MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017249	CAA	3	9	22969	22977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213751
502	NC_017249	CAG	2	6	23051	23056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213751
503	NC_017249	GCT	2	6	23091	23096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017249	GTT	2	6	23097	23102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017249	CCG	2	6	23117	23122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_017249	TGT	2	6	23158	23163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017249	AGGC	2	8	23248	23255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_017249	TCG	2	6	23259	23264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017249	GCG	2	6	23294	23299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017249	CTCGTG	2	12	23356	23367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017249	ACGA	2	8	23374	23381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_017249	TCAA	2	8	23385	23392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_017249	GAG	2	6	23414	23419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017249	CAT	2	6	23496	23501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017249	GCAAC	2	10	23539	23548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
516	NC_017249	ACG	2	6	23557	23562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017249	CAG	3	9	23570	23578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017249	TCG	2	6	23665	23670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017249	CAACC	2	10	23745	23754	40 %	0 %	0 %	60 %	384213752
520	NC_017249	CG	3	6	23769	23774	0 %	0 %	50 %	50 %	384213752
521	NC_017249	GCAA	2	8	23855	23862	50 %	0 %	25 %	25 %	384213752
522	NC_017249	GAT	2	6	23891	23896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213752
523	NC_017249	CGA	2	6	23932	23937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213752
524	NC_017249	CG	3	6	23965	23970	0 %	0 %	50 %	50 %	384213752
525	NC_017249	TGA	2	6	24044	24049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017249	CGTC	2	8	24083	24090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
527	NC_017249	CTT	2	6	24099	24104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017249	CTC	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_017249	CGC	2	6	24224	24229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_017249	AAC	2	6	24238	24243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017249	TTC	2	6	24268	24273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017249	GAC	2	6	24277	24282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017249	AGG	2	6	24285	24290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017249	CCG	2	6	24399	24404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_017249	GCC	2	6	24439	24444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_017249	CTAG	2	8	24506	24513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017249	AGT	2	6	24744	24749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213753
538	NC_017249	T	6	6	24774	24779	0 %	100 %	0 %	0 %	384213753
539	NC_017249	TGC	2	6	24848	24853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
540	NC_017249	AGC	2	6	24855	24860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213753
541	NC_017249	GAG	2	6	24914	24919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213753
542	NC_017249	CGT	2	6	24959	24964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
543	NC_017249	CGCC	2	8	25051	25058	0 %	0 %	25 %	75 %	384213753
544	NC_017249	GAA	2	6	25070	25075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213753
545	NC_017249	CAT	2	6	25091	25096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213753
546	NC_017249	GGC	2	6	25112	25117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213753
547	NC_017249	GCG	2	6	25122	25127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213753
548	NC_017249	CGA	2	6	25237	25242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213753
549	NC_017249	GAC	3	9	25259	25267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213753
550	NC_017249	GCTGG	2	10	25274	25283	0 %	20 %	60 %	20 %	384213753
551	NC_017249	CCT	2	6	25353	25358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213753
552	NC_017249	TCG	2	6	25438	25443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
553	NC_017249	TTGC	2	8	25455	25462	0 %	50 %	25 %	25 %	384213753
554	NC_017249	CGC	2	6	25521	25526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213753
555	NC_017249	GGCG	2	8	25538	25545	0 %	0 %	75 %	25 %	384213753
556	NC_017249	GGC	2	6	25565	25570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213753
557	NC_017249	TCG	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
558	NC_017249	AAT	2	6	25643	25648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384213753
559	NC_017249	CCAG	2	8	25672	25679	25 %	0 %	25 %	50 %	384213753
560	NC_017249	GCTT	2	8	25692	25699	0 %	50 %	25 %	25 %	384213753
561	NC_017249	ATTG	2	8	25807	25814	25 %	50 %	25 %	0 %	384213753
562	NC_017249	GCC	2	6	25850	25855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213753
563	NC_017249	TGG	2	6	25860	25865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213753
564	NC_017249	TTC	2	6	25910	25915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213753
565	NC_017249	GAA	2	6	25958	25963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213753
566	NC_017249	TCG	2	6	25980	25985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
567	NC_017249	CGCC	2	8	26105	26112	0 %	0 %	25 %	75 %	384213753
568	NC_017249	GT	3	6	26116	26121	0 %	50 %	50 %	0 %	384213753
569	NC_017249	ATC	2	6	26129	26134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213753
570	NC_017249	CGAA	2	8	26195	26202	50 %	0 %	25 %	25 %	384213753
571	NC_017249	TCC	2	6	26229	26234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213753
572	NC_017249	TC	3	6	26236	26241	0 %	50 %	0 %	50 %	384213753
573	NC_017249	ACC	2	6	26243	26248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_017249	AAG	2	6	26360	26365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213754
575	NC_017249	CGG	2	6	26427	26432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213754
576	NC_017249	TCCG	2	8	26512	26519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_017249	AGA	2	6	26529	26534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213755
578	NC_017249	CGA	3	9	26586	26594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213755
579	NC_017249	TAAGA	2	10	26607	26616	60 %	20 %	20 %	0 %	384213755
580	NC_017249	TCG	2	6	26621	26626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213755
581	NC_017249	CGGCT	2	10	26662	26671	0 %	20 %	40 %	40 %	384213755
582	NC_017249	CG	3	6	26675	26680	0 %	0 %	50 %	50 %	384213755
583	NC_017249	TGA	2	6	26730	26735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213755
584	NC_017249	GGAT	2	8	26741	26748	25 %	25 %	50 %	0 %	384213755
585	NC_017249	CGG	2	6	26772	26777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213755
586	NC_017249	CGAC	2	8	26865	26872	25 %	0 %	25 %	50 %	384213755
587	NC_017249	CCGC	2	8	26894	26901	0 %	0 %	25 %	75 %	384213755
588	NC_017249	GCG	2	6	26902	26907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213755
589	NC_017249	TCT	2	6	26967	26972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213755
590	NC_017249	TTG	2	6	27026	27031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213755
591	NC_017249	CAG	2	6	27208	27213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213755
592	NC_017249	GC	3	6	27214	27219	0 %	0 %	50 %	50 %	384213755
593	NC_017249	CCG	2	6	27245	27250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213755
594	NC_017249	CAC	2	6	27411	27416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_017249	ATC	2	6	27452	27457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017249	CCG	2	6	27542	27547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_017249	ATT	2	6	27571	27576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017249	TCC	2	6	27634	27639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_017249	GAGCG	2	10	27667	27676	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
600	NC_017249	GC	3	6	27785	27790	0 %	0 %	50 %	50 %	384213756
601	NC_017249	GA	3	6	27952	27957	50 %	0 %	50 %	0 %	384213756
602	NC_017249	CGT	2	6	28010	28015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017249	TCA	2	6	28181	28186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017249	CCG	2	6	28201	28206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_017249	GCA	2	6	28234	28239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017249	CGG	2	6	28307	28312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017249	CAA	2	6	28444	28449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017249	CG	3	6	28489	28494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017249	AGG	2	6	28511	28516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017249	GCA	2	6	28672	28677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213757
611	NC_017249	CTA	2	6	28788	28793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213757
612	NC_017249	ATG	2	6	28820	28825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213757
613	NC_017249	A	6	6	28863	28868	100 %	0 %	0 %	0 %	384213757
614	NC_017249	CTG	2	6	28942	28947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213757
615	NC_017249	GCC	2	6	29037	29042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213757
616	NC_017249	CAT	2	6	29043	29048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213757
617	NC_017249	GCGAC	2	10	29106	29115	20 %	0 %	40 %	40 %	384213757
618	NC_017249	GAA	2	6	29125	29130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213757
619	NC_017249	GAG	2	6	29230	29235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213757
620	NC_017249	GGA	2	6	29271	29276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213757
621	NC_017249	GAT	2	6	29293	29298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213757
622	NC_017249	CGA	2	6	29299	29304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213757
623	NC_017249	GAA	2	6	29309	29314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213757
624	NC_017249	TGC	2	6	29332	29337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017249	ACA	2	6	29441	29446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213758
626	NC_017249	GAA	2	6	29466	29471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213758
627	NC_017249	ATG	2	6	29497	29502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213758
628	NC_017249	CAT	2	6	29516	29521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213758
629	NC_017249	ACG	2	6	29533	29538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213758
630	NC_017249	CTG	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213758
631	NC_017249	CGCC	2	8	29641	29648	0 %	0 %	25 %	75 %	384213758
632	NC_017249	TGA	2	6	29719	29724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017249	GCGCG	2	10	29756	29765	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
634	NC_017249	TTG	2	6	29800	29805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213759
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636	NC_017249	G	7	7	29998	30004	0 %	0 %	100 %	0 %	384213759
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642	NC_017249	GGC	2	6	30227	30232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213759
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759	NC_017249	ATA	2	6	36302	36307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_017249	GAA	2	6	36382	36387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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