MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017243	AAC	2	6	109727	109732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207614
3503	NC_017243	TCA	2	6	109737	109742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207614
3504	NC_017243	T	8	8	109746	109753	0 %	100 %	0 %	0 %	384207614
3505	NC_017243	T	8	8	109792	109799	0 %	100 %	0 %	0 %	384207614
3506	NC_017243	ATT	2	6	109842	109847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207614
3507	NC_017243	TAAA	2	8	109884	109891	75 %	25 %	0 %	0 %	384207614
3508	NC_017243	AAT	2	6	109915	109920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207614
3509	NC_017243	AAT	2	6	109938	109943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207614
3510	NC_017243	ATA	2	6	109951	109956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207614
3511	NC_017243	TGA	2	6	109963	109968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207614
3512	NC_017243	ATA	2	6	109977	109982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207614
3513	NC_017243	TTTAAA	2	12	110073	110084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017243	GGGT	2	8	110093	110100	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017243	A	7	7	110104	110110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017243	A	6	6	110133	110138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017243	AT	3	6	110186	110191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017243	A	6	6	110219	110224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017243	T	8	8	110225	110232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017243	TTTA	2	8	110236	110243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017243	TA	4	8	110283	110290	50 %	50 %	0 %	0 %	384207615
3522	NC_017243	AAT	2	6	110356	110361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207615
3523	NC_017243	AT	3	6	110360	110365	50 %	50 %	0 %	0 %	384207615
3524	NC_017243	AGC	2	6	110433	110438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207615
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3526	NC_017243	TAA	2	6	110461	110466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207615
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3529	NC_017243	TTAAA	2	10	110516	110525	60 %	40 %	0 %	0 %	384207615
3530	NC_017243	A	6	6	110566	110571	100 %	0 %	0 %	0 %	384207615
3531	NC_017243	T	6	6	110586	110591	0 %	100 %	0 %	0 %	384207615
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3535	NC_017243	TAAG	2	8	110999	111006	50 %	25 %	25 %	0 %	384207615
3536	NC_017243	ATTGC	2	10	111008	111017	20 %	40 %	20 %	20 %	384207615
3537	NC_017243	AAT	2	6	111038	111043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207615
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3540	NC_017243	GAA	2	6	111128	111133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207615
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3542	NC_017243	ATA	2	6	111203	111208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207615
3543	NC_017243	TAA	2	6	111221	111226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207615
3544	NC_017243	A	6	6	111225	111230	100 %	0 %	0 %	0 %	384207615
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3547	NC_017243	ATTT	2	8	111335	111342	25 %	75 %	0 %	0 %	384207615
3548	NC_017243	T	6	6	111367	111372	0 %	100 %	0 %	0 %	384207615
3549	NC_017243	TAA	2	6	111433	111438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207615
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3553	NC_017243	ATT	3	9	111549	111557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207615
3554	NC_017243	TAT	2	6	111575	111580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207615
3555	NC_017243	TAT	2	6	111614	111619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207615
3556	NC_017243	AT	3	6	111631	111636	50 %	50 %	0 %	0 %	384207615
3557	NC_017243	TAT	3	9	111647	111655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207615
3558	NC_017243	TAT	3	9	111707	111715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207615
3559	NC_017243	TAA	2	6	111762	111767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207615
3560	NC_017243	TA	3	6	111792	111797	50 %	50 %	0 %	0 %	384207615
3561	NC_017243	T	7	7	111896	111902	0 %	100 %	0 %	0 %	384207615
3562	NC_017243	TA	3	6	111924	111929	50 %	50 %	0 %	0 %	384207615
3563	NC_017243	TCC	2	6	111939	111944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207615
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3568	NC_017243	TA	3	6	112104	112109	50 %	50 %	0 %	0 %	384207615
3569	NC_017243	TAA	2	6	112142	112147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207615
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3572	NC_017243	ATCT	2	8	112355	112362	25 %	50 %	0 %	25 %	384207615
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3583	NC_017243	AT	4	8	112851	112858	50 %	50 %	0 %	0 %	384207615
3584	NC_017243	CTG	2	6	112883	112888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207615
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3588	NC_017243	TA	3	6	112973	112978	50 %	50 %	0 %	0 %	384207615
3589	NC_017243	A	6	6	113007	113012	100 %	0 %	0 %	0 %	384207615
3590	NC_017243	A	7	7	113014	113020	100 %	0 %	0 %	0 %	384207615
3591	NC_017243	ATAA	2	8	113029	113036	75 %	25 %	0 %	0 %	384207615
3592	NC_017243	TAT	2	6	113046	113051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_017243	A	7	7	113101	113107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017243	AATA	2	8	113111	113118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017243	CAT	2	6	113145	113150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3597	NC_017243	ATT	2	6	113193	113198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207616
3598	NC_017243	AT	3	6	113221	113226	50 %	50 %	0 %	0 %	384207616
3599	NC_017243	TCA	2	6	113295	113300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207616
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3602	NC_017243	TA	3	6	113410	113415	50 %	50 %	0 %	0 %	384207616
3603	NC_017243	TCT	2	6	113423	113428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207616
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3605	NC_017243	AAAAG	2	10	113480	113489	80 %	0 %	20 %	0 %	384207616
3606	NC_017243	CTA	2	6	113494	113499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207616
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3608	NC_017243	T	8	8	113560	113567	0 %	100 %	0 %	0 %	384207616
3609	NC_017243	ATT	2	6	113574	113579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207616
3610	NC_017243	ATT	2	6	113591	113596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017243	T	6	6	113595	113600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017243	T	6	6	113638	113643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017243	ATAA	2	8	113644	113651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017243	TAT	2	6	113667	113672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017243	T	6	6	113681	113686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017243	TACG	2	8	113692	113699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3617	NC_017243	ATA	2	6	113710	113715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017243	ATTT	2	8	113734	113741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017243	T	7	7	113739	113745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017243	ATT	2	6	113746	113751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017243	AT	3	6	113754	113759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017243	ATTT	2	8	113763	113770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017243	A	7	7	113798	113804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017243	TGGG	2	8	113807	113814	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017243	ATTTT	2	10	113824	113833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017243	TAA	2	6	113836	113841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017243	T	7	7	113942	113948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017243	TTAA	2	8	114035	114042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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