MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3005	NC_017243	AT	4	8	95571	95578	50 %	50 %	0 %	0 %	384207604
3006	NC_017243	TAT	2	6	95593	95598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207604
3007	NC_017243	ATT	2	6	95602	95607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207604
3008	NC_017243	T	7	7	95611	95617	0 %	100 %	0 %	0 %	384207604
3009	NC_017243	TA	3	6	95626	95631	50 %	50 %	0 %	0 %	384207604
3010	NC_017243	ATA	2	6	95657	95662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207604
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3012	NC_017243	TA	3	6	95752	95757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017243	TAT	2	6	95773	95778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017243	AATT	2	8	95791	95798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017243	AT	3	6	95805	95810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017243	T	6	6	95829	95834	0 %	100 %	0 %	0 %	384207605
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3021	NC_017243	ATA	2	6	96001	96006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207605
3022	NC_017243	AGA	2	6	96068	96073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207605
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3033	NC_017243	AT	3	6	96422	96427	50 %	50 %	0 %	0 %	384207605
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3039	NC_017243	T	6	6	96629	96634	0 %	100 %	0 %	0 %	384207605
3040	NC_017243	ATTT	2	8	96651	96658	25 %	75 %	0 %	0 %	384207605
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3059	NC_017243	AAAG	2	8	97029	97036	75 %	0 %	25 %	0 %	384207605
3060	NC_017243	AATA	2	8	97049	97056	75 %	25 %	0 %	0 %	384207605
3061	NC_017243	AAC	2	6	97061	97066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207605
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3074	NC_017243	A	6	6	97348	97353	100 %	0 %	0 %	0 %	384207605
3075	NC_017243	TAT	2	6	97404	97409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207605
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3077	NC_017243	TTAT	2	8	97429	97436	25 %	75 %	0 %	0 %	384207605
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3085	NC_017243	A	6	6	97587	97592	100 %	0 %	0 %	0 %	384207605
3086	NC_017243	GAAAT	2	10	97603	97612	60 %	20 %	20 %	0 %	384207605
3087	NC_017243	ATA	2	6	97668	97673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207605
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3090	NC_017243	TA	3	6	97771	97776	50 %	50 %	0 %	0 %	384207605
3091	NC_017243	TA	3	6	97782	97787	50 %	50 %	0 %	0 %	384207605
3092	NC_017243	TGA	2	6	97796	97801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207605
3093	NC_017243	TA	3	6	97812	97817	50 %	50 %	0 %	0 %	384207605
3094	NC_017243	ATA	3	9	97824	97832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207605
3095	NC_017243	AT	3	6	97868	97873	50 %	50 %	0 %	0 %	384207605
3096	NC_017243	A	6	6	97892	97897	100 %	0 %	0 %	0 %	384207605
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3099	NC_017243	AT	3	6	97971	97976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017243	A	6	6	97977	97982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3103	NC_017243	TTC	2	6	98141	98146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207606
3104	NC_017243	TTAC	2	8	98155	98162	25 %	50 %	0 %	25 %	384207606
3105	NC_017243	TCC	2	6	98196	98201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207606
3106	NC_017243	TGT	2	6	98220	98225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207606
3107	NC_017243	GAG	2	6	98249	98254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207606
3108	NC_017243	TGA	2	6	98286	98291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207606
3109	NC_017243	TGA	2	6	98319	98324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207606
3110	NC_017243	CCT	2	6	98371	98376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207606
3111	NC_017243	ATT	2	6	98484	98489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017243	TAA	2	6	98541	98546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017243	TTTCTT	2	12	98564	98575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3114	NC_017243	TCT	2	6	98584	98589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017243	T	6	6	98604	98609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017243	CTT	2	6	98618	98623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017243	T	6	6	98622	98627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017243	CTAATT	2	12	98671	98682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3119	NC_017243	TCA	2	6	98718	98723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_017243	TCT	2	6	98724	98729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_017243	T	6	6	98732	98737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017243	ATC	2	6	98762	98767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017243	T	6	6	98784	98789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017243	CTT	2	6	98791	98796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017243	A	6	6	98831	98836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017243	TA	4	8	98863	98870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017243	CCGT	2	8	98901	98908	0 %	25 %	25 %	50 %	384207607
3128	NC_017243	T	6	6	98913	98918	0 %	100 %	0 %	0 %	384207607
3129	NC_017243	TCA	2	6	98940	98945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207607
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3131	NC_017243	GAT	3	9	98958	98966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207607
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