	50467	50472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1100	NC_017249	GAG	2	6	51344	51349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213789
1101	NC_017249	CAG	2	6	51374	51379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213789
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1103	NC_017249	ATG	2	6	51413	51418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213789
1104	NC_017249	ATCG	2	8	51439	51446	25 %	25 %	25 %	25 %	384213789
1105	NC_017249	CCGG	2	8	51475	51482	0 %	0 %	50 %	50 %	384213789
1106	NC_017249	GCCC	2	8	51499	51506	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1108	NC_017249	TG	3	6	51830	51835	0 %	50 %	50 %	0 %	384213790
1109	NC_017249	GAA	2	6	51911	51916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213790
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1113	NC_017249	GGC	2	6	52140	52145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017249	GC	3	6	52191	52196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_017249	GGT	2	6	52197	52202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017249	AAG	2	6	52269	52274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213791
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1119	NC_017249	GCCGA	2	10	52392	52401	20 %	0 %	40 %	40 %	384213791
1120	NC_017249	GCA	2	6	52472	52477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213791
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1127	NC_017249	T	7	7	52679	52685	0 %	100 %	0 %	0 %	384213791
1128	NC_017249	TC	3	6	52755	52760	0 %	50 %	0 %	50 %	384213791
1129	NC_017249	GA	3	6	52765	52770	50 %	0 %	50 %	0 %	384213791
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1131	NC_017249	TGA	2	6	52889	52894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213791
1132	NC_017249	CGG	2	6	52989	52994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1251	NC_017249	AGCGC	2	10	57521	57530	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1252	NC_017249	GCG	2	6	57550	57555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_017249	CG	3	6	57641	57646	0 %	0 %	50 %	50 %	384213795
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1384	NC_017249	GCA	2	6	64102	64107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213802
1385	NC_017249	CGG	2	6	64123	64128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213802
1386	NC_017249	GTTC	2	8	64132	64139	0 %	50 %	25 %	25 %	384213802
1387	NC_017249	CCG	2	6	64140	64145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213802
1388	NC_017249	ATC	2	6	64154	64159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213802
1389	NC_017249	GCG	2	6	64163	64168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213802
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1392	NC_017249	GCC	2	6	64293	64298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213803
1393	NC_017249	CCG	2	6	64436	64441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213803
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1398	NC_017249	AGCG	2	8	64639	64646	25 %	0 %	50 %	25 %	384213803
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1409	NC_017249	CG	3	6	64877	64882	0 %	0 %	50 %	50 %	384213804
1410	NC_017249	GATC	2	8	64928	64935	25 %	25 %	25 %	25 %	384213804
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1415	NC_017249	CAGC	2	8	65131	65138	25 %	0 %	25 %	50 %	384213804
1416	NC_017249	GCCT	2	8	65189	65196	0 %	25 %	25 %	50 %	384213804
1417	NC_017249	CGAAG	2	10	65234	65243	40 %	0 %	40 %	20 %	384213804
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1419	NC_017249	GCT	2	6	65309	65314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213804
1420	NC_017249	GCT	2	6	65330	65335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213804
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1423	NC_017249	C	6	6	65408	65413	0 %	0 %	0 %	100 %	384213804
1424	NC_017249	CG	3	6	65498	65503	0 %	0 %	50 %	50 %	384213804
1425	NC_017249	CGA	2	6	65522	65527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213804
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1431	NC_017249	GC	3	6	65816	65821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1432	NC_017249	TCC	2	6	65842	65847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1433	NC_017249	CGC	2	6	65849	65854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1434	NC_017249	TGG	2	6	65865	65870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_017249	CT	3	6	65895	65900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1436	NC_017249	T	6	6	65934	65939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_017249	AGG	2	6	65941	65946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_017249	CCA	2	6	65947	65952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1439	NC_017249	TCA	2	6	65978	65983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1440	NC_017249	TCA	2	6	66118	66123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_017249	CAAC	2	8	66178	66185	50 %	0 %	0 %	50 %	384213805
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1472	NC_017249	TTG	2	6	67916	67921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1474	NC_017249	GCC	2	6	67932	67937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1475	NC_017249	GACCG	2	10	68119	68128	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1476	NC_017249	CAG	2	6	68159	68164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1477	NC_017249	ACA	2	6	68170	68175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1479	NC_017249	GAT	2	6	68369	68374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1481	NC_017249	CG	4	8	68482	68489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1482	NC_017249	GGCT	2	8	68536	68543	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1483	NC_017249	AG	3	6	68632	68637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1484	NC_017249	ATC	2	6	68641	68646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1495	NC_017249	GCA	2	6	69244	69249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1496	NC_017249	GGA	2	6	69312	69317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1497	NC_017249	GTC	2	6	69340	69345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_017249	GGAA	2	8	69353	69360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1499	NC_017249	ATT	2	6	69377	69382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_017249	TCG	2	6	69403	69408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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