MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017249	GC	3	6	188882	188887	0 %	0 %	50 %	50 %	384213922
4502	NC_017249	TCG	2	6	188948	188953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213922
4503	NC_017249	AGG	2	6	188954	188959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213922
4504	NC_017249	GAC	2	6	189010	189015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213922
4505	NC_017249	GCC	2	6	189024	189029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213922
4506	NC_017249	CCA	2	6	189071	189076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213922
4507	NC_017249	CGC	2	6	189078	189083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213922
4508	NC_017249	GC	3	6	189092	189097	0 %	0 %	50 %	50 %	384213922
4509	NC_017249	TGC	2	6	189158	189163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213922
4510	NC_017249	GCG	2	6	189176	189181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213922
4511	NC_017249	CAT	2	6	189240	189245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213922
4512	NC_017249	ACC	2	6	189340	189345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213923
4513	NC_017249	TGA	2	6	189368	189373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213923
4514	NC_017249	CGC	2	6	189404	189409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213923
4515	NC_017249	GTG	2	6	189423	189428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213923
4516	NC_017249	TCA	2	6	189521	189526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213923
4517	NC_017249	CTT	2	6	189645	189650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213923
4518	NC_017249	GCC	2	6	189651	189656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213923
4519	NC_017249	GC	3	6	189711	189716	0 %	0 %	50 %	50 %	384213923
4520	NC_017249	CGGCAT	2	12	189719	189730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384213923
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4522	NC_017249	GC	3	6	189833	189838	0 %	0 %	50 %	50 %	384213923
4523	NC_017249	CG	3	6	189881	189886	0 %	0 %	50 %	50 %	384213923
4524	NC_017249	GCT	2	6	189899	189904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213923
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4526	NC_017249	TGA	2	6	189942	189947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213923
4527	NC_017249	ATCG	2	8	189948	189955	25 %	25 %	25 %	25 %	384213923
4528	NC_017249	TGAC	2	8	189959	189966	25 %	25 %	25 %	25 %	384213923
4529	NC_017249	GCC	2	6	190060	190065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_017249	GGC	2	6	190069	190074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_017249	GC	3	6	190099	190104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_017249	CAA	2	6	190141	190146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213924
4533	NC_017249	GTC	2	6	190181	190186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213924
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4535	NC_017249	AC	3	6	190238	190243	50 %	0 %	0 %	50 %	384213924
4536	NC_017249	GCTG	2	8	190318	190325	0 %	25 %	50 %	25 %	384213924
4537	NC_017249	GTC	2	6	190390	190395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_017249	CGG	2	6	190429	190434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_017249	ACG	2	6	190525	190530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213925
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4541	NC_017249	GC	3	6	190679	190684	0 %	0 %	50 %	50 %	384213925
4542	NC_017249	CGT	2	6	190709	190714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213925
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4544	NC_017249	TCG	2	6	190836	190841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213925
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4552	NC_017249	CG	3	6	191045	191050	0 %	0 %	50 %	50 %	384213925
4553	NC_017249	GC	3	6	191055	191060	0 %	0 %	50 %	50 %	384213925
4554	NC_017249	GAT	2	6	191087	191092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213925
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4557	NC_017249	ATC	4	12	191184	191195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213925
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4560	NC_017249	CCGCG	2	10	191308	191317	0 %	0 %	40 %	60 %	384213925
4561	NC_017249	TCGG	2	8	191325	191332	0 %	25 %	50 %	25 %	384213925
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4565	NC_017249	GCA	2	6	191500	191505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213925
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4585	NC_017249	CG	4	8	192096	192103	0 %	0 %	50 %	50 %	384213926
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4589	NC_017249	CG	3	6	192279	192284	0 %	0 %	50 %	50 %	384213926
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4604	NC_017249	TCGG	2	8	192812	192819	0 %	25 %	50 %	25 %	384213926
4605	NC_017249	ACGC	2	8	192865	192872	25 %	0 %	25 %	50 %	384213926
4606	NC_017249	GC	3	6	192883	192888	0 %	0 %	50 %	50 %	384213926
4607	NC_017249	CGAG	2	8	192900	192907	25 %	0 %	50 %	25 %	384213926
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4612	NC_017249	CGA	2	6	193085	193090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213927
4613	NC_017249	CG	3	6	193109	193114	0 %	0 %	50 %	50 %	384213927
4614	NC_017249	CGG	2	6	193190	193195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213927
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4616	NC_017249	CGGCG	2	10	193214	193223	0 %	0 %	60 %	40 %	384213927
4617	NC_017249	ATG	2	6	193237	193242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213927
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4620	NC_017249	CGATCT	2	12	193448	193459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384213927
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4622	NC_017249	GCG	2	6	193503	193508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213927
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4685	NC_017249	GCT	2	6	196635	196640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213931
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4721	NC_017249	CGC	3	9	197967	197975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213931
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4725	NC_017249	GTC	2	6	198096	198101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213931
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4727	NC_017249	CGAGGT	2	12	198353	198364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384213932
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4732	NC_017249	CAA	2	6	198468	198473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213932
4733	NC_017249	CG	3	6	198495	198500	0 %	0 %	50 %	50 %	384213932
4734	NC_017249	CGC	2	6	198524	198529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213932
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4737	NC_017249	GCGA	2	8	198619	198626	25 %	0 %	50 %	25 %	384213932
4738	NC_017249	GC	3	6	198657	198662	0 %	0 %	50 %	50 %	384213932
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4740	NC_017249	CG	3	6	198720	198725	0 %	0 %	50 %	50 %	384213932
4741	NC_017249	CGTC	2	8	198739	198746	0 %	25 %	25 %	50 %	384213932
4742	NC_017249	CGA	2	6	198782	198787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213932
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4863	NC_017249	TCG	2	6	203181	203186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4864	NC_017249	CGT	2	6	203197	203202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4865	NC_017249	GCA	4	12	203205	203216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4866	NC_017249	TGT	2	6	203304	203309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213937
4867	NC_017249	AGC	2	6	203324	203329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4868	NC_017249	GTC	2	6	203342	203347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4869	NC_017249	CAT	2	6	203446	203451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213937
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4871	NC_017249	GCC	2	6	203561	203566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213937
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4873	NC_017249	GCT	2	6	203604	203609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
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4875	NC_017249	CTC	2	6	203674	203679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213937
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4883	NC_017249	GCCGGA	2	12	203938	203949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384213937
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4888	NC_017249	TCA	2	6	204144	204149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213937
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4891	NC_017249	TCGA	2	8	204350	204357	25 %	25 %	25 %	25 %	384213937
4892	NC_017249	CATCGG	2	12	204387	204398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4893	NC_017249	AAG	2	6	204430	204435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213937
4894	NC_017249	GC	3	6	204499	204504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4895	NC_017249	CG	3	6	204522	204527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4896	NC_017249	CTG	2	6	204536	204541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4897	NC_017249	TAT	2	6	204576	204581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4898	NC_017249	GCA	2	6	204608	204613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4901	NC_017249	CCG	2	6	204717	204722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213938
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4939	NC_017249	GCA	2	6	205928	205933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4952	NC_017249	AC	4	8	206475	206482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4953	NC_017249	GC	3	6	206505	206510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4954	NC_017249	ATT	2	6	206516	206521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4977	NC_017249	CCGAA	2	10	207561	207570	40 %	0 %	20 %	40 %	384213940
4978	NC_017249	GAA	2	6	207601	207606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213940
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4983	NC_017249	TCT	2	6	207825	207830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213940
4984	NC_017249	CTG	2	6	207868	207873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213940
4985	NC_017249	GCC	2	6	207892	207897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213940
4986	NC_017249	CGGC	2	8	207917	207924	0 %	0 %	50 %	50 %	384213940
4987	NC_017249	TGG	2	6	207930	207935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213940
4988	NC_017249	CGA	2	6	207969	207974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213940
4989	NC_017249	GC	3	6	207997	208002	0 %	0 %	50 %	50 %	384213940
4990	NC_017249	CTT	2	6	208105	208110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213940
4991	NC_017249	TCGA	2	8	208139	208146	25 %	25 %	25 %	25 %	384213940
4992	NC_017249	GC	3	6	208184	208189	0 %	0 %	50 %	50 %	384213940
4993	NC_017249	TCG	2	6	208241	208246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213940
4994	NC_017249	TCG	2	6	208319	208324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213940
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5000	NC_017249	CCTCGC	2	12	208521	208532	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384213940

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