MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017249	CGC	2	6	227939	227944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213959
5503	NC_017249	CGG	2	6	227963	227968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213959
5504	NC_017249	GCC	2	6	227996	228001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213959
5505	NC_017249	CGG	2	6	228053	228058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213959
5506	NC_017249	GTT	2	6	228068	228073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213959
5507	NC_017249	CGGCG	2	10	228086	228095	0 %	0 %	60 %	40 %	384213959
5508	NC_017249	CTTC	2	8	228104	228111	0 %	50 %	0 %	50 %	384213959
5509	NC_017249	GGC	2	6	228125	228130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213959
5510	NC_017249	CGT	2	6	228167	228172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213959
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5512	NC_017249	GCG	2	6	228199	228204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213959
5513	NC_017249	TCG	2	6	228208	228213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213959
5514	NC_017249	TCGCC	2	10	228233	228242	0 %	20 %	20 %	60 %	384213959
5515	NC_017249	GCGCG	2	10	228255	228264	0 %	0 %	60 %	40 %	384213959
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5519	NC_017249	ATC	2	6	228462	228467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213959
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5521	NC_017249	CCGG	2	8	228532	228539	0 %	0 %	50 %	50 %	384213959
5522	NC_017249	CGC	2	6	228665	228670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213959
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5524	NC_017249	CGC	2	6	228859	228864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213959
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5528	NC_017249	GCT	2	6	228929	228934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213959
5529	NC_017249	ATCG	2	8	228938	228945	25 %	25 %	25 %	25 %	384213959
5530	NC_017249	ATC	3	9	228963	228971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213959
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5555	NC_017249	GAGG	2	8	229965	229972	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5561	NC_017249	TCG	2	6	230422	230427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213961
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5564	NC_017249	CGT	2	6	230579	230584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213961
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5570	NC_017249	CCCG	2	8	230899	230906	0 %	0 %	25 %	75 %	384213961
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5572	NC_017249	GAT	2	6	231011	231016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5583	NC_017249	ATG	2	6	231389	231394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213962
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5588	NC_017249	TCCC	2	8	231499	231506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5589	NC_017249	CGTTC	2	10	231530	231539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5590	NC_017249	GCAA	2	8	231547	231554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5591	NC_017249	GCC	2	6	231556	231561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_017249	CAGG	2	8	231578	231585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5593	NC_017249	GCGCG	2	10	231634	231643	0 %	0 %	60 %	40 %	384213963
5594	NC_017249	GCG	2	6	231649	231654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213963
5595	NC_017249	CGGC	2	8	231665	231672	0 %	0 %	50 %	50 %	384213963
5596	NC_017249	GCCC	2	8	231681	231688	0 %	0 %	25 %	75 %	384213963
5597	NC_017249	CG	3	6	231693	231698	0 %	0 %	50 %	50 %	384213963
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5601	NC_017249	CG	3	6	231780	231785	0 %	0 %	50 %	50 %	384213963
5602	NC_017249	GC	4	8	231842	231849	0 %	0 %	50 %	50 %	384213963
5603	NC_017249	GCT	2	6	232017	232022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213963
5604	NC_017249	TGC	2	6	232095	232100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213963
5605	NC_017249	GCCG	2	8	232114	232121	0 %	0 %	50 %	50 %	384213963
5606	NC_017249	TCG	2	6	232130	232135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213963
5607	NC_017249	GCG	3	9	232147	232155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213963
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5609	NC_017249	GGC	2	6	232311	232316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213963
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5611	NC_017249	TCG	2	6	232346	232351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213963
5612	NC_017249	TGA	2	6	232388	232393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213963
5613	NC_017249	GCC	2	6	232396	232401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213963
5614	NC_017249	GCC	2	6	232419	232424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213963
5615	NC_017249	A	6	6	232500	232505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_017249	GCTGC	2	10	232660	232669	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5617	NC_017249	CAA	2	6	232721	232726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_017249	TTG	2	6	232800	232805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017249	CGA	2	6	232817	232822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_017249	GC	3	6	232849	232854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_017249	GA	3	6	232864	232869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017249	TCA	2	6	232882	232887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_017249	AGC	2	6	232966	232971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213964
5624	NC_017249	CAATAA	2	12	232985	232996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384213964
5625	NC_017249	CAA	4	12	232997	233008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213964
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5627	NC_017249	GC	3	6	233121	233126	0 %	0 %	50 %	50 %	384213964
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5867	NC_017249	GCG	2	6	241745	241750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213974
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5970	NC_017249	GCAAG	2	10	245723	245732	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5985	NC_017249	GCC	2	6	246330	246335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213979
5986	NC_017249	TGT	3	9	246413	246421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213979
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